Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YMD4

Protein Details
Accession W6YMD4    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MPKEHKKRGRREEQKKRKRDADDDASSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-20KEHKKRGRREEQKKRKRD
664-679AAAKAAQGKDGKKSKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR040000  NOP9  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG bze:COCCADRAFT_26956  -  
Amino Acid Sequences MPKEHKKRGRREEQKKRKRDADDDASSKRPKHEDSDLFHVQDSVQELANGQISRPNESPFYGMLDEQEQEYFKKADEMLELNQFESTEDRDIFLASVWKEADGKELKIANSQSSRLLERLILLSSPDQLKSLFQKFSGHFLNLVQNRFASHCCEALFIKAAPAVTEETVKAEPLQTPPASDPDEVVVSMENLFLFTLGELEGYMGFLMTDKYASHVLRVLLIILSGAPLEKQTKSVMQSKKKEKITVSGAEKGQERVLEERVVPQSFLDALEKVISDSVSGIESHYLRSLTTHPLGGPTLQLLLKLELAHFGKSRAKNEKSIIHRLLPDNPIAEGTESAILINGLVYDTVGSRLLETIIENAPGKLFKAIYGEFFKERMGNLSRNEIAGYVVGKILERLGKDDLEEAMRQIVDQIPSLVERNRTAVIKVLIERCVAREVNCAPITAQLEAAYAGSNGFEVTRILRLNEEEGKLRARHVQSPEKVHGSLLAQTMMTVDGPLGQLVFDSLANLSPELATQLARDPTASRTLQAALMSENASVIFRRKMIQLFYGKIGELALDPAASHVIDAIWQGTAGLAFIRERIAEELAENESSLRESHVGRAVWRNWRMDLYKRRRNDWVTQSRYTAGNQGFQSFPEGTSDAPQNPKAGRQLTAIELARQKHAAAKAAQGKDGKKSKKGSQATNGSVSSGSSSKGKSVAAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.96
2 0.95
3 0.94
4 0.92
5 0.89
6 0.86
7 0.85
8 0.84
9 0.82
10 0.79
11 0.75
12 0.73
13 0.69
14 0.64
15 0.6
16 0.56
17 0.51
18 0.5
19 0.55
20 0.56
21 0.57
22 0.63
23 0.62
24 0.57
25 0.53
26 0.46
27 0.36
28 0.3
29 0.27
30 0.2
31 0.14
32 0.13
33 0.13
34 0.15
35 0.2
36 0.17
37 0.14
38 0.17
39 0.18
40 0.24
41 0.25
42 0.26
43 0.23
44 0.25
45 0.27
46 0.24
47 0.27
48 0.23
49 0.21
50 0.2
51 0.2
52 0.19
53 0.18
54 0.19
55 0.15
56 0.14
57 0.18
58 0.17
59 0.15
60 0.18
61 0.18
62 0.18
63 0.21
64 0.24
65 0.23
66 0.3
67 0.3
68 0.26
69 0.26
70 0.24
71 0.21
72 0.19
73 0.18
74 0.15
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.16
80 0.15
81 0.17
82 0.13
83 0.16
84 0.15
85 0.16
86 0.16
87 0.16
88 0.23
89 0.21
90 0.22
91 0.24
92 0.28
93 0.27
94 0.32
95 0.34
96 0.32
97 0.32
98 0.33
99 0.32
100 0.31
101 0.33
102 0.28
103 0.28
104 0.22
105 0.2
106 0.21
107 0.17
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.16
112 0.17
113 0.16
114 0.15
115 0.14
116 0.18
117 0.23
118 0.28
119 0.26
120 0.25
121 0.31
122 0.31
123 0.37
124 0.38
125 0.32
126 0.27
127 0.28
128 0.36
129 0.33
130 0.34
131 0.29
132 0.25
133 0.25
134 0.26
135 0.26
136 0.22
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.21
141 0.2
142 0.2
143 0.22
144 0.16
145 0.16
146 0.15
147 0.15
148 0.13
149 0.14
150 0.13
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.12
158 0.12
159 0.14
160 0.15
161 0.2
162 0.17
163 0.19
164 0.2
165 0.24
166 0.25
167 0.23
168 0.21
169 0.17
170 0.18
171 0.16
172 0.15
173 0.11
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.04
198 0.07
199 0.11
200 0.11
201 0.12
202 0.15
203 0.15
204 0.15
205 0.15
206 0.14
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.05
216 0.08
217 0.08
218 0.1
219 0.11
220 0.15
221 0.19
222 0.27
223 0.35
224 0.42
225 0.51
226 0.59
227 0.66
228 0.67
229 0.68
230 0.61
231 0.6
232 0.56
233 0.55
234 0.5
235 0.47
236 0.43
237 0.41
238 0.4
239 0.34
240 0.29
241 0.22
242 0.19
243 0.16
244 0.17
245 0.16
246 0.15
247 0.18
248 0.21
249 0.2
250 0.19
251 0.16
252 0.15
253 0.14
254 0.14
255 0.11
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.1
276 0.12
277 0.14
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.15
282 0.16
283 0.14
284 0.12
