Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YL93

Protein Details
Accession W6YL93    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
171-190GNRPSKQTSRRGGRNARARDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
322-332RRRTIKGGKPR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12, cyto 9.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR002483  PWI_dom  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR045137  RBM26/27  
IPR000504  RRM_dom  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG bze:COCCADRAFT_2440  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01480  PWI  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12257  RRM1_RBM26_like  
Amino Acid Sequences MMLLHEKDQAAFKSWLLPKLETISDAEAGVLADYVAALVAVDETEANVRRSCIESLEDFLGKDNTEPFVNDVIAALNDKSYLPKAPPSAPIQSIVGSTNLEYEPHHSNVPFNAPRGPAATRFPPTPHRLLDRPAAQGMQQDGSRKRKTLEEDNGQFWEGQDPHYNRSGAGGNRPSKQTSRRGGRNARARDTQHNASYDLSRMPNFANLPAPPPGPLPFDPSDPMAFFAMAAAFGANLPGMPPFSSDTQGNSSSHKGSKGSKGLCTNYYEKGFCAMGTLCPFEHSDAAVAIPANEIPEYDPEQSYLAVQLHRSTRNRASSQSRRRTIKGGKPRAPFSQSGPSRDPSNTMLVVEQIPPENLNEDSVRNYFSEFGSIDEVDIHADKRLAIIKFGDHSAASRAYSSPKAIFENRFVKVYWYRPEEHPEEEKLDLEAIAIRQAEAQKAFEERRRREEEADARAAEIERQLKEKNDEMQEIRRQLAELSGDKADEFSQTLETLQAEAAELFDQHDPSDTSGRGRGYGGFRGGYRGRGFAPFPPRGRGFTPYRGAYHGRGSGFVASAFPGRSAVKRLDNRPRRLAVSGIEADTPRDEALRQYLLNVPDCTSIDRHPEQDDALILTFRERYQAEMFLDQSLQIPDVGKLELAWVPNDAFGGLEPSTTTVSTAQARAEDDDDSSATVGEADIKDEEDDGQLIGGADADMDVADDVDRWMQANTGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.39
3 0.39
4 0.38
5 0.36
6 0.39
7 0.4
8 0.32
9 0.3
10 0.27
11 0.24
12 0.22
13 0.19
14 0.14
15 0.13
16 0.12
17 0.09
18 0.05
19 0.04
20 0.04
21 0.04
22 0.03
23 0.03
24 0.02
25 0.03
26 0.03
27 0.03
28 0.03
29 0.04
30 0.04
31 0.09
32 0.12
33 0.14
34 0.15
35 0.16
36 0.19
37 0.22
38 0.23
39 0.21
40 0.22
41 0.22
42 0.25
43 0.28
44 0.27
45 0.24
46 0.25
47 0.24
48 0.2
49 0.2
50 0.17
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.17
55 0.18
56 0.17
57 0.16
58 0.14
59 0.13
60 0.13
61 0.13
62 0.11
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.12
67 0.13
68 0.16
69 0.16
70 0.22
71 0.26
72 0.29
73 0.35
74 0.38
75 0.42
76 0.4
77 0.39
78 0.35
79 0.31
80 0.29
81 0.24
82 0.2
83 0.15
84 0.13
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.12
89 0.15
90 0.19
91 0.2
92 0.23
93 0.2
94 0.22
95 0.24
96 0.33
97 0.32
98 0.28
99 0.31
100 0.3
101 0.31
102 0.32
103 0.32
104 0.26
105 0.28
106 0.32
107 0.31
108 0.32
109 0.35
110 0.4
111 0.43
112 0.46
113 0.45
114 0.46
115 0.46
116 0.48
117 0.52
118 0.48
119 0.45
120 0.42
121 0.37
122 0.31
123 0.31
124 0.29
125 0.24
126 0.21
127 0.25
128 0.31
129 0.39
130 0.42
131 0.4
132 0.4
133 0.44
134 0.49
135 0.52
136 0.54
137 0.56
138 0.57
139 0.58
140 0.57
141 0.52
142 0.45
143 0.35
144 0.31
145 0.21
146 0.19
147 0.25
148 0.25
149 0.28
150 0.33
151 0.32
152 0.26
153 0.28
154 0.31
155 0.25
156 0.31
157 0.36
158 0.36
159 0.4
160 0.43
161 0.43
162 0.44
163 0.49
164 0.5
165 0.52
166 0.57
167 0.62
168 0.69
169 0.75
170 0.77
171 0.8
172 0.78
173 0.74
174 0.71
175 0.67
176 0.65
177 0.63
178 0.6
179 0.55
180 0.49
181 0.45
182 0.39
183 0.36
184 0.3
185 0.26
186 0.22
187 0.18
188 0.18
189 0.17
190 0.19
191 0.18
192 0.18
193 0.18
194 0.17
195 0.19
196 0.2
197 0.2
198 0.17
199 0.17
200 0.18
201 0.19
202 0.2
203 0.23
204 0.22
205 0.24
206 0.24
207 0.25
208 0.24
209 0.2
210 0.2
211 0.14
212 0.13
213 0.11
214 0.09
215 0.08
216 0.06
217 0.06
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.06
229 0.08
230 0.1
231 0.12
232 0.12
233 0.14
234 0.18
235 0.2
236 0.2
237 0.2
238 0.21
239 0.22
240 0.24
241 0.23
242 0.22
243 0.23
244 0.3
245 0.35
246 0.35
247 0.37
248 0.4
249 0.41
250 0.41
251 0.42
252 0.37
253 0.34
254 0.35
255 0.3
256 0.25
257 0.24
258 0.22
259 0.17
260 0.17
261 0.13
262 0.12
263 0.13
264 0.14
265 0.11
