Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YEM9

Protein Details
Accession W6YEM9    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-41VLESPPKRARTTRKPPASARRGKVSVHydrophilic
225-249SRVVVQKPPSPKKKEPEATKGKWKEHydrophilic
853-872AEEAEKRRKEREKREKFLLGBasic
1063-1082RGRGRGRPRGRGTKAPARLTBasic
1089-1117SNPPSPPPSRRTAPRRKAARKSDAHVRSHHydrophilic
1130-1156TDMTDRASPKKKSTRGRGAGRGKDKGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-38PKRARTTRKPPASARRGK
231-285KPPSPKKKEPEATKGKWKESGKAGVKVYESPQKRMGVRNKAKSKGEKPSERDKRT
444-448KAKKP
858-868KRRKEREKREK
1061-1109GGRGRGRGRPRGRGTKAPARLTPLSDAPSNPPSPPPSRRTAPRRKAARK
1137-1163SPKKKSTRGRGAGRGKDKGRGKAGKAK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG bze:COCCADRAFT_88906  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MPPIISRKRLHSTSPVLESPPKRARTTRKPPASARRGKVSVFQTLDAPPKTKRTLSQTKALLEEGEEDGDSESSESETTEDEFEDVPLHGVNKDKGKVKAQPDEDSDESEDGDWEDALGTHHYTKPDNGPAPIITGDIALTLSAAPKTAFETKPDGKKGPSKVQRQIRTITHCMHVQFLMFHNLMRNTWIQDKEVQKILVQAMSPGCWRELEKYWNDAGIRDGFSRVVVQKPPSPKKKEPEATKGKWKESGKAGVKVYESPQKRMGVRNKAKSKGEKPSERDKRTRDWGAAAEPLEPNSPNLSAGDPLIRLLKYLSAYWKSKFQITAPSLRKRGYLSPSVLEAEIKAWKDDPNHPETFGERVEDITAFRECAKQCQGSRDIGEQLFTALIRGLGIEARMVVSLQPAGFGWSQSEEGKPKNLEKLNNSKPADNQSTEKETPTKSKAKKPATAKKTGGLIDVSMDDSSDLSSVISISSDSEDNRPQKRSPKARNYGEELPYPTYWTEAISHLTHTPISVSPLPRTIIASAASPEKLMDFYARGAAADKAKQILAYLIAFSSDGSAKDVTTRYLPKHQWPGRTKGFRMPVEKVPIHNKHGKVKRWEEWDWCKSLMRPYARSHDKRQPWDEVEDEGDLVPAQVERKKGMDEEGGKETLQGYKNSTEYVLERHLRREEALRRGAKIVRFFVTGKGDNEKSEPVYRRKDIVLCKTQESWHKEGREVLEGQQPLKLVPMRAVTVTRKREIEERERIEGGKVKQGLYSKEQTDWIIPDPIVDGKIPRNAFGNIDVYVPTMVPKGAVHVPLKGTARICRKLNIDYAEACTGFEFGKQRAVPVITGVVVAAEHEDMLIDAWEAEEAEKRRKEREKREKFLLGLWRRFASGLRIVNRMREEYGEDVELPVKEKVLPPKDEKEKPETRKSRWEVFEAQTDFEGGFVREDVQLSGGGGFMPDKAHQTAEGDLDMAGGFLPASQEEDEELIIDHGEKKDLRAPVMETAHRTPISLTQALQRPPSEPSEDPDHNEAMSIDQDTEDEHEGNRNDEDEEYEHSKLESDHGKSTAAISGGRGRGRGRPRGRGTKAPARLTPLSDAPSNPPSPPPSRRTAPRRKAARKSDAHVRSHFFAEASEGETDLTDMTDRASPKKKSTRGRGAGRGKDKGRGKAGKAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.58
3 0.53
4 0.58
5 0.55
6 0.56
7 0.56
8 0.54
9 0.53
10 0.59
11 0.66
12 0.68
13 0.77
14 0.78
15 0.8
16 0.83
17 0.87
18 0.9
19 0.9
20 0.89
21 0.84
22 0.83
23 0.76
24 0.7
25 0.68
26 0.61
27 0.59
28 0.52
29 0.46
30 0.39
31 0.4
32 0.46
33 0.41
34 0.4
35 0.34
36 0.39
37 0.43
38 0.44
39 0.46
40 0.49
41 0.57
42 0.59
43 0.64
44 0.63
45 0.61
46 0.6
47 0.54
48 0.44
49 0.34
50 0.32
51 0.25
52 0.19
53 0.15
