Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YSA4

Protein Details
Accession W6YSA4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-125QQPQRYHGTRPQRQQQQQYKLQAKVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10.5, cyto 8.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027267  AH/BAR_dom_sf  
IPR001683  PX_dom  
IPR036871  PX_dom_sf  
IPR014461  Retromer_complex_Vps17  
IPR037907  Vps17_PX  
IPR015404  Vps5_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030904  C:retromer complex  
GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
KEGG bze:COCCADRAFT_32499  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00787  PX  
PF09325  Vps5  
CDD cd06891  PX_Vps17p  
Amino Acid Sequences MDYSAHDPDHPAGGDPWASSPQANRSSFGQPPTNDIPSSPLPAQASPYGENSEQYGYLGEQDAQSRPGTAPENGDQSQQQQAHGQDAPRSPQPQQQGQQGQQPQRYHGTRPQRQQQQQYKLQAKVTGLERNGKKDPIIRFDVYVRLYKFNMAKACLRNTNLPKFRTTQFRDVRRLHSEFVKLGEHLISACPEAIVPAVPPATTSAGAGTDEDEARLKISIQRWLNIVCSNEILIRDEEMVFFVESDFGYSPVVRRKQPATGVRRKMIKQFAPPPDDTPELAAARPVVKAFYLGTMEAEQKLEKVVKHRRNLGVAESDLGAKFAALQVQETHVGLAHAYKKLGKIIQATGDFHAAQGTAEATTLGDPLQYHSSDAFIAKETLTNRHIILRELLQAQSATKSKLSAADRLKASSSVKREKVDEAIAALDEARSHEQYLMQKAQRVTANLLQEQRRWFDRTTHDMRQAIREYVVRQIEAERRTLATLESVRPDIRAIDGSGGLSRLGREAHPPQRRVPMASSQGPKGDAWSGVPRRPGDGLNRSMSGSFVAPLPETDENDEETIHGRKRATSKAGSQAGVEEDDDRIDAKNAASRLATTTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.2
4 0.18
5 0.19
6 0.18
7 0.21
8 0.27
9 0.35
10 0.36
11 0.35
12 0.37
13 0.42
14 0.45
15 0.47
16 0.46
17 0.38
18 0.44
19 0.48
20 0.47
21 0.42
22 0.37
23 0.37
24 0.33
25 0.38
26 0.31
27 0.29
28 0.27
29 0.28
30 0.31
31 0.29
32 0.3
33 0.27
34 0.29
35 0.29
36 0.27
37 0.27
38 0.25
39 0.24
40 0.2
41 0.18
42 0.16
43 0.12
44 0.13
45 0.14
46 0.13
47 0.12
48 0.15
49 0.16
50 0.17
51 0.17
52 0.17
53 0.16
54 0.19
55 0.21
56 0.2
57 0.24
58 0.26
59 0.32
60 0.31
61 0.33
62 0.3
63 0.29
64 0.35
65 0.31
66 0.29
67 0.27
68 0.27
69 0.3
70 0.31
71 0.31
72 0.29
73 0.31
74 0.34
75 0.35
76 0.37
77 0.35
78 0.37
79 0.43
80 0.46
81 0.47
82 0.53
83 0.55
84 0.55
85 0.61
86 0.64
87 0.64
88 0.62
89 0.59
90 0.53
91 0.53
92 0.53
93 0.5
94 0.51
95 0.55
96 0.56
97 0.64
98 0.7
99 0.72
100 0.77
101 0.82
102 0.84
103 0.82
104 0.82
105 0.83
106 0.8
107 0.73
108 0.68
109 0.61
110 0.51
111 0.47
112 0.43
113 0.4
114 0.34
115 0.39
116 0.39
117 0.42
118 0.45
119 0.4
120 0.38
121 0.38
122 0.41
123 0.39
124 0.43
125 0.38
126 0.36
127 0.37
128 0.4
129 0.36
130 0.37
131 0.32
132 0.29
133 0.28
134 0.31
135 0.31
136 0.31
137 0.32
138 0.29
139 0.34
140 0.36
141 0.41
142 0.41
143 0.42
144 0.45
145 0.49
146 0.56
147 0.57
148 0.54
149 0.51
150 0.5
151 0.52
152 0.53
153 0.52
154 0.52
155 0.54
156 0.61
157 0.66
158 0.67
159 0.69
160 0.66
161 0.63
162 0.55
163 0.51
164 0.46
165 0.38
166 0.36
167 0.31
168 0.23
169 0.21
170 0.19
171 0.14
172 0.11
173 0.11
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.11
205 0.13
206 0.2
207 0.21
208 0.23
209 0.24
210 0.25
211 0.26
212 0.24
213 0.23
214 0.16
215 0.15
216 0.14
