Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YPT2

Protein Details
Accession W6YPT2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
392-412RSEYRQRSPPRRQPSPPRATAHydrophilic
626-646NAAQHKFRKHDRGNANDPRHVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
375-405RGERGRSRGKQKGGRNDRSEYRQRSPPRRQP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.833, nucl 10, cyto 9.5, cyto_mito 8.166, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG bze:COCCADRAFT_26247  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04818  CID  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
PS50102  RRM  
CDD cd16984  CID_Nrd1_like  
Amino Acid Sequences MDELGTQLQSLQALKPPGVTPTKIKAITQLCVDNIQSHPVIVQKIAQQLQNSAVTHKLGVLYVVDAVARQWVERAKQAGQTVSKNAVPGTYASGVQMMRDVLPAMMMNLIQSAPDTQKEKISKLIDIWERGQTFPHDMLASFKQQLNGGHNNVPLPVEPPKSNGIAPTFNGQTANPQPLAPPPPAQPSQDTNALFAALAGISHQNIPTNAPPAAPHAFPFQQNVLLPPPPGFVPPPPAVTTGQPGLPVPPAGMNELAGQILQAMSAGSIQPDQAIQVLNALATAQSGGLSMLPLQPPVATQTPPQGQSIVINGNQTDRYDQTDSKMRDRSRSPGFQHRRSPGDRSPPNPNRRESPTYGVYDPNAGPEGNSQRFERGERGRSRGKQKGGRNDRSEYRQRSPPRRQPSPPRATAYGQSKYIDWDETLPRDNIRVLSRTLFVGGAGGTESEIRSIFSRFGRVQTCIVNQDKRHAFVKMLTRPDALAAKQGMDSLNDPVAQSKARQTRWGVGFGPRDCSDYQTGISVIPISRLTEADRKWALTAEYGGTGGRALEGGMVIEEPDIEIGAGVSSKAISRRVPTDAPRGGRGGYGARGDHAGRSNSNGRENLNERADAAPNNFGGARPGPENAAQHKFRKHDRGNANDPRHVSPRADQGVAVPPAVPGFGFQLPGFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.22
3 0.22
4 0.27
5 0.31
6 0.32
7 0.33
8 0.38
9 0.46
10 0.45
11 0.44
12 0.46
13 0.46
14 0.46
15 0.45
16 0.41
17 0.34
18 0.36
19 0.36
20 0.32
21 0.28
22 0.29
23 0.24
24 0.2
25 0.2
26 0.21
27 0.21
28 0.18
29 0.2
30 0.2
31 0.28
32 0.31
33 0.33
34 0.31
35 0.31
36 0.35
37 0.37
38 0.33
39 0.28
40 0.27
41 0.25
42 0.23
43 0.23
44 0.19
45 0.14
46 0.14
47 0.12
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.12
58 0.16
59 0.19
60 0.24
61 0.28
62 0.28
63 0.33
64 0.36
65 0.39
66 0.4
67 0.42
68 0.4
69 0.4
70 0.38
71 0.34
72 0.31
73 0.25
74 0.21
75 0.18
76 0.19
77 0.16
78 0.15
79 0.14
80 0.18
81 0.17
82 0.16
83 0.17
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.08
100 0.1
101 0.14
102 0.17
103 0.18
104 0.26
105 0.29
106 0.3
107 0.36
108 0.36
109 0.34
110 0.33
111 0.4
112 0.38
113 0.38
114 0.39
115 0.38
116 0.37
117 0.35
118 0.35
119 0.29
120 0.28
121 0.25
122 0.24
123 0.18
124 0.17
125 0.22
126 0.23
127 0.24
128 0.23
129 0.24
130 0.23
131 0.25
132 0.28
133 0.3
134 0.33
135 0.33
136 0.33
137 0.33
138 0.32
139 0.3
140 0.27
141 0.21
142 0.18
143 0.2
144 0.2
145 0.19
146 0.22
147 0.24
148 0.25
149 0.26
150 0.26
151 0.24
152 0.23
153 0.23
154 0.25
155 0.23
156 0.22
157 0.22
158 0.19
159 0.22
160 0.23
161 0.25
162 0.21
163 0.2
164 0.21
165 0.24
166 0.28
167 0.23
168 0.23
169 0.22
170 0.28
171 0.3
172 0.31
173 0.3
174 0.31
175 0.33
176 0.36
177 0.34
178 0.28
179 0.26
180 0.24
181 0.2
182 0.16
183 0.12
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.11
194 0.13
195 0.15
196 0.15
197 0.14
198 0.15
199 0.18
200 0.2
201 0.18
202 0.17
203 0.19
204 0.2
205 0.21
206 0.23
207 0.19
208 0.2
209 0.2
210 0.21
211 0.19
212 0.18
213 0.18
214 0.16
215 0.16
216 0.13
217 0.14
218 0.13
219 0.12
220 0.17
221 0.18
222 0.2
223 0.2
224 0.22
225 0.22
226 0.22
227 0.23
228 0.18
229 0.17
230 0.15
231 0.14
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.07
245 0.06
246 0.05
247 0.04
248 0.04
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.03
270 0.04
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.04
