Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6XY30

Protein Details
Accession W6XY30    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-222ARERRRRTTGYSQHERRKSDBasic
285-308GEVDILPPRKRQKKNKATGTIKAMHydrophilic
595-614NASRRQKLWKRVQAKVEKNSHydrophilic
685-715VNVPKTRRTYCKGKDCKKHTQHKVTQYKAGKHydrophilic
735-758GQTKPVFHKRAKTTKKVVLRLECTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
292-300PRKRQKKNK
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 9.5, nucl 6.5, mito 5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025856  HeH/LEM_domain  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR041885  MAN1_winged_helix_dom  
IPR018996  MSC  
IPR000552  Ribosomal_L44e  
IPR011332  Ribosomal_zn-bd  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG bze:COCCADRAFT_39143  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12949  HeH  
PF09402  MSC  
PF00935  Ribosomal_L44  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01172  RIBOSOMAL_L44E  
CDD cd12935  LEM_like  
Amino Acid Sequences MADARGEYWYYEDGVDANKITVPELRSILLRHGVTYPSSAKKPILVGLFNDIVLPQKSQVQRAYARTKRSTRGIVDVPSSSASTVDTTDVEDETLVAPAPATGRRTLRRTGRATTEEADAPAPRSKTPSRTVPAKHSRAAEPEIDERPAARRTRKSATPAPLPLPKEPSPEPEAWHRNDAASPFTQENPFQSGSSPAIPDTIARERRRRTTGYSQHERRKSDVHRRRTVQPKTEQIDDGIMVPTRGTFDVADPRTKHEEEDTADAGEEFTPEEQLELVRERAKAGEVDILPPRKRQKKNKATGTIKAMAGTILLTATAAFAGVWRQEKINVGFCGIGREATALAGVEIPSWADQILPQCEPCPPHAQCYRGLNVRCDPDFIKKDHPLSLGGLVPLPPTCEPDSEKTRKVNGIANRAVEVLRQRKAQYECGEPDAEGHPVESPEVSEVDLKEQMAAQKSKSLTDQEFSDLFDRAFPELLMREEVVQTTDETTGKRRLASTSLAKLSLSCSVRRSLRQSFERHLLQIIMFFLVIATGSYGKYSYTSNRAMEIRAKQLASDAYDRLQDQGALSYQAPGVEKGISMTQLRDDVLRTEFNASRRQKLWKRVQAKVEKNSNVRAGVRTTANGDVARMWEWVGPVRRLEDGRSSGARDSGRFSLGIGSSPPSASKDGKDAKGVQKWEEGRPVNVPKTRRTYCKGKDCKKHTQHKVTQYKAGKASLFAQGKRRYDRKQSGYGGQTKPVFHKRAKTTKKVVLRLECTACKTKAQLALKRCKHFELGGDKKTKGAALVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.14
4 0.13
5 0.14
6 0.14
7 0.15
8 0.18
9 0.18
10 0.2
11 0.22
12 0.22
13 0.23
14 0.24
15 0.27
16 0.3
17 0.28
18 0.26
19 0.26
20 0.27
21 0.26
22 0.29
23 0.31
24 0.3
25 0.33
26 0.34
27 0.33
28 0.34
29 0.35
30 0.36
31 0.35
32 0.31
33 0.3
34 0.33
35 0.32
36 0.29
37 0.27
38 0.21
39 0.2
40 0.19
41 0.19
42 0.14
43 0.2
44 0.23
45 0.29
46 0.33
47 0.36
48 0.41
49 0.49
50 0.59
51 0.57
52 0.63
53 0.67
54 0.7
55 0.7
56 0.7
57 0.7
58 0.63
59 0.64
60 0.61
61 0.56
62 0.52
63 0.46
64 0.4
65 0.34
66 0.31
67 0.23
68 0.18
69 0.14
70 0.12
71 0.12
72 0.11
73 0.1
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.08
87 0.11
88 0.13
89 0.17
90 0.24
91 0.31
92 0.36
93 0.43
94 0.51
95 0.57
96 0.6
97 0.61
98 0.63
99 0.6
100 0.6
101 0.54
102 0.48
103 0.4
104 0.36
105 0.32
106 0.24
107 0.23
108 0.24
109 0.23
110 0.2
111 0.25
112 0.29
113 0.34
114 0.4
115 0.46
116 0.48
117 0.55
118 0.59
119 0.63
120 0.69
121 0.68
122 0.66
123 0.61
124 0.58
125 0.55
126 0.53
127 0.46
128 0.39
129 0.39
130 0.37