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.12
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.07
284 0.1
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.12
291 0.12
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.12
296 0.15
297 0.21
298 0.23
299 0.27
300 0.31
301 0.37
302 0.39
303 0.41
304 0.47
305 0.51
306 0.6
307 0.65
308 0.66
309 0.64
310 0.64
311 0.66
312 0.65
313 0.64
314 0.64
315 0.65
316 0.65
317 0.65
318 0.67
319 0.63
320 0.59
321 0.51
322 0.44
323 0.44
324 0.38
325 0.39
326 0.38
327 0.35
328 0.34
329 0.32
330 0.3
331 0.22
332 0.23
333 0.18
334 0.15
335 0.14
336 0.13
337 0.13
338 0.11
339 0.1
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.1
350 0.1
351 0.11
352 0.1
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.11
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.05
368 0.06
369 0.05
370 0.07
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.14
378 0.13
379 0.08
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.1
386 0.12
387 0.13
388 0.14
389 0.14
390 0.14
391 0.18
392 0.21
393 0.22
394 0.26
395 0.31
396 0.3
397 0.29
398 0.28
399 0.29
400 0.29
401 0.32
402 0.32
403 0.3
404 0.32
405 0.33
406 0.39
407 0.37
408 0.37
409 0.35
410 0.31
411 0.3
412 0.27
413 0.25
414 0.2
415 0.17
416 0.13
417 0.1
418 0.09
419 0.06
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.09
425 0.11
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.14
430 0.17
431 0.21
432 0.3
433 0.32
434 0.4
435 0.46
436 0.47
437 0.47
438 0.53
439 0.54
440 0.51
441 0.51
442 0.42
443 0.36
444 0.34
445 0.31
446 0.23
447 0.19
448 0.17
449 0.14
450 0.17
451 0.18
452 0.2
453 0.23
454 0.26
455 0.29
456 0.28
457 0.31
458 0.31
459 0.37
460 0.4
461 0.39
462 0.36
463 0.3
464 0.27
465 0.24
466 0.23
467 0.19
468 0.15
469 0.15
470 0.15
471 0.15
472 0.14
473 0.15
474 0.13
475 0.1
476 0.09
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.09
481 0.09
482 0.09
483 0.08
484 0.08
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.07
493 0.08
494 0.07
495 0.09
496 0.09
497 0.11
498 0.15
499 0.14
500 0.15
501 0.18
502 0.19
503 0.18
504 0.18
505 0.2
506 0.2
507 0.23
508 0.23
509 0.21
510 0.21
511 0.26
512 0.26
513 0.27
514 0.24
515 0.23
516 0.22
517 0.24
518 0.25
519 0.26
520 0.33
521 0.35
522 0.36
523 0.41
524 0.41
525 0.42
526 0.43
527 0.43
528 0.41
529 0.42
530 0.46
531 0.43
532 0.43
533 0.43
534 0.44
535 0.4
536 0.39
537 0.36
538 0.3
539 0.27
540 0.27
541 0.24
542 0.21
543 0.19
544 0.14
545 0.1
546 0.12
547 0.11
548 0.1
549 0.11
550 0.12
551 0.13
552 0.17
553 0.21
554 0.28
555 0.35
556 0.44
557 0.53
558 0.62
559 0.67
560 0.71
561 0.7
562 0.65
563 0.59
564 0.53
565 0.44
566 0.42
567 0.37
568 0.3
569 0.28
570 0.25
571 0.24
572 0.21
573 0.2
574 0.13
575 0.11
576 0.11
577 0.11
578 0.15
579 0.18
580 0.17
581 0.18
582 0.23
583 0.26
584 0.3
585 0.29
586 0.25
587 0.25
588 0.26
589 0.26
590 0.24
591 0.23
592 0.27
593 0.28
594 0.29
595 0.29
596 0.29
597 0.28
598 0.27
599 0.25
600 0.19
601 0.17
602 0.15
603 0.13
604 0.13
605 0.14
606 0.12
607 0.16
608 0.14
609 0.18
610 0.2
611 0.25
612 0.26
613 0.28
614 0.29
615 0.25
616 0.25
617 0.21
618 0.2
619 0.16
620 0.14
621 0.12
622 0.12
623 0.11
624 0.13
625 0.13
626 0.11
627 0.09
628 0.11
629 0.13
630 0.13
631 0.13
632 0.13
633 0.13
634 0.13
635 0.14
636 0.11
637 0.09
638 0.08
639 0.11
640 0.09
641 0.09
642 0.09
643 0.1
644 0.12
645 0.12
646 0.13
647 0.1
648 0.14
649 0.17
650 0.19
651 0.18
652 0.19
653 0.21
654 0.22
655 0.22
656 0.2
657 0.17
658 0.18
659 0.17
660 0.15
661 0.13
662 0.11
663 0.1
664 0.09
665 0.08
666 0.11
667 0.1
668 0.12
669 0.12
670 0.13
671 0.13
672 0.14
673 0.15
674 0.11
675 0.11
676 0.1
677 0.09
678 0.09
679 0.08
680 0.08
681 0.07
682 0.06
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.05
692 0.06
693 0.07
694 0.08
695 0.08
696 0.09