Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YAN9

Protein Details
Accession W6YAN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
298-320VVDMGKRRPGRPKGSKNKPLVEAHydrophilic
322-364ETVGPRPRGRPKGSKNKSTLQAEKEATYKPRGRPKGTTKHYAEHydrophilic
374-399VPRTLKSYCGRPKGSKTKRRTTVDDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
302-361GKRRPGRPKGSKNKPLVEAIETVGPRPRGRPKGSKNKSTLQAEKEATYKPRGRPKGTTKH
Subcellular Location(s) mito 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR018828  RRG7  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG bze:COCCADRAFT_34167  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10356  DUF2034  
Amino Acid Sequences MRPSLRPTWPTNSSLLAWLPRATPHRVPRRIATTSAHNAAPVDLPKMVLSPGSPHHNSLPTFLEYAKRINLASDNTVFIGTHYEYTSALALMRLGFSLLRIGRTSDAGIDLIGHWVLAPLREPLPVIIQCKARKISVNPSHIRELEGSFSGIPPDWTKKDVLGLLVTTKKATRGVLEAVGHSHWPMGFVLISQQGLIQQFVWNRAACDRGLEGVGVTVRHTPRILLPDAEHETEQDESGTARKRVAKFQNAGTRRDIQLTWMGSPIFPERKELDQATLGLMRQIPADEPAKVAKVVKVVDMGKRRPGRPKGSKNKPLVEAIETVGPRPRGRPKGSKNKSTLQAEKEATYKPRGRPKGTTKHYAEKMPFPRGGLVPRTLKSYCGRPKGSKTKRRTTVDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.36
3 0.31
4 0.28
5 0.27
6 0.25
7 0.27
8 0.31
9 0.34
10 0.39
11 0.46
12 0.55
13 0.61
14 0.64
15 0.66
16 0.7
17 0.67
18 0.63
19 0.57
20 0.55
21 0.55
22 0.54
23 0.46
24 0.38
25 0.35
26 0.32
27 0.31
28 0.23
29 0.19
30 0.15
31 0.16
32 0.15
33 0.16
34 0.15
35 0.12
36 0.11
37 0.12
38 0.17
39 0.24
40 0.25
41 0.27
42 0.31
43 0.36
44 0.36
45 0.36
46 0.35
47 0.29
48 0.29
49 0.27
50 0.28
51 0.24
52 0.26
53 0.25
54 0.23
55 0.21
56 0.21
57 0.24
58 0.23
59 0.26
60 0.24
61 0.23
62 0.22
63 0.22
64 0.2
65 0.16
66 0.17
67 0.13
68 0.13
69 0.12
70 0.13
71 0.12
72 0.14
73 0.14
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.11
85 0.11
86 0.13
87 0.13
88 0.15
89 0.15
90 0.17
91 0.17
92 0.12
93 0.12
94 0.11
95 0.1
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.15
112 0.17
113 0.18
114 0.2
115 0.26
116 0.27
117 0.32
118 0.34
119 0.3
120 0.32
121 0.34
122 0.41
123 0.44
124 0.51
125 0.5
126 0.52
127 0.54
128 0.5
129 0.47
130 0.38
131 0.3
132 0.23
133 0.2
134 0.16
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.14
142 0.14
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.18
147 0.18
148 0.17
149 0.13
150 0.12
151 0.13
152 0.15
153 0.15
154 0.13
155 0.12
156 0.13
157 0.14
158 0.14
159 0.12
160 0.12
161 0.14
162 0.16
163 0.17
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.13
168 0.11
169 0.1
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.11
188 0.14
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.14
193 0.11
194 0.12
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.17
211 0.17
212 0.14
213 0.15
214 0.19
215 0.22
216 0.23
217 0.2
218 0.16
219 0.16
220 0.15
221 0.15
222 0.09
223 0.07
224 0.06
225 0.1
226 0.14
227 0.13
228 0.16
229 0.22
230 0.24
231 0.32
232 0.4
233 0.45
234 0.44
235 0.51
236 0.58
237 0.55
238 0.56
239 0.51
240 0.47
241 0.4
242 0.39
243 0.32
244 0.24
245 0.26
246 0.25
247 0.22
248 0.19
249 0.18
250 0.16
251 0.17
252 0.2
253 0.19
254 0.18
255 0.21
256 0.22
257 0.25
258 0.3
259 0.29
260 0.26
261 0.23
262 0.24
263 0.22
264 0.2
265 0.17
266 0.15
267 0.14
268 0.12
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.11
273 0.13
274 0.12
275 0.13
276 0.14
277 0.15
278 0.16
279 0.16
280 0.14
281 0.17
282 0.17
283 0.17
284 0.2
285 0.22
286 0.28
287 0.34
288 0.35
289 0.4
290 0.46
291 0.49
292 0.54
293 0.6
294 0.64
295 0.68
296 0.76
297 0.78
298 0.83
299 0.88
300 0.87
301 0.85
302 0.78
303 0.71
304 0.63
305 0.55
306 0.45
307 0.37
308 0.34
309 0.27
310 0.25
311 0.25
312 0.25
313 0.23
314 0.27
315 0.35
316 0.39
317 0.47
318 0.57
319 0.63
320 0.72
321 0.8
322 0.83
323 0.8
324 0.8
325 0.81
326 0.79
327 0.75
328 0.69
329 0.68
330 0.61
331 0.57
332 0.51
333 0.47
334 0.43
335 0.44
336 0.46
337 0.46
338 0.54
339 0.6
340 0.64
341 0.69
342 0.75
343 0.78
344 0.78
345 0.8
346 0.77
347 0.78
348 0.77
349 0.75
350 0.69
351 0.68
352 0.68
353 0.65
354 0.59
355 0.51
356 0.51
357 0.46
358 0.48
359 0.43
360 0.43
361 0.42
362 0.42
363 0.46
364 0.41
365 0.43
366 0.41
367 0.47
368 0.49
369 0.52
370 0.58
371 0.6
372 0.71
373 0.78
374 0.84
375 0.84
376 0.84
377 0.85
378 0.88
379 0.87