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.09
59 0.08
60 0.07
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.16
78 0.2
79 0.26
80 0.31
81 0.37
82 0.41
83 0.47
84 0.54
85 0.57
86 0.62
87 0.6
88 0.61
89 0.59
90 0.62
91 0.56
92 0.51
93 0.46
94 0.37
95 0.32
96 0.26
97 0.22
98 0.15
99 0.14
100 0.1
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.11
107 0.14
108 0.17
109 0.19
110 0.21
111 0.24
112 0.3
113 0.37
114 0.38
115 0.36
116 0.37
117 0.35
118 0.35
119 0.32
120 0.26
121 0.17
122 0.14
123 0.12
124 0.09
125 0.09
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.12
135 0.19
136 0.2
137 0.22
138 0.31
139 0.38
140 0.46
141 0.51
142 0.5
143 0.48
144 0.55
145 0.6
146 0.62
147 0.64
148 0.65
149 0.69
150 0.76
151 0.79
152 0.76
153 0.75
154 0.72
155 0.71
156 0.67
157 0.61
158 0.55
159 0.49
160 0.45
161 0.41
162 0.33
163 0.26
164 0.22
165 0.21
166 0.23
167 0.2
168 0.2
169 0.22
170 0.23
171 0.22
172 0.23
173 0.23
174 0.2
175 0.27
176 0.28
177 0.25
178 0.31
179 0.35
180 0.36
181 0.4
182 0.37
183 0.31
184 0.33
185 0.32
186 0.27
187 0.23
188 0.22
189 0.18
190 0.18
191 0.19
192 0.16
193 0.15
194 0.14
195 0.16
196 0.18
197 0.23
198 0.29
199 0.31
200 0.35
201 0.35
202 0.37
203 0.36
204 0.31
205 0.29
206 0.25
207 0.24
208 0.2
209 0.2
210 0.17
211 0.17
212 0.2
213 0.19
214 0.2
215 0.22
216 0.25
217 0.3
218 0.4
219 0.5
220 0.56
221 0.63
222 0.66
223 0.7
224 0.77
225 0.81
226 0.79
227 0.8
228 0.81
229 0.78
230 0.81
231 0.79
232 0.72
233 0.7
234 0.64
235 0.59
236 0.56
237 0.59
238 0.55
239 0.55
240 0.53
241 0.48
242 0.47
243 0.43
244 0.41
245 0.39
246 0.36
247 0.33
248 0.38
249 0.39
250 0.41
251 0.47
252 0.53
253 0.55
254 0.62
255 0.68
256 0.71
257 0.73
258 0.78
259 0.78
260 0.76
261 0.75
262 0.76
263 0.74
264 0.72
265 0.76
266 0.8
267 0.78
268 0.79
269 0.73
270 0.72
271 0.72
272 0.71
273 0.62
274 0.55
275 0.5
276 0.45
277 0.43
278 0.35
279 0.29
280 0.24
281 0.22
282 0.2
283 0.17
284 0.16
285 0.14
286 0.13
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.13
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.13
300 0.13
301 0.14
302 0.2
303 0.23
304 0.26
305 0.28
306 0.34
307 0.33
308 0.35
309 0.35
310 0.3
311 0.34
312 0.34
313 0.43
314 0.44
315 0.5
316 0.5
317 0.49
318 0.49
319 0.43
320 0.46
321 0.42
322 0.41
323 0.36
324 0.34
325 0.35
326 0.34
327 0.31
328 0.24
329 0.19
330 0.14
331 0.15
332 0.14
333 0.13
334 0.12
335 0.15
336 0.19
337 0.26
338 0.3
339 0.33
340 0.33