131 0.34
132 0.3
133 0.25
134 0.26
135 0.29
136 0.32
137 0.34
138 0.39
139 0.45
140 0.52
141 0.57
142 0.61
143 0.63
144 0.64
145 0.64
146 0.62
147 0.61
148 0.6
149 0.57
150 0.52
151 0.51
152 0.46
153 0.43
154 0.4
155 0.41
156 0.4
157 0.38
158 0.38
159 0.4
160 0.45
161 0.43
162 0.45
163 0.39
164 0.35
165 0.36
166 0.34
167 0.28
168 0.22
169 0.22
170 0.2
171 0.22
172 0.23
173 0.22
174 0.23
175 0.24
176 0.23
177 0.2
178 0.19
179 0.2
180 0.2
181 0.21
182 0.19
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.13
187 0.16
188 0.23
189 0.29
190 0.34
191 0.42
192 0.47
193 0.54
194 0.6
195 0.58
196 0.57
197 0.6
198 0.65
199 0.67
200 0.72
201 0.73
202 0.77
203 0.8
204 0.75
205 0.67
206 0.66
207 0.65
208 0.66
209 0.66
210 0.67
211 0.69
212 0.72
213 0.78
214 0.79
215 0.79
216 0.76
217 0.75
218 0.74
219 0.68
220 0.67
221 0.58
222 0.48
223 0.41
224 0.32
225 0.25
226 0.17
227 0.14
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.09
236 0.18
237 0.2
238 0.26
239 0.25
240 0.3
241 0.35
242 0.35
243 0.33
244 0.27
245 0.29
246 0.26
247 0.3
248 0.26
249 0.2
250 0.2
251 0.19
252 0.17
253 0.12
254 0.1
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.07
263 0.08
264 0.1
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.14
270 0.13
271 0.12
272 0.16
273 0.14
274 0.16
275 0.21
276 0.26
277 0.26
278 0.31
279 0.39
280 0.43
281 0.52
282 0.6
283 0.67
284 0.72
285 0.81
286 0.87
287 0.88
288 0.84
289 0.8
290 0.76
291 0.69
292 0.58
293 0.48
294 0.37
295 0.27
296 0.21
297 0.15
298 0.08
299 0.04
300 0.04
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.02
307 0.03
308 0.04
309 0.06
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.1
314 0.14
315 0.16
316 0.22
317 0.2
318 0.19
319 0.2
320 0.19
321 0.21
322 0.17
323 0.15
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.03
340 0.05
341 0.08
342 0.1
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.13
347 0.15
348 0.16
349 0.21
350 0.19
351 0.26
352 0.3
353 0.31
354 0.33
355 0.36
356 0.37
357 0.35
358 0.36
359 0.32
360 0.32
361 0.33
362 0.29
363 0.27
364 0.25
365 0.27
366 0.28
367 0.28
368 0.3
369 0.3
370 0.32
371 0.33
372 0.32
373 0.25
374 0.23
375 0.23
376 0.17
377 0.14
378 0.12
379 0.09
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.09
385 0.09
386 0.11
387 0.13
388 0.18
389 0.26
390 0.29
391 0.33
392 0.33
393 0.35
394 0.35
395 0.35
396 0.36
397 0.33
398 0.36
399 0.35
400 0.33
401 0.3
402 0.29
403 0.27
404 0.22
405 0.23
406 0.2
407 0.2
408 0.22
409 0.22
410 0.28
411 0.31
412 0.36
413 0.33
414 0.34
415 0.33
416 0.33
417 0.33
418 0.26
419 0.25
420 0.2
421 0.18
422 0.12
423 0.1
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.06
428 0.05
429 0.05
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.07
434 0.09
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.11
440 0.15
441 0.15
442 0.14
443 0.18
444 0.18
445 0.19
446 0.2
447 0.22
448 0.18
