Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6XXY5

Protein Details
Accession W6XXY5    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-32ISSHSGAPAKKRKPSNLRNAFSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-22APAKKRK
65-73SKKRRKKGG
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG bze:COCCADRAFT_98972  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MSSNRKRGSISSHSGAPAKKRKPSNLRNAFSPDAESIGGSPRQYSRSPSVESNITTSVINGVGGSKKRRKKGGDGGSVAGSSVRGGKSGDGRSAVGGEDEGEEEDDDEDEMGEEMGMEIEGGMSVEARRKQEKEYERMLEDFMTPAQMDRYATYRRIRLKRETVRKLVNQTLSQSVPQPIIIAVTSYSKTFIGELIDRALTVRDEWSAVRTHLPNPDLPGPILSQSLGRPSAHIKDERNKPTNTDIQSAGWYLNQVDRTQGIWKEVDKNASLQERLRACDKGPLTPAHLREALRRYKRDRDGGGAGFAGMSLEGVERTMGRTGGKRLFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.51
3 0.52
4 0.53
5 0.52
6 0.57
7 0.61
8 0.69
9 0.75
10 0.82
11 0.83
12 0.84
13 0.81
14 0.78
15 0.78
16 0.7
17 0.6
18 0.52
19 0.42
20 0.33
21 0.29
22 0.23
23 0.16
24 0.18
25 0.19
26 0.16
27 0.17
28 0.18
29 0.22
30 0.24
31 0.29
32 0.31
33 0.35
34 0.39
35 0.39
36 0.41
37 0.41
38 0.4
39 0.38
40 0.32
41 0.27
42 0.23
43 0.2
44 0.17
45 0.13
46 0.12
47 0.08
48 0.09
49 0.13
50 0.17
51 0.25
52 0.33
53 0.4
54 0.47
55 0.56
56 0.59
57 0.64
58 0.71
59 0.73
60 0.73
61 0.69
62 0.65
63 0.57
64 0.52
65 0.42
66 0.31
67 0.2
68 0.11
69 0.11
70 0.09
71 0.08
72 0.09
73 0.11
74 0.18
75 0.2
76 0.22
77 0.2
78 0.2
79 0.2
80 0.2
81 0.18
82 0.12
83 0.09
84 0.08
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.02
105 0.02
106 0.02
107 0.02
108 0.02
109 0.02
110 0.03
111 0.03
112 0.08
113 0.11
114 0.14
115 0.18
116 0.19
117 0.22
118 0.31
119 0.37
120 0.39
121 0.43
122 0.44
123 0.41
124 0.41
125 0.39
126 0.31
127 0.24
128 0.18
129 0.12
130 0.09
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.11
138 0.12
139 0.17
140 0.2
141 0.24
142 0.33
143 0.39
144 0.43
145 0.47
146 0.55
147 0.6
148 0.68
149 0.69
150 0.66
151 0.66
152 0.64
153 0.62
154 0.56
155 0.5
156 0.41
157 0.36
158 0.33
159 0.28
160 0.25
161 0.22
162 0.18
163 0.14
164 0.13
165 0.11
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.09
194 0.1
195 0.11
196 0.14
197 0.15
198 0.17
199 0.21
200 0.23
201 0.22
202 0.25
203 0.28
204 0.25
205 0.24
206 0.22
207 0.18
208 0.18
209 0.17
210 0.13
211 0.1
212 0.1
213 0.13
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.16
218 0.21
219 0.24
220 0.28
221 0.3
222 0.38
223 0.47
224 0.55
225 0.58
226 0.54
227 0.53
228 0.55
229 0.57
230 0.51
231 0.45
232 0.37
233 0.32
234 0.33
235 0.3
236 0.24
237 0.17
238 0.14
239 0.12
240 0.14
241 0.14
242 0.13
243 0.14
244 0.14
245 0.15
246 0.2
247 0.21
248 0.2
249 0.2
250 0.23
251 0.28
252 0.3
253 0.32
254 0.28
255 0.28
256 0.31
257 0.33
258 0.33
259 0.28
260 0.33
261 0.31
262 0.33
263 0.35
264 0.32
265 0.28
266 0.34
267 0.33
268 0.32
269 0.33
270 0.33
271 0.36
272 0.4
273 0.41
274 0.39
275 0.42
276 0.37
277 0.41
278 0.46
279 0.5
280 0.53
281 0.59
282 0.61
283 0.67
284 0.74
285 0.75
286 0.71
287 0.68
288 0.67
289 0.61
290 0.56
291 0.46
292 0.37
293 0.28
294 0.23
295 0.16
296 0.08
297 0.06
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.09
305 0.11
306 0.12
307 0.14
308 0.19
309 0.26