341 0.34
342 0.34
343 0.33
344 0.31
345 0.24
346 0.21
347 0.14
348 0.13
349 0.13
350 0.13
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.11
356 0.15
357 0.15
358 0.2
359 0.24
360 0.28
361 0.29
362 0.35
363 0.38
364 0.36
365 0.38
366 0.35
367 0.35
368 0.29
369 0.27
370 0.21
371 0.18
372 0.15
373 0.12
374 0.09
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.11
399 0.11
400 0.14
401 0.14
402 0.16
403 0.2
404 0.22
405 0.22
406 0.29
407 0.32
408 0.34
409 0.38
410 0.47
411 0.5
412 0.57
413 0.57
414 0.5
415 0.49
416 0.51
417 0.49
418 0.41
419 0.36
420 0.31
421 0.37
422 0.36
423 0.35
424 0.31
425 0.29
426 0.32
427 0.36
428 0.41
429 0.39
430 0.47
431 0.55
432 0.59
433 0.64
434 0.69
435 0.73
436 0.71
437 0.74
438 0.67
439 0.6
440 0.57
441 0.51
442 0.42
443 0.32
444 0.25
445 0.17
446 0.16
447 0.13
448 0.08
449 0.07
450 0.06
451 0.05
452 0.06
453 0.05
454 0.04
455 0.03
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.03
461 0.04
462 0.05
463 0.06
464 0.07
465 0.1
466 0.16
467 0.21
468 0.25
469 0.28
470 0.3
471 0.38
472 0.47
473 0.55
474 0.59
475 0.65
476 0.7
477 0.74
478 0.75
479 0.74
480 0.71
481 0.63
482 0.55
483 0.47
484 0.4
485 0.33
486 0.3
487 0.23
488 0.17
489 0.14
490 0.12
491 0.11
492 0.09
493 0.12
494 0.11
495 0.13
496 0.12
497 0.13
498 0.12
499 0.1
500 0.1
501 0.08
502 0.11
503 0.13
504 0.14
505 0.14
506 0.17
507 0.17
508 0.16
509 0.17
510 0.14
511 0.12
512 0.11
513 0.11
514 0.1
515 0.11
516 0.1
517 0.09
518 0.09
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.06
524 0.06
525 0.08
526 0.08
527 0.07
528 0.08
529 0.1
530 0.11
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.11
535 0.11
536 0.1
537 0.08
538 0.08
539 0.07
540 0.06
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.06
546 0.05
547 0.05
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.09
552 0.1
553 0.1
554 0.12
555 0.15
556 0.16
557 0.24
558 0.26
559 0.29
560 0.39
561 0.42
562 0.48
563 0.49
564 0.55
565 0.56
566 0.59
567 0.55
568 0.51
569 0.55
570 0.49
571 0.49
572 0.46
573 0.41
574 0.43
575 0.42
576 0.38
577 0.39
578 0.39
579 0.4
580 0.41
581 0.4
582 0.42
583 0.49
584 0.53
585 0.52
586 0.55
587 0.56
588 0.57
589 0.57
590 0.55
591 0.57
592 0.54
593 0.48
594 0.43
595 0.38
596 0.33
597 0.35
598 0.33
599 0.28
600 0.29
601 0.3
602 0.39
603 0.47
604 0.5
605 0.52
606 0.54
607 0.58
608 0.6
609 0.61
610 0.57
611 0.51
612 0.49
613 0.43
614 0.35
615 0.29
616 0.22
617 0.19
618 0.13
