Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YPG1

Protein Details
Accession W6YPG1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-133SGTEQKKWKQGRKRPQEDAFDHydrophilic
158-178RIKHSRDTGLRPKNQRKIAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
168-181RPKNQRKIAKAIRR
Subcellular Location(s) mito 21.5, cyto_mito 12.5, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001648  Ribosomal_S18  
IPR036870  Ribosomal_S18_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG bze:COCCADRAFT_26357  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01084  Ribosomal_S18  
Amino Acid Sequences MSVMRISLRSTLAVARTGMRCFSSGPQKQDDLMSILGQSAAARHPANISSTNNTANSRPGESAALRFARNVGLDRAASSPNRELAESERLSQYQRQIYRKWQPGDVYAPHDLSGTEQKKWKQGRKRPQEDAFDVLGVNPVLEYKNFTIMSEYMTEMGRIKHSRDTGLRPKNQRKIAKAIRRAVGLGLMPSVHRHPLVLKKSNPARFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.24
4 0.24
5 0.24
6 0.22
7 0.21
8 0.21
9 0.26
10 0.32
11 0.36
12 0.4
13 0.43
14 0.43
15 0.43
16 0.43
17 0.38
18 0.3
19 0.25
20 0.2
21 0.15
22 0.14
23 0.12
24 0.11
25 0.09
26 0.07
27 0.07
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.12
32 0.13
33 0.16
34 0.19
35 0.21
36 0.22
37 0.24
38 0.26
39 0.27
40 0.28
41 0.26
42 0.26
43 0.25
44 0.23
45 0.21
46 0.2
47 0.2
48 0.19
49 0.2
50 0.21
51 0.21
52 0.19
53 0.18
54 0.18
55 0.16
56 0.17
57 0.17
58 0.13
59 0.13
60 0.13
61 0.14
62 0.15
63 0.16
64 0.15
65 0.16
66 0.16
67 0.17
68 0.18
69 0.16
70 0.16
71 0.17
72 0.24
73 0.22
74 0.22
75 0.2
76 0.2
77 0.21
78 0.23
79 0.24
80 0.23
81 0.28
82 0.3
83 0.32
84 0.4
85 0.47
86 0.53
87 0.5
88 0.46
89 0.41
90 0.4
91 0.42
92 0.36
93 0.31
94 0.24
95 0.23
96 0.2
97 0.19
98 0.16
99 0.13
100 0.2
101 0.18
102 0.19
103 0.23
104 0.25
105 0.33
106 0.4
107 0.47
108 0.48
109 0.57
110 0.66
111 0.73
112 0.8
113 0.81
114 0.8
115 0.79
116 0.71
117 0.65
118 0.55
119 0.44
120 0.35
121 0.26
122 0.2
123 0.13
124 0.1
125 0.06
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.09
130 0.08
131 0.15
132 0.15
133 0.15
134 0.17
135 0.17
136 0.19
137 0.17
138 0.16
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.11
143 0.12
144 0.16
145 0.17
146 0.19
147 0.24
148 0.25
149 0.31
150 0.34
151 0.42
152 0.47
153 0.55
154 0.61
155 0.65
156 0.74
157 0.77
158 0.82
159 0.81
160 0.76
161 0.77
162 0.79
163 0.79
164 0.78
165 0.77
166 0.72
167 0.65
168 0.61
169 0.5
170 0.43
171 0.33
172 0.25
173 0.18
174 0.14
175 0.12
176 0.15
177 0.16
178 0.16
179 0.15
180 0.15
181 0.21
182 0.3
183 0.39
184 0.45
185 0.47
186 0.54
187 0.63