Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YA56

Protein Details
Accession W6YA56    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
322-350GHSRKSSVAPGSKKKKDRRKSQAGLASPTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
326-341KSSVAPGSKKKKDRRK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10.5, cyto 8.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG bze:COCCADRAFT_88681  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MPPPLPPPDEQEFDQPQLIGGLPTPDLHAGNNLFWYFTSSPWFDSECINIDVYLNLRQNDPVVAEKIMNDPKLWQQRLDDQPEGTQYVIAGEGQGEGHPWLLQRQHKVRVTENDKERIENFVEGNWYTHGTKMLMAPSLLDIVQSRMLTVSTRMQQMAELSKNMTHWTPATGYSYFPPSFETAKATTTASRVGSPTLAPTDADAPGSQSQGAGVAAQATDSAASANDLSDALFMHSLNLTNAYGDEYMDENPLKGEPGAFVFEGTKTAVTARNKAQEQQAIQSVQPAPAAPTELKIETTTPSVAPSVVATPKTVATPGAMEGHSRKSSVAPGSKKKKDRRKSQAGLASPTTPSVPQAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.35
3 0.29
4 0.26
5 0.25
6 0.16
7 0.12
8 0.12
9 0.1
10 0.11
11 0.12
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.17
16 0.17
17 0.18
18 0.21
19 0.19
20 0.18
21 0.17
22 0.23
23 0.19
24 0.19
25 0.23
26 0.21
27 0.22
28 0.24
29 0.27
30 0.21
31 0.22
32 0.23
33 0.21
34 0.22
35 0.21
36 0.18
37 0.17
38 0.17
39 0.17
40 0.21
41 0.21
42 0.2
43 0.2
44 0.21
45 0.21
46 0.21
47 0.21
48 0.18
49 0.17
50 0.17
51 0.16
52 0.17
53 0.23
54 0.26
55 0.25
56 0.22
57 0.22
58 0.3
59 0.39
60 0.4
61 0.35
62 0.34
63 0.43
64 0.5
65 0.55
66 0.49
67 0.4
68 0.4
69 0.4
70 0.38
71 0.28
72 0.2
73 0.13
74 0.11
75 0.1
76 0.08
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.05
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.09
88 0.15
89 0.2
90 0.28
91 0.34
92 0.43
93 0.47
94 0.5
95 0.54
96 0.58
97 0.6
98 0.6
99 0.6
100 0.6
101 0.55
102 0.54
103 0.48
104 0.42
105 0.36
106 0.29
107 0.23
108 0.16
109 0.18
110 0.16
111 0.17
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.13
120 0.14
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.1
137 0.13
138 0.13
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.17
144 0.19
145 0.16
146 0.14
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.15
151 0.13
152 0.1
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.13
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.17
162 0.16
163 0.15
164 0.15
165 0.14
166 0.15
167 0.15
168 0.17
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.14
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.11
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.1
192 0.1
193 0.11
194 0.1
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.09
226 0.08
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.08
234 0.09
235 0.11
236 0.11
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.06
244 0.08
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.09
253 0.08
254 0.09
255 0.15
256 0.17
257 0.23
258 0.27
259 0.34
260 0.35
261 0.38
262 0.42
263 0.41
264 0.41
265 0.4
266 0.4
267 0.33
268 0.32
269 0.34
270 0.29
271 0.25
272 0.23
273 0.19
274 0.15
275 0.14
276 0.18
277 0.12
278 0.13
279 0.16
280 0.16
281 0.17
282 0.17
283 0.17
284 0.16
285 0.18
286 0.17
287 0.14
288 0.15
289 0.14
290 0.13
291 0.13
292 0.12
293 0.14
294 0.16
295 0.17
296 0.16
297 0.17
298 0.18
299 0.18
300 0.18
301 0.14
302 0.12
303 0.12
304 0.14
305 0.16
306 0.15
307 0.17
308 0.19
309 0.26
310 0.26
311 0.25
312 0.24
313 0.22
314 0.28
315 0.34
316 0.4
317 0.42
318 0.52
319 0.62
320 0.71
321 0.79
322 0.83
323 0.86
324 0.88
325 0.9
326 0.9
327 0.91
328 0.89
329 0.9
330 0.88
331 0.83
332 0.79
333 0.72
334 0.63
335 0.53
336 0.46
337 0.37
338 0.28