Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

W6YUC0

Protein Details
Accession W6YUC0    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MARGRGTARKKQSAKDKELAKKPVAHydrophilic
363-398EEQELEKRWQQKNKEKEERRRIQRENIERKRKEKADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-24RGTARKKQSAKDKELAKKPV
297-327RREKEKLKAGDETSHARARGSKPRVEKRAVK
372-398QQKNKEKEERRRIQRENIERKRKEKAD
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG bze:COCCADRAFT_91673  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MARGRGTARKKQSAKDKELAKKPVAGPKSMVIRIGAQEVGKSISDLVNDVRHCLEPDTAIRLKERRANKLKDYLVMCGPLGVSHLLLFSRSESGNTNLRLARTPRGPTLHFRVENYSLCKDIIKAMKRPRSGASDYLVAPLLVMNNFLTSDSDREKLGGKAPPKHLEKLVTDMFQGLFPPIQPHTTPLHSIKRVLLLNREPPSEDTGSVNISLRHYAITTKQVGIPKAIRRLYAAEKLVGSRERKKSALPNLGKLEDVADYMLDPSAAGYTSASDTELDTDAEVEVTAPVRQKVLSRREKEKLKAGDETSHARARGSKPRVEKRAVKLIELGPRMKLRLTKVEEDVCGGKVLWHEFITKSKAEEQELEKRWQQKNKEKEERRRIQRENIERKRKEKADKGETAEGEGEEGEEDEEMEDFEDYDMDDDVWQDAADAGEEGEDDEDEEMEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.78
3 0.78
4 0.78
5 0.81
6 0.8
7 0.72
8 0.7
9 0.67
10 0.68
11 0.61
12 0.54
13 0.47
14 0.46
15 0.51
16 0.45
17 0.4
18 0.33
19 0.33
20 0.32
21 0.31
22 0.27
23 0.19
24 0.18
25 0.18
26 0.19
27 0.15
28 0.14
29 0.13
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.15
34 0.19
35 0.19
36 0.21
37 0.22
38 0.21
39 0.22
40 0.23
41 0.21
42 0.19
43 0.21
44 0.26
45 0.27
46 0.27
47 0.31
48 0.32
49 0.36
50 0.4
51 0.45
52 0.49
53 0.56
54 0.62
55 0.64
56 0.7
57 0.68
58 0.67
59 0.62
60 0.55
61 0.47
62 0.41
63 0.34
64 0.25
65 0.22
66 0.15
67 0.14
68 0.11
69 0.09
70 0.07
71 0.08
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.08
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.14
80 0.18
81 0.24
82 0.25
83 0.28
84 0.27
85 0.28
86 0.32
87 0.32
88 0.35
89 0.34
90 0.37
91 0.38
92 0.41
93 0.43
94 0.44
95 0.49
96 0.52
97 0.48
98 0.45
99 0.46
100 0.45
101 0.47
102 0.45
103 0.39
104 0.31
105 0.29
106 0.28
107 0.23
108 0.24
109 0.28
110 0.29
111 0.35
112 0.43
113 0.51
114 0.52
115 0.55
116 0.52
117 0.51
118 0.5
119 0.45
120 0.38
121 0.34
122 0.32
123 0.31
124 0.27
125 0.2
126 0.16
127 0.12
128 0.11
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.11
138 0.13
139 0.14
140 0.13
141 0.14
142 0.16
143 0.16
144 0.2
145 0.22
146 0.24
147 0.31
148 0.37
149 0.44
150 0.46
151 0.47
152 0.45
153 0.44
154 0.4
155 0.39
156 0.36
157 0.28
158 0.25
159 0.23
160 0.21
161 0.16
162 0.15
163 0.1
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.13
171 0.16
172 0.17
173 0.21
174 0.24
175 0.31
176 0.3
177 0.31
178 0.29
179 0.31
180 0.32
181 0.3
182 0.3
183 0.26
184 0.33
185 0.33
186 0.33
187 0.29
188 0.28
189 0.3
190 0.25
191 0.22
192 0.16
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.13
206 0.14
207 0.14
208 0.17
209 0.2
210 0.2
211 0.21
212 0.24
213 0.24
214 0.3
215 0.3
216 0.27
217 0.26
218 0.29
219 0.3
220 0.31
221 0.28
222 0.22
223 0.21
224 0.21
225 0.22
226 0.23
227 0.23
228 0.25
229 0.3
230 0.32
231 0.33
232 0.36
233 0.41
234 0.45
235 0.52
236 0.46
237 0.47
238 0.47
239 0.47
240 0.44
241 0.36
242 0.28
243 0.18
244 0.16
245 0.09
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.03
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.04
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.14
280 0.22
281 0.32
282 0.4
283 0.45
284 0.52
285 0.6
286 0.67
287 0.67
288 0.67
289 0.64
290 0.58
291 0.57
292 0.52
293 0.48
294 0.44
295 0.44
296 0.4
297 0.36
298 0.33
299 0.28
300 0.31
301 0.32
302 0.39
303 0.4
304 0.41
305 0.48
306 0.57
307 0.64
308 0.66
309 0.68
310 0.64
311 0.69
312 0.64
313 0.56
314 0.51
315 0.49
316 0.49
317 0.45
318 0.39
319 0.32
320 0.33
321 0.33
322 0.3
323 0.3
324 0.26
325 0.32
326 0.37
327 0.38
328 0.41
329 0.44
330 0.42
331 0.4
332 0.37
333 0.28
334 0.24
335 0.19
336 0.16
337 0.15
338 0.16
339 0.16
340 0.15
341 0.16
342 0.17
343 0.22
344 0.25
345 0.23
346 0.24
347 0.28
348 0.3
349 0.31
350 0.35
351 0.36
352 0.42
353 0.46
354 0.48
355 0.47
356 0.52
357 0.57
358 0.59
359 0.64
360 0.63
361 0.69
362 0.76
363 0.82
364 0.84
365 0.88
366 0.91
367 0.92
368 0.92
369 0.92
370 0.87
371 0.86
372 0.86
373 0.86
374 0.86
375 0.87
376 0.87
377 0.83
378 0.82
379 0.82
380 0.8
381 0.79
382 0.77
383 0.77
384 0.76
385 0.77
386 0.79
387 0.77
388 0.69
389 0.61
390 0.53
391 0.42
392 0.33
393 0.25
394 0.18
395 0.1
396 0.1
397 0.07
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06