285 0.08
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.12
298 0.14
299 0.2
300 0.23
301 0.29
302 0.34
303 0.35
304 0.39
305 0.42
306 0.47
307 0.46
308 0.52
309 0.48
310 0.42
311 0.43
312 0.39
313 0.4
314 0.34
315 0.29
316 0.21
317 0.19
318 0.17
319 0.14
320 0.12
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.03
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.02
335 0.03
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.07
345 0.06
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.09
356 0.1
357 0.13
358 0.15
359 0.17
360 0.17
361 0.17
362 0.17
363 0.14
364 0.14
365 0.15
366 0.16
367 0.18
368 0.18
369 0.22
370 0.22
371 0.22
372 0.22
373 0.17
374 0.14
375 0.11
376 0.1
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.12
390 0.12
391 0.12
392 0.12
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.08
397 0.08
398 0.1
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.08
403 0.09
404 0.11
405 0.12
406 0.12
407 0.12
408 0.14
409 0.15
410 0.16
411 0.15
412 0.17
413 0.17
414 0.17
415 0.2
416 0.2
417 0.19
418 0.2
419 0.19
420 0.17
421 0.19
422 0.18
423 0.15
424 0.18
425 0.17
426 0.24
427 0.24
428 0.23
429 0.19
430 0.22
431 0.23
432 0.18
433 0.18
434 0.11
435 0.1
436 0.1
437 0.1
438 0.07
439 0.05
440 0.05
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.05
448 0.08
449 0.09
450 0.1
451 0.11
452 0.12
453 0.15
454 0.19
455 0.2
456 0.19
457 0.2
458 0.23
459 0.22
460 0.23
461 0.26
462 0.25
463 0.3
464 0.35
465 0.43
466 0.44
467 0.5
468 0.53
469 0.49
470 0.47
471 0.4
472 0.35
473 0.27
474 0.25
475 0.2
476 0.16
477 0.12
478 0.12
479 0.12
480 0.11
481 0.09
482 0.06
483 0.04
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.04
489 0.04
490 0.05
491 0.06
492 0.04
493 0.05
494 0.05
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.06
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.11
506 0.12
507 0.12
508 0.13
509 0.13
510 0.15
511 0.21
512 0.21
513 0.17
514 0.18
515 0.19
516 0.2
517 0.19
518 0.17
519 0.12
520 0.13
521 0.13
522 0.11
523 0.1
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.14
531 0.17
532 0.2
533 0.22
534 0.29
535 0.32
536 0.33
537 0.35
538 0.34
539 0.31
540 0.27
541 0.25
542 0.18
543 0.12
544 0.11
545 0.08
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.06
556 0.06
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.04
564 0.05
565 0.05
566 0.06
567 0.07
568 0.07
569 0.09
570 0.11
571 0.12
572 0.11
573 0.12
574 0.13
575 0.14
576 0.14
577 0.13
578 0.11
579 0.1
580 0.1
581 0.1
582 0.1
583 0.1
584 0.11
585 0.16
586 0.22
587 0.22
588 0.25
589 0.33
590 0.37
591 0.44
592 0.48
593 0.47
594 0.43
595 0.48
596 0.49
597 0.5
598 0.56
599 0.57
600 0.61
601 0.63
602 0.66
603 0.69
604 0.71
605 0.71
606 0.71
607 0.71
608 0.7
609 0.69
610 0.66
611 0.6
612 0.56
613 0.47
614 0.44
615 0.35
616 0.34
617 0.31
618 0.32
619 0.29
620 0.28
621 0.31
622 0.24
623 0.22
624 0.19
625 0.19
626 0.16
627 0.2
628 0.24
629 0.24
630 0.28
631 0.29
632 0.3
633 0.31
634 0.35
635 0.39
636 0.37
637 0.35
638 0.33
639 0.35
640 0.33
641 0.4
642 0.36
643 0.34
644 0.36
645 0.36
646 0.36
647 0.33
648 0.31
649 0.3
650 0.32
651 0.33
652 0.3
653 0.37
654 0.43
655 0.44
656 0.49
657 0.48
658 0.47
659 0.51
660 0.58
661 0.56
662 0.55
663 0.61
664 0.64
665 0.69
666 0.75
667 0.74
668 0.75
669 0.77
670 0.75
671 0.74
672 0.65
673 0.56
674 0.48
675 0.39
676 0.32
677 0.23
678 0.2
679 0.17
680 0.18
681 0.19
682 0.22