Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B2WA52

Protein Details
Accession B2WA52    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-240IDARRQGRRCLRCGRNNCRIATHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 8.5, nucl 6.5, pero 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MHLEGAAKTNVTTFYETQLRQDLPNPCQLLERLELLYGERNRKQKAIQNLHSIRQREDETFISFYPRFEKEIANANAEGWDDDAKISYLRNALSNKMRDRLVGLSGSDTDTYAGFVQRCVDVSNDMELYGQWTKKKVAGSGYTAGYTLPPAPMTTVDANVAGYSNHQDMMEWEPTQPATTQVNAVGLRGKANINGFPSKRPEDQELLGKRAKWVNQEEIDARRQGRRCLRCGRNNCRIATCPLAAALRPTYVGVKTAKSTVVTKAAVEEDSEDPQAEQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.3
3 0.3
4 0.32
5 0.36
6 0.35
7 0.32
8 0.38
9 0.4
10 0.36
11 0.44
12 0.42
13 0.36
14 0.38
15 0.37
16 0.34
17 0.29
18 0.28
19 0.21
20 0.2
21 0.19
22 0.18
23 0.25
24 0.26
25 0.31
26 0.35
27 0.41
28 0.43
29 0.46
30 0.5
31 0.5
32 0.56
33 0.59
34 0.6
35 0.64
36 0.65
37 0.69
38 0.7
39 0.65
40 0.56
41 0.5
42 0.46
43 0.37
44 0.36
45 0.32
46 0.29
47 0.29
48 0.27
49 0.27
50 0.25
51 0.24
52 0.25
53 0.24
54 0.22
55 0.22
56 0.23
57 0.2
58 0.3
59 0.31
60 0.29
61 0.28
62 0.25
63 0.25
64 0.23
65 0.21
66 0.12
67 0.1
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.1
76 0.1
77 0.15
78 0.15
79 0.2
80 0.26
81 0.32
82 0.33
83 0.35
84 0.34
85 0.3
86 0.31
87 0.28
88 0.24
89 0.18
90 0.16
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.12
95 0.1
96 0.08
97 0.07
98 0.08
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.09
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.1
116 0.11
117 0.12
118 0.11
119 0.13
120 0.14
121 0.17
122 0.18
123 0.17
124 0.19
125 0.2
126 0.23
127 0.24
128 0.24
129 0.21
130 0.2
131 0.18
132 0.14
133 0.11
134 0.08
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.05
149 0.05
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.13
157 0.15
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.14
163 0.13
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.11
169 0.15
170 0.14
171 0.15
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.14
176 0.14
177 0.13
178 0.15
179 0.17
180 0.18
181 0.24
182 0.25
183 0.27
184 0.32
185 0.34
186 0.36
187 0.37
188 0.38
189 0.36
190 0.37
191 0.43
192 0.41
193 0.41
194 0.4
195 0.37
196 0.35
197 0.36
198 0.36
199 0.34
200 0.36
201 0.39
202 0.39
203 0.42
204 0.42
205 0.42
206 0.42
207 0.39
208 0.36
209 0.35
210 0.36
211 0.4
212 0.47
213 0.49
214 0.54
215 0.6
216 0.69
217 0.72
218 0.8
219 0.81
220 0.81
221 0.8
222 0.76
223 0.71
224 0.64
225 0.59
226 0.54
227 0.45
228 0.35
229 0.31
230 0.29
231 0.24
232 0.24
233 0.2
234 0.15
235 0.15
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.19
240 0.18
241 0.2
242 0.21
243 0.23
244 0.24
245 0.24
246 0.26
247 0.27
248 0.31
249 0.29
250 0.27
251 0.27
252 0.27
253 0.25
254 0.23
255 0.22
256 0.18
257 0.2
258 0.21