Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YJV0

Protein Details
Accession W6YJV0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-70FTIFRWKADRTARQKRTNICHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
210-224RGPSARGGMRPGRGG
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 12, cyto 10, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034356  Slt11_RRM  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG bze:COCCADRAFT_22624  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12265  RRM_SLT11  
Amino Acid Sequences MPPQIKSDLNRSGWETTDFPSVCEKCLPDNPYVQMLKEDYGAECKICTRPFTIFRWKADRTARQKRTNICLTCARLKNCCQHCMLDLSFGLPIVVRDAALKMVAPGPQSDINRQYYAQEHEKEIEEGRGAMEAYEKTDEKARDLLKRLAQSEPYYKKQRRLEAEAGESSGQKALPAPGGSGSGSGGAGAGAGASRESNHIPGPIRTRDSRGPSARGGMRPGRGGRMGGPAAEPSPQDWLPPSDPNVASLFVTGVEDDLPEHEIRKHFTQYGQLRSLVCSHRAHCAYVNYAKREDAETAAAALKGKVVIKGCPMRVTWGKPKQLDSLDQNVRMQYAKEGRQVAGSSRRAAAASQAAIEAGPQSNLDSMVIAPPPGADDEVQYASLAGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.36
3 0.29
4 0.35
5 0.32
6 0.29
7 0.36
8 0.34
9 0.33
10 0.35
11 0.34
12 0.31
13 0.39
14 0.4
15 0.35
16 0.4
17 0.4
18 0.44
19 0.44
20 0.38
21 0.35
22 0.33
23 0.3
24 0.27
25 0.25
26 0.18
27 0.21
28 0.22
29 0.18
30 0.17
31 0.19
32 0.23
33 0.24
34 0.25
35 0.23
36 0.3
37 0.35
38 0.42
39 0.5
40 0.51
41 0.55
42 0.61
43 0.6
44 0.6
45 0.64
46 0.67
47 0.66
48 0.71
49 0.75
50 0.76
51 0.8
52 0.8
53 0.79
54 0.79
55 0.71
56 0.65
57 0.63
58 0.59
59 0.62
60 0.61
61 0.56
62 0.52
63 0.55
64 0.6
65 0.58
66 0.56
67 0.49
68 0.45
69 0.43
70 0.43
71 0.38
72 0.31
73 0.25
74 0.22
75 0.2
76 0.17
77 0.15
78 0.09
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.09
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.13
94 0.18
95 0.2
96 0.23
97 0.27
98 0.29
99 0.3
100 0.29
101 0.28
102 0.27
103 0.31
104 0.33
105 0.3
106 0.28
107 0.29
108 0.3
109 0.29
110 0.27
111 0.22
112 0.15
113 0.13
114 0.12
115 0.1
116 0.09
117 0.07
118 0.09
119 0.08
120 0.09
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.17
125 0.18
126 0.17
127 0.23
128 0.24
129 0.28
130 0.32
131 0.37
132 0.36
133 0.39
134 0.39
135 0.36
136 0.36
137 0.33
138 0.38
139 0.38
140 0.41
141 0.47
142 0.49
143 0.55
144 0.58
145 0.62
146 0.59
147 0.62
148 0.61
149 0.55
150 0.55
151 0.47
152 0.42
153 0.35
154 0.28
155 0.21
156 0.15
157 0.11
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.02
177 0.02
178 0.02
179 0.02
180 0.02
181 0.03
182 0.05
183 0.05
184 0.07
185 0.07
186 0.1
187 0.11
188 0.14
189 0.19
190 0.21
191 0.23
192 0.23
193 0.28
194 0.3
195 0.35
196 0.4
197 0.39
198 0.39
199 0.36
200 0.4
201 0.39
202 0.35
203 0.34
204 0.29
205 0.28
206 0.28
207 0.28
208 0.26
209 0.23
210 0.22
211 0.19
212 0.2
213 0.19
214 0.16
215 0.15
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.08
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.12
225 0.15
226 0.17
227 0.19
228 0.21
229 0.23
230 0.23
231 0.24
232 0.24
233 0.21
234 0.19
235 0.17
236 0.14
237 0.08
238 0.08
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.11
249 0.13
250 0.17
251 0.2
252 0.23
253 0.23
254 0.24
255 0.33
256 0.36
257 0.41
258 0.4
259 0.39
260 0.37
261 0.36
262 0.4
263 0.33
264 0.32
265 0.28
266 0.27
267 0.32
268 0.33
269 0.33
270 0.31
271 0.32
272 0.32
273 0.37
274 0.42
275 0.37
276 0.37
277 0.36
278 0.34
279 0.33
280 0.29
281 0.23
282 0.19
283 0.15
284 0.15
285 0.16
286 0.15
287 0.13
288 0.12
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.22
296 0.29
297 0.3
298 0.31
299 0.31
300 0.35
301 0.39
302 0.45
303 0.47
304 0.5
305 0.56
306 0.56
307 0.59
308 0.59
309 0.57
310 0.56
311 0.52
312 0.53
313 0.51
314 0.51
315 0.49
316 0.42
317 0.4
318 0.34
319 0.29
320 0.27
321 0.29
322 0.31
323 0.35
324 0.38
325 0.37
326 0.4
327 0.4
328 0.39
329 0.4
330 0.39
331 0.35
332 0.34
333 0.34
334 0.31
335 0.3
336 0.28
337 0.24
338 0.21
339 0.19
340 0.18
341 0.17
342 0.16
343 0.16
344 0.13
345 0.09
346 0.09
347 0.08
348 0.09
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.09
353 0.09
354 0.12
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.12
361 0.13
362 0.1
363 0.11
364 0.15
365 0.17
366 0.17
367 0.16