449 0.19
450 0.2
451 0.18
452 0.18
453 0.18
454 0.17
455 0.14
456 0.13
457 0.12
458 0.12
459 0.1
460 0.1
461 0.08
462 0.08
463 0.09
464 0.1
465 0.1
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.14
478 0.18
479 0.19
480 0.2
481 0.19
482 0.2
483 0.22
484 0.27
485 0.29
486 0.29
487 0.3
488 0.29
489 0.28
490 0.26
491 0.25
492 0.26
493 0.22
494 0.18
495 0.18
496 0.22
497 0.26
498 0.3
499 0.35
500 0.35
501 0.42
502 0.47
503 0.5
504 0.5
505 0.54
506 0.52
507 0.46
508 0.4
509 0.32
510 0.25
511 0.22
512 0.17
513 0.11
514 0.09
515 0.07
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.03
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.07
527 0.09
528 0.12
529 0.17
530 0.21
531 0.22
532 0.25
533 0.26
534 0.27
535 0.32
536 0.32
537 0.31
538 0.3
539 0.29
540 0.26
541 0.27
542 0.27
543 0.23
544 0.22
545 0.18
546 0.16
547 0.18
548 0.18
549 0.17
550 0.16
551 0.13
552 0.11
553 0.12
554 0.11
555 0.11
556 0.11
557 0.11
558 0.11
559 0.12
560 0.12
561 0.11
562 0.11
563 0.09
564 0.09
565 0.09
566 0.1
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.11
571 0.12
572 0.13
573 0.13
574 0.13
575 0.13
576 0.15
577 0.15
578 0.15
579 0.19
580 0.22
581 0.24
582 0.32
583 0.33
584 0.37
585 0.39
586 0.48
587 0.51
588 0.58
589 0.66
590 0.67
591 0.71
592 0.72
593 0.79
594 0.79
595 0.81
596 0.79
597 0.78
598 0.75
599 0.71
600 0.69
601 0.62
602 0.55
603 0.48
604 0.41
605 0.34
606 0.31
607 0.29
608 0.25
609 0.24
610 0.23
611 0.23
612 0.21
613 0.19
614 0.16
615 0.16
616 0.16
617 0.13
618 0.12
619 0.11
620 0.12
621 0.17
622 0.21
623 0.22
624 0.22
625 0.23
626 0.27
627 0.27
628 0.28
629 0.29
630 0.28
631 0.31
632 0.32
633 0.32
634 0.3
635 0.33
636 0.32
637 0.26
638 0.27
639 0.24
640 0.24
641 0.21
642 0.21
643 0.21
644 0.19
645 0.19
646 0.16
647 0.16
648 0.16
649 0.16
650 0.17
651 0.14
652 0.18
653 0.19
654 0.2
655 0.27
656 0.33
657 0.35
658 0.4
659 0.44
660 0.48
661 0.53
662 0.54
663 0.47
664 0.48
665 0.49
666 0.49
667 0.51
668 0.45
669 0.41
670 0.46
671 0.51
672 0.51
673 0.52
674 0.51
675 0.5
676 0.58
677 0.61
678 0.62
679 0.61
680 0.64
681 0.69
682 0.76
683 0.79
684 0.8
685 0.84
686 0.84
687 0.89
688 0.88
689 0.89
690 0.89
691 0.89
692 0.88
693 0.89
694 0.91
695 0.85
696 0.84
697 0.79
698 0.76
699 0.69
700 0.64
701 0.54
702 0.46
703 0.44
704 0.43
705 0.43
706 0.39
707 0.44
708 0.48
709 0.54
710 0.61
711 0.66
712 0.65
713 0.7
714 0.77
715 0.75
716 0.77
717 0.76
718 0.75
719 0.76
720 0.77
721 0.69
722 0.65
723 0.61
724 0.54
725 0.57
726 0.57
727 0.55
728 0.51
729 0.58
730 0.61
731 0.69
732 0.75
733 0.77
734 0.77
735 0.8
736 0.85
737 0.83
738 0.82
739 0.81
740 0.77
741 0.74
742 0.72
743 0.67
744 0.64
745 0.63
746 0.55
747 0.49
748 0.46
749 0.45
750 0.47
751 0.52
752 0.53
753 0.56
754 0.65
755 0.71
756 0.76
757 0.73
758 0.68
759 0.63
760 0.58
761 0.57
762 0.57
763 0.57
764 0.58
765 0.61
766 0.57
767 0.54
768 0.53
769 0.45