619 0.1
620 0.07
621 0.06
622 0.05
623 0.04
624 0.05
625 0.07
626 0.08
627 0.09
628 0.11
629 0.12
630 0.12
631 0.14
632 0.17
633 0.18
634 0.21
635 0.22
636 0.22
637 0.21
638 0.21
639 0.19
640 0.19
641 0.18
642 0.15
643 0.15
644 0.17
645 0.17
646 0.17
647 0.17
648 0.14
649 0.12
650 0.14
651 0.17
652 0.2
653 0.2
654 0.24
655 0.25
656 0.25
657 0.25
658 0.3
659 0.31
660 0.34
661 0.41
662 0.39
663 0.38
664 0.4
665 0.43
666 0.38
667 0.35
668 0.31
669 0.25
670 0.25
671 0.25
672 0.25
673 0.27
674 0.27
675 0.25
676 0.27
677 0.26
678 0.24
679 0.25
680 0.23
681 0.2
682 0.24
683 0.28
684 0.3
685 0.36
686 0.36
687 0.37
688 0.38
689 0.41
690 0.42
691 0.45
692 0.46
693 0.42
694 0.43
695 0.42
696 0.44
697 0.46
698 0.46
699 0.42
700 0.4
701 0.39
702 0.38
703 0.4
704 0.38
705 0.34
706 0.29
707 0.26
708 0.26
709 0.25
710 0.24
711 0.22
712 0.2
713 0.16
714 0.17
715 0.16
716 0.11
717 0.13
718 0.15
719 0.14
720 0.15
721 0.18
722 0.21
723 0.29
724 0.33
725 0.33
726 0.32
727 0.33
728 0.38
729 0.42
730 0.45
731 0.46
732 0.46
733 0.46
734 0.46
735 0.45
736 0.41
737 0.4
738 0.33
739 0.29
740 0.26
741 0.23
742 0.25
743 0.28
744 0.29
745 0.28
746 0.32
747 0.27
748 0.27
749 0.28
750 0.26
751 0.25
752 0.23
753 0.2
754 0.17
755 0.15
756 0.14
757 0.14
758 0.13
759 0.13
760 0.11
761 0.11
762 0.11
763 0.17
764 0.17
765 0.17
766 0.19
767 0.19
768 0.2
769 0.21
770 0.2
771 0.15
772 0.15
773 0.14
774 0.12
775 0.12
776 0.11
777 0.09
778 0.07
779 0.06
780 0.06
781 0.06
782 0.09
783 0.11
784 0.16
785 0.16
786 0.18
787 0.19
788 0.23
789 0.25
790 0.24
791 0.23
792 0.26
793 0.33
794 0.37
795 0.38
796 0.38
797 0.4
798 0.4
799 0.44
800 0.41
801 0.36
802 0.31
803 0.33
804 0.3
805 0.27
806 0.23
807 0.17
808 0.15
809 0.12
810 0.13
811 0.12
812 0.11
813 0.18
814 0.18
815 0.18
816 0.21
817 0.22
818 0.19
819 0.18
820 0.18
821 0.11
822 0.11
823 0.1
824 0.07
825 0.06
826 0.06
827 0.05
828 0.04
829 0.04
830 0.03
831 0.03
832 0.03
833 0.04
834 0.04
835 0.03
836 0.03
837 0.03
838 0.04
839 0.04
840 0.04
841 0.09
842 0.12
843 0.2
844 0.24
845 0.26
846 0.35
847 0.44
848 0.54
849 0.61
850 0.7
851 0.73
852 0.76
853 0.83
854 0.8
855 0.71
856 0.68
857 0.67
858 0.64
859 0.58
860 0.53
861 0.45
862 0.4
863 0.4
864 0.34
865 0.29
866 0.27
867 0.29
868 0.29
869 0.35
870 0.34
871 0.39
872 0.41
873 0.38
874 0.31
875 0.26
876 0.26
877 0.23
878 0.25
879 0.2
880 0.18
881 0.17
882 0.18
883 0.17
884 0.16
885 0.13
886 0.12
887 0.12
888 0.16