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.1
285 0.11
286 0.1
287 0.11
288 0.16
289 0.19
290 0.21
291 0.21
292 0.18
293 0.16
294 0.16
295 0.18
296 0.14
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.1
305 0.13
306 0.15
307 0.15
308 0.17
309 0.24
310 0.26
311 0.3
312 0.36
313 0.33
314 0.35
315 0.37
316 0.41
317 0.4
318 0.45
319 0.44
320 0.48
321 0.55
322 0.57
323 0.62
324 0.59
325 0.59
326 0.54
327 0.56
328 0.5
329 0.53
330 0.5
331 0.46
332 0.53
333 0.56
334 0.62
335 0.61
336 0.58
337 0.53
338 0.56
339 0.58
340 0.51
341 0.47
342 0.42
343 0.4
344 0.39
345 0.35
346 0.28
347 0.25
348 0.21
349 0.17
350 0.14
351 0.11
352 0.09
353 0.12
354 0.18
355 0.18
356 0.2
357 0.19
358 0.2
359 0.22
360 0.23
361 0.26
362 0.26
363 0.32
364 0.34
365 0.4
366 0.46
367 0.51
368 0.58
369 0.58
370 0.6
371 0.6
372 0.63
373 0.68
374 0.71
375 0.73
376 0.7
377 0.68
378 0.65
379 0.64
380 0.66
381 0.61
382 0.56
383 0.56
384 0.59
385 0.65
386 0.7
387 0.72
388 0.73
389 0.74
390 0.77
391 0.8
392 0.82
393 0.81
394 0.76
395 0.71
396 0.65
397 0.59
398 0.57
399 0.53
400 0.45
401 0.39
402 0.33
403 0.29
404 0.28
405 0.27
406 0.21
407 0.15
408 0.15
409 0.16
410 0.17
411 0.2
412 0.18
413 0.17
414 0.18
415 0.18
416 0.18
417 0.18
418 0.18
419 0.17
420 0.18
421 0.19
422 0.18
423 0.18
424 0.14
425 0.11
426 0.1
427 0.08
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.04
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.07
438 0.08
439 0.11
440 0.11
441 0.17
442 0.17
443 0.22
444 0.24
445 0.25
446 0.27
447 0.27
448 0.29
449 0.3
450 0.34
451 0.35
452 0.33
453 0.4
454 0.4
455 0.39
456 0.39
457 0.34
458 0.3
459 0.29
460 0.38
461 0.36
462 0.38
463 0.37
464 0.36
465 0.35
466 0.36
467 0.33
468 0.24
469 0.22
470 0.18
471 0.17
472 0.17
473 0.18
474 0.16
475 0.14
476 0.15
477 0.12
478 0.13
479 0.12
480 0.12
481 0.12
482 0.14
483 0.13
484 0.14
485 0.2
486 0.26
487 0.28
488 0.33
489 0.35
490 0.42
491 0.44
492 0.47
493 0.41
494 0.4
495 0.45
496 0.41
497 0.44
498 0.35
499 0.35
500 0.31
501 0.33
502 0.29
503 0.24
504 0.23
505 0.19
506 0.19
507 0.16
508 0.16
509 0.14
510 0.11
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.11
515 0.12
516 0.16
517 0.21
518 0.21
519 0.27
520 0.28
521 0.28
522 0.27
523 0.29
524 0.25
525 0.2
526 0.21
527 0.15
528 0.14
529 0.14
530 0.13
531 0.11
532 0.1
533 0.08
534 0.06
535 0.05
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.05
542 0.05
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.03
549 0.03
550 0.03
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.06
557 0.09
558 0.13
559 0.15
560 0.19
561 0.23
562 0.29
563 0.34
564 0.38
565 0.45
566 0.49
567 0.5
568 0.48
569 0.46
570 0.41
571 0.36
572 0.33
573 0.26
574 0.23
575 0.23
576 0.21
577 0.2
578 0.22
579 0.22
580 0.24
581 0.26
582 0.26
583 0.23
584 0.29
585 0.35
586 0.37
587 0.42
588 0.41
589 0.37
590 0.42
591 0.45
592 0.47
593 0.43
594 0.39
595 0.34
596 0.35
597 0.36
598 0.3
599 0.29
600 0.25
601 0.21
602 0.23
603 0.21
604 0.19
605 0.2
606 0.19
607 0.2
608 0.18
609 0.19
610 0.2
611 0.24
612 0.29
613 0.32
614 0.38
615 0.4
616 0.45
617 0.51
618 0.56
619 0.61
620 0.67
621 0.67
622 0.69
623 0.73
624 0.76
625 0.8
626 0.83
627 0.81
628 0.76
629 0.72
630 0.68
631 0.63
632 0.57
633 0.5
634 0.45
635 0.48
636 0.47
637 0.44
638 0.39
639 0.37
640 0.42
641 0.4
642 0.35
643 0.25
644 0.2
645 0.19
646 0.2
647 0.16
648 0.08
649 0.11
650 0.12
651 0.14