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.09
238 0.16
239 0.2
240 0.2
241 0.23
242 0.25
243 0.29
244 0.37
245 0.44
246 0.46
247 0.52
248 0.57
249 0.58
250 0.61
251 0.59
252 0.58
253 0.56
254 0.51
255 0.49
256 0.52
257 0.54
258 0.53
259 0.52
260 0.47
261 0.44
262 0.41
263 0.33
264 0.26
265 0.21
266 0.17
267 0.16
268 0.14
269 0.11
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.17
291 0.27
292 0.34
293 0.38
294 0.45
295 0.46
296 0.48
297 0.48
298 0.42
299 0.35
300 0.28
301 0.24
302 0.18
303 0.16
304 0.12
305 0.11
306 0.08
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.06
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.08
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.08
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.12
326 0.12
327 0.15
328 0.16
329 0.16
330 0.16
331 0.17
332 0.22
333 0.22
334 0.23
335 0.21
336 0.22
337 0.19
338 0.16
339 0.15
340 0.1
341 0.08
342 0.07
343 0.06
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.07
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.1
362 0.08
363 0.09
364 0.08
365 0.11
366 0.11
367 0.15
368 0.16
369 0.16
370 0.16
371 0.2
372 0.2
373 0.19
374 0.2
375 0.17
376 0.19
377 0.2
378 0.19
379 0.15
380 0.15
381 0.14
382 0.16
383 0.16
384 0.14
385 0.13
386 0.14
387 0.14
388 0.2
389 0.22
390 0.26
391 0.28
392 0.33
393 0.34
394 0.35
395 0.35
396 0.31
397 0.32
398 0.3
399 0.34
400 0.36
401 0.4
402 0.41
403 0.42
404 0.41
405 0.42
406 0.38
407 0.31
408 0.23
409 0.19
410 0.16
411 0.14
412 0.12
413 0.08
414 0.06
415 0.08
416 0.1
417 0.1
418 0.1
419 0.11
420 0.15
421 0.19
422 0.25
423 0.31
424 0.3
425 0.34
426 0.34
427 0.38
428 0.37
429 0.35
430 0.33
431 0.3
432 0.33
433 0.32
434 0.38
435 0.36
436 0.37
437 0.37
438 0.36
439 0.36
440 0.35
441 0.33
442 0.34
443 0.39
444 0.44
445 0.49
446 0.52
447 0.55
448 0.55
449 0.55
450 0.55
451 0.51
452 0.43
453 0.38
454 0.34
455 0.28
456 0.32
457 0.32
458 0.25
459 0.22
460 0.26
461 0.3
462 0.29
463 0.3
464 0.24
465 0.24
466 0.24
467 0.24
468 0.19
469 0.18
470 0.2
471 0.21
472 0.22
473 0.24
474 0.23
475 0.23
476 0.23
477 0.18
478 0.17
479 0.16
480 0.14
481 0.13
482 0.14
483 0.14
484 0.14
485 0.14
486 0.12
487 0.1
488 0.1
489 0.09
490 0.1
491 0.1
492 0.17
493 0.25
494 0.35
495 0.43
496 0.46
497 0.5
498 0.58
499 0.59
500 0.57
501 0.52
502 0.51
503 0.5
504 0.55
505 0.54
506 0.47
507 0.47
508 0.45
509 0.4
510 0.34
511 0.29
512 0.22
513 0.21
514 0.28
515 0.32
516 0.34
517 0.39
518 0.37
519 0.38
520 0.39
521 0.4
522 0.39
523 0.42
524 0.44
525 0.43
526 0.43
527 0.41
528 0.39
529 0.35
530 0.28
531 0.2
532 0.15
533 0.12
534 0.12
535 0.12
536 0.12
537 0.17
538 0.18
539 0.19
540 0.22
541 0.22
542 0.23
543 0.23
544 0.23
545 0.18
546 0.19
547 0.23
548 0.22
549 0.25
550 0.23
551 0.29
552 0.36
553 0.43
554 0.47
555 0.48
556 0.52
557 0.58
558 0.63
559 0.58
560 0.52
561 0.46
562 0.41
563 0.35
564 0.29
565 0.2
566 0.15
567 0.14
568 0.14
569 0.13
570 0.11
571 0.12
572 0.13
573 0.13
574 0.18
575 0.18
576 0.2
577 0.2
578 0.2