889 0.25
890 0.3
891 0.35
892 0.39
893 0.48
894 0.57
895 0.62
896 0.63
897 0.63
898 0.66
899 0.68
900 0.73
901 0.72
902 0.69
903 0.73
904 0.74
905 0.75
906 0.68
907 0.66
908 0.62
909 0.57
910 0.59
911 0.5
912 0.45
913 0.35
914 0.32
915 0.26
916 0.2
917 0.18
918 0.09
919 0.08
920 0.07
921 0.09
922 0.09
923 0.1
924 0.1
925 0.09
926 0.09
927 0.09
928 0.09
929 0.07
930 0.06
931 0.06
932 0.06
933 0.06
934 0.07
935 0.08
936 0.11
937 0.12
938 0.13
939 0.13
940 0.15
941 0.16
942 0.16
943 0.15
944 0.13
945 0.11
946 0.11
947 0.1
948 0.08
949 0.06
950 0.04
951 0.04
952 0.03
953 0.04
954 0.04
955 0.07
956 0.07
957 0.07
958 0.08
959 0.09
960 0.09
961 0.09
962 0.09
963 0.07
964 0.07
965 0.07
966 0.1
967 0.1
968 0.14
969 0.14
970 0.16
971 0.22
972 0.24
973 0.25
974 0.25
975 0.27
976 0.3
977 0.36
978 0.36
979 0.35
980 0.35
981 0.4
982 0.37
983 0.35
984 0.29
985 0.29
986 0.32
987 0.29
988 0.27
989 0.28
990 0.35
991 0.37
992 0.4
993 0.35
994 0.31
995 0.32
996 0.36
997 0.34
998 0.29
999 0.31
1000 0.35
1001 0.37
1002 0.39
1003 0.39
1004 0.36
1005 0.3
1006 0.29
1007 0.25
1008 0.18
1009 0.17
1010 0.14
1011 0.1
1012 0.09
1013 0.1
1014 0.1
1015 0.13
1016 0.13
1017 0.12
1018 0.12
1019 0.18
1020 0.19
1021 0.21
1022 0.21
1023 0.19
1024 0.18
1025 0.18
1026 0.2
1027 0.16
1028 0.21
1029 0.24
1030 0.23
1031 0.23
1032 0.22
1033 0.22
1034 0.2
1035 0.23
1036 0.25
1037 0.24
1038 0.28
1039 0.28
1040 0.29
1041 0.28
1042 0.29
1043 0.27
1044 0.21
1045 0.18
1046 0.16
1047 0.22
1048 0.26
1049 0.27
1050 0.28
1051 0.27
1052 0.34
1053 0.42
1054 0.5
1055 0.51
1056 0.56
1057 0.65
1058 0.73
1059 0.78
1060 0.79
1061 0.8
1062 0.8
1063 0.81
1064 0.77
1065 0.7
1066 0.67
1067 0.64
1068 0.57
1069 0.53
1070 0.47
1071 0.41
1072 0.37
1073 0.36
1074 0.34
1075 0.37
1076 0.36
1077 0.32
1078 0.33
1079 0.36
1080 0.42
1081 0.48
1082 0.48
1083 0.49
1084 0.56
1085 0.65
1086 0.71
1087 0.76
1088 0.78
1089 0.8
1090 0.86
1091 0.89
1092 0.91
1093 0.91
1094 0.91
1095 0.87
1096 0.83
1097 0.84
1098 0.81
1099 0.78
1100 0.73
1101 0.68
1102 0.61
1103 0.56
1104 0.5
1105 0.4
1106 0.31
1107 0.28
1108 0.23
1109 0.2
1110 0.17
1111 0.15
1112 0.14
1113 0.14
1114 0.14
1115 0.1
1116 0.09
1117 0.07
1118 0.07
1119 0.08
1120 0.12
1121 0.14
1122 0.22
1123 0.31
1124 0.35
1125 0.45
1126 0.55
1127 0.63
1128 0.69
1129 0.78
1130 0.82
1131 0.83
1132 0.88
1133 0.88
1134 0.88
1135 0.89
1136 0.87
1137 0.85
1138 0.77
1139 0.76
1140 0.73
1141 0.71
1142 0.71
1143 0.69