Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6XVN1

Protein Details
Accession W6XVN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-56KPPGKNWPQAFQKRHPELKSRRVKAHydrophilic
440-462KEAAATKKGKRVGKRKEPPAGAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-47KRHP
50-50K
434-459RTKRAAKEAAATKKGKRVGKRKEPPA
Subcellular Location(s) mito 25.5, cyto_mito 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG bze:COCCADRAFT_42221  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
Amino Acid Sequences MSSLGKPVRIKFIPSLAFSVARRRCAANRASKPPGKNWPQAFQKRHPELKSRRVKAVDWQRHEKNIYPKITHWFEAIGEVLQDPAVRPENVYNMDETGVMLSMLGSVKVLVGKDDLRDYRGAGVKRTTVTAIECVNADGRSLLPLIIWPASTHRSNWTTYPTPGWHYAHSDNGYNDFKISLEWLIRVFDPQTKDRANGKPRVLICDGFGTHETLEILEFCFENNITLCRLPSHTSHKLQPCDVGPFAPLKAAYRDQVDRLNRGGVDTVGKEHFTSLYSPARERAFTRRNIMAGWKATGLFPFEPGKVLQDLPKPPTQLLVPAAGEVVVPCQPEEAPRTPVTPTTPVTTEALTSLHEMIKCDTLALDERSKQRIERRVQKLATAARVSFAELSLLQDHNRFLSKINGEIRARRSAKSMILGKAKVMTWEALEEARTKRAAKEAAATKKGKRVGKRKEPPAGAEAVGTKAGATQRSEAPTPWRAPVARMVAGDWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.46
3 0.39
4 0.41
5 0.38
6 0.43
7 0.4
8 0.4
9 0.4
10 0.41
11 0.43
12 0.47
13 0.55
14 0.55
15 0.6
16 0.64
17 0.72
18 0.73
19 0.73
20 0.73
21 0.75
22 0.72
23 0.72
24 0.69
25 0.68
26 0.73
27 0.78
28 0.78
29 0.77
30 0.79
31 0.79
32 0.82
33 0.79
34 0.79
35 0.78
36 0.81
37 0.82
38 0.77
39 0.76
40 0.71
41 0.67
42 0.67
43 0.68
44 0.68
45 0.65
46 0.69
47 0.66
48 0.69
49 0.7
50 0.67
51 0.66
52 0.64
53 0.62
54 0.56
55 0.55
56 0.57
57 0.58
58 0.52
59 0.43
60 0.35
61 0.29
62 0.27
63 0.24
64 0.16
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.07
71 0.1
72 0.14
73 0.13
74 0.15
75 0.17
76 0.22
77 0.25
78 0.26
79 0.23
80 0.2
81 0.2
82 0.19
83 0.17
84 0.12
85 0.08
86 0.07
87 0.06
88 0.05
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.09
99 0.1
100 0.12
101 0.18
102 0.18
103 0.19
104 0.2
105 0.2
106 0.24
107 0.28
108 0.28
109 0.25
110 0.27
111 0.28
112 0.29
113 0.29
114 0.24
115 0.2
116 0.2
117 0.2
118 0.18
119 0.15
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.11
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.06
131 0.06
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.1
137 0.14
138 0.16
139 0.16
140 0.2
141 0.22
142 0.24
143 0.26
144 0.29
145 0.29
146 0.29
147 0.32
148 0.28
149 0.3
150 0.34
151 0.33
152 0.28
153 0.3
154 0.3
155 0.31
156 0.31
157 0.3
158 0.25
159 0.28
160 0.28
161 0.23
162 0.21
163 0.16
164 0.15
165 0.12
166 0.13
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.13
176 0.16
177 0.17
178 0.22
179 0.22
180 0.26
181 0.32
182 0.39
183 0.42
184 0.46
185 0.46
186 0.46
187 0.46
188 0.48
189 0.43
190 0.35
191 0.3
192 0.26
193 0.24
194 0.19
195 0.19
196 0.15
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.08
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.11
217 0.12
218 0.15
219 0.23
220 0.28
221 0.31
222 0.37
223 0.42
224 0.43
225 0.41
226 0.4
227 0.33
228 0.3
229 0.27
230 0.21
231 0.15
232 0.14
233 0.13
234 0.12
235 0.1
236 0.08
237 0.11
238 0.12
239 0.12
240 0.14
241 0.15
242 0.16
243 0.23
244 0.23
245 0.23
246 0.23
247 0.23
248 0.2
249 0.19
250 0.18
251 0.12
252 0.11
253 0.1
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.16
264 0.17
265 0.17
266 0.2
267 0.21
268 0.22
269 0.23
270 0.29
271 0.3
272 0.33
273 0.37
274 0.35
275 0.35
276 0.34
277 0.35
278 0.3
279 0.25
280 0.22
281 0.18
282 0.17
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.11
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.14
291 0.14
292 0.15
293 0.13
294 0.14
295 0.16
296 0.2
297 0.23
298 0.26
299 0.29
300 0.28
301 0.27
302 0.28
303 0.24
304 0.21
305 0.19
306 0.18
307 0.15
308 0.14
309 0.14
310 0.12
311 0.12
312 0.08
313 0.08
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.1
320 0.15
321 0.17
322 0.2
323 0.21
324 0.23
325 0.23
326 0.25
327 0.27
328 0.25
329 0.23
330 0.22
331 0.22
332 0.23
333 0.23
334 0.21
335 0.18
336 0.14
337 0.13
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.14
345 0.16
346 0.15
347 0.13
348 0.12
349 0.11
350 0.15
351 0.17
352 0.19
353 0.22
354 0.27
355 0.3
356 0.32
357 0.34
358 0.38
359 0.44
360 0.5
361 0.56
362 0.6
363 0.65
364 0.65
365 0.64
366 0.62
367 0.58
368 0.55
369 0.47
370 0.39
371 0.31
372 0.3
373 0.29
374 0.22
375 0.17
376 0.12
377 0.1
378 0.12
379 0.13
380 0.14
381 0.14
382 0.15
383 0.16
384 0.16
385 0.19
386 0.16
387 0.15
388 0.22
389 0.23
390 0.28
391 0.32
392 0.38
393 0.38
394 0.45
395 0.47
396 0.5
397 0.5
398 0.44
399 0.44
400 0.41
401 0.41
402 0.43
403 0.45
404 0.42
405 0.47
406 0.46
407 0.43
408 0.42
409 0.39
410 0.32
411 0.28
412 0.22
413 0.16
414 0.16
415 0.17
416 0.14
417 0.15
418 0.17
419 0.18
420 0.21
421 0.22
422 0.23
423 0.24
424 0.3
425 0.32
426 0.3
427 0.37
428 0.43
429 0.49
430 0.56
431 0.58
432 0.55
433 0.59
434 0.64
435 0.62
436 0.63
437 0.64
438 0.68
439 0.75
440 0.81
441 0.84
442 0.86
443 0.84
444 0.78
445 0.72
446 0.64
447 0.53
448 0.45
449 0.36
450 0.28
451 0.24
452 0.19
453 0.14
454 0.14
455 0.17
456 0.18
457 0.19
458 0.21
459 0.26
460 0.31
461 0.33
462 0.32
463 0.36
464 0.41
465 0.42
466 0.41
467 0.42
468 0.38
469 0.39
470 0.45
471 0.44
472 0.4
473 0.37