Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

W6XIQ9

Protein Details
Accession W6XIQ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
463-482EQISAYLRKKKENRENARGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
471-482KKKENRENARGR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 6, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040662  Tfb2_C  
IPR004598  TFIIH_p52/Tfb2  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0001671  F:ATPase activator activity  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG bze:COCCADRAFT_10299  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03849  Tfb2  
PF18307  Tfb2_C  
Amino Acid Sequences MSASSSAQALEYLEGLPLATHKKLYEQPSTVLAVFRCMLPHLAKSIVMAMLYMPTPFPAADLDTWFKPTARKEKERATFTLDRLHIVTSARQDNGTLSWTLNPGFQRSLRNAIEGSGTHRSFGVPATKEESGKRVSIEFLDEYSRSQWEGILYYLVSGAAGLSKDSISRAEVGPGTKKLLHTGDLVRTIHGSPRITKDGFSFVLQETNAQVWSLLIVYLKMTNELGMSETEVLSFLFMLGSLELGQDYSTSTLSATQLQMLEDLSAMGLVYRSDRNARTFYPTRLATTLTSDSGSAMSASSNDIAQASTSTTGPPTAANKGFIIIETNYRLYAYTNSLIQIAILSLFTKLQHRFPNLVSGKLTKESVHKAVQAGITSAQIISYLTTYAHPQMQKTVPYIPPTVMDQIRLWEYEGERVETTTGYLMREFGSDAEYRDVLNYASALGVLVWQNDANRCFFVSHVEQISAYLRKKKENRENARGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.07
4 0.1
5 0.13
6 0.14
7 0.15
8 0.16
9 0.23
10 0.3
11 0.36
12 0.42
13 0.41
14 0.42
15 0.44
16 0.47
17 0.41
18 0.37
19 0.31
20 0.26
21 0.23
22 0.21
23 0.18
24 0.16
25 0.2
26 0.19
27 0.21
28 0.2
29 0.21
30 0.2
31 0.2
32 0.21
33 0.18
34 0.15
35 0.13
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.1
40 0.08
41 0.07
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.08
46 0.11
47 0.12
48 0.17
49 0.2
50 0.2
51 0.24
52 0.24
53 0.24
54 0.26
55 0.33
56 0.39
57 0.45
58 0.53
59 0.56
60 0.65
61 0.73
62 0.74
63 0.68
64 0.66
65 0.63
66 0.56
67 0.59
68 0.49
69 0.42
70 0.37
71 0.35
72 0.28
73 0.24
74 0.25
75 0.22
76 0.26
77 0.25
78 0.24
79 0.23
80 0.23
81 0.22
82 0.21
83 0.16
84 0.13
85 0.14
86 0.15
87 0.15
88 0.17
89 0.17
90 0.18
91 0.2
92 0.22
93 0.26
94 0.28
95 0.35
96 0.33
97 0.34
98 0.31
99 0.28
100 0.28
101 0.23
102 0.25
103 0.25
104 0.24
105 0.22
106 0.22
107 0.21
108 0.19
109 0.22
110 0.24
111 0.18
112 0.2
113 0.24
114 0.26
115 0.28
116 0.28
117 0.3
118 0.25
119 0.24
120 0.23
121 0.19
122 0.19
123 0.18
124 0.2
125 0.16
126 0.15
127 0.16
128 0.15
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.1
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.06
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.09
156 0.09
157 0.11
158 0.13
159 0.14
160 0.17
161 0.18
162 0.2
163 0.2
164 0.19
165 0.21
166 0.2
167 0.2
168 0.2
169 0.22
170 0.22
171 0.26
172 0.26
173 0.22
174 0.22
175 0.21
176 0.2
177 0.21
178 0.19
179 0.17
180 0.22
181 0.27
182 0.26
183 0.26
184 0.25
185 0.25
186 0.25
187 0.23
188 0.19
189 0.15
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.08
197 0.08
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.06
240 0.06
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.04
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.05
258 0.05
259 0.07
260 0.1
261 0.12
262 0.16
263 0.18
264 0.19
265 0.26
266 0.29
267 0.3
268 0.33
269 0.32
270 0.31
271 0.29
272 0.29
273 0.22
274 0.23
275 0.22
276 0.17
277 0.16
278 0.14
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.07
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.09
302 0.11
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.17
307 0.18
308 0.18
309 0.16
310 0.16
311 0.11
312 0.13
313 0.14
314 0.15
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.12
319 0.14
320 0.15
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.15
325 0.14
326 0.13
327 0.11
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.07
335 0.13
336 0.15
337 0.2
338 0.27
339 0.3
340 0.33
341 0.33
342 0.43
343 0.39
344 0.4
345 0.36
346 0.33
347 0.31
348 0.3
349 0.31
350 0.22
351 0.26
352 0.28
353 0.31
354 0.31
355 0.31
356 0.3
357 0.32
358 0.32
359 0.27
360 0.23
361 0.19
362 0.16
363 0.14
364 0.13
365 0.09
366 0.07
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.1
374 0.12
375 0.17
376 0.18
377 0.19
378 0.25
379 0.28
380 0.3
381 0.31
382 0.35
383 0.33
384 0.36
385 0.37
386 0.31
387 0.29
388 0.29
389 0.33
390 0.27
391 0.26
392 0.22
393 0.24
394 0.25
395 0.24
396 0.22
397 0.2
398 0.2
399 0.24
400 0.25
401 0.25
402 0.23
403 0.23
404 0.23
405 0.19
406 0.19
407 0.15
408 0.15
409 0.13
410 0.13
411 0.14
412 0.13
413 0.14
414 0.14
415 0.11
416 0.13
417 0.13
418 0.15
419 0.17
420 0.17
421 0.16
422 0.17
423 0.17
424 0.14
425 0.13
426 0.11
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.06
431 0.05
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.09
436 0.1
437 0.13
438 0.18
439 0.2
440 0.2
441 0.2
442 0.21
443 0.21
444 0.2
445 0.25
446 0.24
447 0.29
448 0.29
449 0.29
450 0.27
451 0.28
452 0.34
453 0.33
454 0.34
455 0.36
456 0.37
457 0.46
458 0.55
459 0.64
460 0.7
461 0.74
462 0.8