Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YLT0

Protein Details
Accession W6YLT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
213-232MEPPKFKHKRIPRGPPSPPPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
217-231KFKHKRIPRGPPSPP
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG bze:COCCADRAFT_37696  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MSVATLSKSLPKPKYSGEEEELTNSTRVLSSEQYEAQVARKQNGPPAYGSRQSWRPRAPEDFGDGGAFPEVHVAQYPLDMGKKGTPSTSNALVRRVDGEGKTKYDEIARRGHGDSRIVQASFKDLIPLRQRADAGELDLSRPSQEVVQATKEKTEQALMALVAGQTAAQRPKNVQGRKDDEPTFVRYTPTAQMGEAQGKTRIFKIQQRQIDPMEPPKFKHKRIPRGPPSPPPPVLHSPPRKLTAEDQEMWKIPPPISNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDITINDKFAQFGEALQAADRHAREEVKQRAVMQQRLAEKEKLQKEEHLRNLAKQAREDRANASRRRSQSDSETDSEEEEVRKRMDARKERREDLQRELRQSRMGNERKIQMLAREQNRDISEKVALGLAKPTQSGESMYDARLFNQSSGFNAGFNEDNHYDKPLFAAQDAISSIYRPSVQQDDGEDDGQTYDRLTKTSKFEVLGKAKEGFKGADLQEARDGPVQFEKDTDDPFNINQMIDEVRGEKKGEKRYGIQEPEGRSTKRARVDDDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.57
3 0.59
4 0.55
5 0.53
6 0.5
7 0.5
8 0.46
9 0.4
10 0.33
11 0.25
12 0.21
13 0.17
14 0.17
15 0.16
16 0.17
17 0.17
18 0.22
19 0.23
20 0.24
21 0.25
22 0.25
23 0.25
24 0.28
25 0.28
26 0.26
27 0.3
28 0.31
29 0.36
30 0.41
31 0.39
32 0.37
33 0.43
34 0.46
35 0.46
36 0.47
37 0.47
38 0.51
39 0.56
40 0.6
41 0.59
42 0.59
43 0.6
44 0.64
45 0.62
46 0.57
47 0.56
48 0.5
49 0.43
50 0.38
51 0.32
52 0.25
53 0.21
54 0.17
55 0.1
56 0.11
57 0.1
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.1
65 0.12
66 0.12
67 0.13
68 0.17
69 0.2
70 0.21
71 0.23
72 0.23
73 0.26
74 0.31
75 0.37
76 0.39
77 0.38
78 0.42
79 0.39
80 0.38
81 0.36
82 0.33
83 0.29
84 0.25
85 0.3
86 0.29
87 0.31
88 0.33
89 0.31
90 0.29
91 0.32
92 0.35
93 0.32
94 0.36
95 0.36
96 0.37
97 0.39
98 0.42
99 0.38
100 0.37
101 0.36
102 0.33
103 0.34
104 0.3
105 0.29
106 0.25
107 0.26
108 0.24
109 0.21
110 0.2
111 0.18
112 0.25
113 0.31
114 0.35
115 0.33
116 0.34
117 0.35
118 0.31
119 0.34
120 0.27
121 0.22
122 0.21
123 0.19
124 0.17
125 0.18
126 0.17
127 0.13
128 0.13
129 0.11
130 0.08
131 0.11
132 0.13
133 0.15
134 0.21
135 0.25
136 0.25
137 0.27
138 0.27
139 0.26
140 0.24
141 0.23
142 0.16
143 0.13
144 0.14
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.04
153 0.08
154 0.12
155 0.13
156 0.15
157 0.17
158 0.25
159 0.34
160 0.39
161 0.41
162 0.46
163 0.51
164 0.55
165 0.6
166 0.53
167 0.48
168 0.46
169 0.46
170 0.41
171 0.36
172 0.31
173 0.25
174 0.26
175 0.24
176 0.25
177 0.2
178 0.16
179 0.17
180 0.18
181 0.22
182 0.2
183 0.18
184 0.18
185 0.19
186 0.19
187 0.19
188 0.21
189 0.21
190 0.27
191 0.35
192 0.4
193 0.46
194 0.49
195 0.52
196 0.5
197 0.49
198 0.45
199 0.44
200 0.43
201 0.38
202 0.36
203 0.43
204 0.47
205 0.46
206 0.54
207 0.55
208 0.59
209 0.67
210 0.77
211 0.75
212 0.79
213 0.81
214 0.8
215 0.76
216 0.72
217 0.65
218 0.56
219 0.52
