Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6Z1Y4

Protein Details
Accession W6Z1Y4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
337-365SAMTNPPALIPRKKKKKKKAGIDSGTPGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
347-356PRKKKKKKKA
Subcellular Location(s) extr 12, cyto 8.5, cyto_nucl 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004600  TFIIH_Tfb4/GTF2H3  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG bze:COCCADRAFT_33192  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03850  Tfb4  
Amino Acid Sequences MNTIDGSDRHIKTEEAPPPSLLAIVLDTNPHAWAHLSSTLSLSTALANILVFINAHLASGNMNEVAVIASHSHKTTFLYPSPVAPQTQSRNGTANGDVEMNGTGDDKGQHTAESANKYRPFAVVESTILQNFVKLLNETKESHLEATPTTLIGGALSLALTHINKQTILHAPTAASAESASLAALADSENTHVDRVSLTSRILIVSVSGDLANQYIPVMNSIFAAQRKRIPIDILKLAGDTVLLQQASDATGGVYMKPERPEGLLQYLMMAFLPDVTARASLVVPSAGGVDFRAACFCHRKVVDIGFVCSVCLSIFCSPDLPGNLCLTCGSYLSLRSAMTNPPALIPRKKKKKKKAGIDSGTPGANTPVGSGTPAHP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.38
3 0.39
4 0.37
5 0.37
6 0.36
7 0.32
8 0.22
9 0.16
10 0.12
11 0.11
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.12
17 0.11
18 0.1
19 0.1
20 0.11
21 0.14
22 0.18
23 0.18
24 0.18
25 0.19
26 0.19
27 0.18
28 0.17
29 0.14
30 0.1
31 0.09
32 0.08
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.08
41 0.07
42 0.08
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.09
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.08
57 0.1
58 0.11
59 0.11
60 0.12
61 0.15
62 0.19
63 0.23
64 0.23
65 0.28
66 0.28
67 0.3
68 0.34
69 0.33
70 0.29
71 0.26
72 0.3
73 0.3
74 0.38
75 0.38
76 0.35
77 0.37
78 0.37
79 0.37
80 0.32
81 0.27
82 0.2
83 0.18
84 0.16
85 0.13
86 0.12
87 0.1
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.13
99 0.17
100 0.23
101 0.25
102 0.31
103 0.33
104 0.34
105 0.34
106 0.31
107 0.29
108 0.23
109 0.23
110 0.17
111 0.17
112 0.18
113 0.18
114 0.17
115 0.15
116 0.14
117 0.11
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.11
123 0.12
124 0.16
125 0.17
126 0.19
127 0.21
128 0.21
129 0.22
130 0.2
131 0.18
132 0.15
133 0.15
134 0.13
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.12
154 0.16
155 0.18
156 0.17
157 0.16
158 0.15
159 0.16
160 0.16
161 0.13
162 0.08
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.07
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.1
210 0.12
211 0.14
212 0.15
213 0.18
214 0.21
215 0.22
216 0.23
217 0.24
218 0.25
219 0.28
220 0.29
221 0.26
222 0.24
223 0.22
224 0.21
225 0.17
226 0.13
227 0.08
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.08
242 0.09
243 0.12
244 0.14
245 0.15
246 0.14
247 0.17
248 0.19
249 0.19
250 0.22
251 0.19
252 0.18
253 0.18
254 0.17
255 0.14
256 0.12
257 0.09
258 0.05
259 0.04
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.05
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.12
283 0.19
284 0.19
285 0.26
286 0.26
287 0.29
288 0.32
289 0.35
290 0.39
291 0.34
292 0.36
293 0.3
294 0.3
295 0.26
296 0.22
297 0.18
298 0.11
299 0.09
300 0.1
301 0.1
302 0.12
303 0.12
304 0.14
305 0.14
306 0.19
307 0.21
308 0.2
309 0.2
310 0.22
311 0.22
312 0.21
313 0.21
314 0.18
315 0.16
316 0.14
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.15
321 0.17
322 0.15
323 0.17
324 0.19
325 0.21
326 0.23
327 0.26
328 0.23
329 0.25
330 0.31
331 0.35
332 0.42
333 0.49
334 0.56
335 0.64
336 0.75
337 0.82
338 0.88
339 0.93
340 0.94
341 0.94
342 0.95
343 0.95
344 0.93
345 0.9
346 0.85
347 0.77
348 0.67
349 0.56
350 0.45
351 0.35
352 0.28
353 0.19
354 0.15
355 0.13
356 0.12
357 0.13