Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YXM9

Protein Details
Accession W6YXM9    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-49TDDTNRKRKKPSGLNHMLRDHydrophilic
157-176IANKLLGAANKKKRKVKRKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-176AANKKKRKVKRKV
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR005574  Rpb4/RPC9  
IPR038324  Rpb4/RPC9_sf  
IPR038846  RPC9  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006384  P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter  
KEGG bze:COCCADRAFT_34356  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03874  RNA_pol_Rpb4  
Amino Acid Sequences MHIKTPQSALLTNHEVLLHLLAEEAEYTGTDDTNRKRKKPSGLNHMLRDGLAYLQTPDYTTTALADAHPNRPMTLYKGPNSLFRALAPKYRLNKAEYLQIYNLRPTTQVMLELVVEEAGTRFTEDELHDMLAIIQQVFDEEEAQIPEGVEDVDMPKIANKLLGAANKKKRKVKRKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.22
4 0.2
5 0.13
6 0.08
7 0.08
8 0.06
9 0.07
10 0.06
11 0.06
12 0.05
13 0.05
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.08
18 0.13
19 0.2
20 0.31
21 0.37
22 0.4
23 0.48
24 0.55
25 0.64
26 0.68
27 0.71
28 0.72
29 0.77
30 0.8
31 0.76
32 0.71
33 0.61
34 0.5
35 0.41
36 0.3
37 0.2
38 0.12
39 0.09
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.13
53 0.14
54 0.16
55 0.19
56 0.19
57 0.18
58 0.19
59 0.2
60 0.19
61 0.25
62 0.27
63 0.26
64 0.31
65 0.32
66 0.35
67 0.37
68 0.33
69 0.25
70 0.22
71 0.25
72 0.2
73 0.24
74 0.23
75 0.26
76 0.27
77 0.31
78 0.33
79 0.31
80 0.33
81 0.3
82 0.34
83 0.3
84 0.29
85 0.27
86 0.28
87 0.27
88 0.25
89 0.24
90 0.17
91 0.16
92 0.15
93 0.15
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.06
102 0.05
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.07
111 0.08
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.1
120 0.07
121 0.06
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.11
147 0.13
148 0.18
149 0.25
150 0.3
151 0.39
152 0.49
153 0.57
154 0.65
155 0.71
156 0.78