220 0.48
221 0.47
222 0.48
223 0.49
224 0.47
225 0.48
226 0.5
227 0.45
228 0.42
229 0.42
230 0.41
231 0.39
232 0.36
233 0.34
234 0.32
235 0.32
236 0.3
237 0.28
238 0.21
239 0.16
240 0.18
241 0.19
242 0.27
243 0.3
244 0.38
245 0.42
246 0.47
247 0.52
248 0.49
249 0.49
250 0.42
251 0.41
252 0.37
253 0.4
254 0.37
255 0.37
256 0.39
257 0.35
258 0.32
259 0.32
260 0.28
261 0.19
262 0.17
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.13
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.15
271 0.13
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.11
277 0.12
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.07
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.13
292 0.22
293 0.27
294 0.28
295 0.3
296 0.3
297 0.36
298 0.4
299 0.41
300 0.34
301 0.33
302 0.33
303 0.36
304 0.38
305 0.33
306 0.3
307 0.36
308 0.39
309 0.39
310 0.36
311 0.38
312 0.42
313 0.49
314 0.51
315 0.52
316 0.47
317 0.44
318 0.52
319 0.5
320 0.44
321 0.4
322 0.4
323 0.36
324 0.38
325 0.38
326 0.34
327 0.38
328 0.45
329 0.45
330 0.46
331 0.47
332 0.48
333 0.53
334 0.51
335 0.46
336 0.45
337 0.49
338 0.48
339 0.43
340 0.42
341 0.36
342 0.33
343 0.31
344 0.25
345 0.18
346 0.15
347 0.16
348 0.14
349 0.15
350 0.18
351 0.23
352 0.32
353 0.41
354 0.49
355 0.58
356 0.64
357 0.65
358 0.7
359 0.73
360 0.67
361 0.66
362 0.67
363 0.61
364 0.62
365 0.62
366 0.55
367 0.5
368 0.47
369 0.44
370 0.43
371 0.45
372 0.43
373 0.45
374 0.47
375 0.43
376 0.44
377 0.4
378 0.33
379 0.36
380 0.39
381 0.4
382 0.43
383 0.41
384 0.44
385 0.45
386 0.44
387 0.35
388 0.29
389 0.24
390 0.19
391 0.19
392 0.16
393 0.14
394 0.12
395 0.14
396 0.13
397 0.12
398 0.12
399 0.13
400 0.12
401 0.12
402 0.13
403 0.13
404 0.16
405 0.17
406 0.17
407 0.21
408 0.2
409 0.21
410 0.23
411 0.22
412 0.18
413 0.19
414 0.19
415 0.16
416 0.21
417 0.2
418 0.16
419 0.16
420 0.17
421 0.16
422 0.16
423 0.2
424 0.17
425 0.2
426 0.2
427 0.23
428 0.22
429 0.2
430 0.22
431 0.19
432 0.19
433 0.16
434 0.19
435 0.15
436 0.17
437 0.17
438 0.17
439 0.14
440 0.13
441 0.13
442 0.12
443 0.13
444 0.11
445 0.15
446 0.17
447 0.18
448 0.2
449 0.22
450 0.25
451 0.27
452 0.27
453 0.23
454 0.18
455 0.18
456 0.17
457 0.14
458 0.1
459 0.12
460 0.12
461 0.14
462 0.17
463 0.22
464 0.28
465 0.34
466 0.37
467 0.34
468 0.39
469 0.47
470 0.51
471 0.49
472 0.46
473 0.45
474 0.43
475 0.42
476 0.4
477 0.31
478 0.25
479 0.28
480 0.25
481 0.29
482 0.28
483 0.28
484 0.31
485 0.31
486 0.32
487 0.3
488 0.3
489 0.24
490 0.3
491 0.3
492 0.25
493 0.25
494 0.28
495 0.25
496 0.29
497 0.29
498 0.25
499 0.25
500 0.25
501 0.3
502 0.26
503 0.23
504 0.2
505 0.19
506 0.18
507 0.17
508 0.17
509 0.15
510 0.16
511 0.19
512 0.21
513 0.25
514 0.32
515 0.41
516 0.47
517 0.5
518 0.54
519 0.6
520 0.68
521 0.68
522 0.68
523 0.64
524 0.62
525 0.65
526 0.65
527 0.58
528 0.53
529 0.53
530 0.53
531 0.56
532 0.56
533 0.54