Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YCU1

Protein Details
Accession W6YCU1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
385-415EQKAYPPPPVVKKEKKVKNKGTFHPKRNVEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
395-410VKKEKKVKNKGTFHPK
Subcellular Location(s) cyto 17, cyto_nucl 13.333, nucl 7.5, mito_nucl 4.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
KEGG bze:COCCADRAFT_33432  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
CDD cd00805  TyrRS_core  
Amino Acid Sequences MADPAAIQDEITAIEKRIEEAQSQLKDAKERLRKAKDAAYDGPGANLSAEEKMSLIKVNLAEVLNPEIMDEALKKQGHLKVYWGTATTGRPHCGYFVPILKLAQFLAAGCHVKILLADIHGFLDNLKAPIELVKFRAQYYRFTITALLKAVKVPIEKLEFVLGSSYELNADYTMDLLRLASITSEATAKKAGAEVVKQTENAPLSGLLYPLMQALDEEYLDVDVQFGGVDQRKIFALAKDVLPKIGYKERAHLMNPMVPGLQGGKMSASDPDSKIDVLDDADVVKRKLKKAHAAPKVVEENGVLSFVEYVLLPAGHLIHGEPKFVVKRREGEPLVYTDITKMQEDYRNDILTPQDLKPAVTEALITLLEPVQKEFQASPEWKEIEQKAYPPPPVVKKEKKVKNKGTFHPKRNVEAKPDGHVEGEDKATVDVGTEGGEKAIEGLSLEEKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.17
4 0.21
5 0.22
6 0.2
7 0.25
8 0.33
9 0.32
10 0.35
11 0.37
12 0.34
13 0.37
14 0.4
15 0.44
16 0.45
17 0.52
18 0.59
19 0.64
20 0.67
21 0.68
22 0.7
23 0.68
24 0.65
25 0.6
26 0.54
27 0.5
28 0.45
29 0.4
30 0.33
31 0.26
32 0.19
33 0.16
34 0.12
35 0.09
36 0.1
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.1
41 0.11
42 0.1
43 0.13
44 0.13
45 0.14
46 0.17
47 0.17
48 0.16
49 0.16
50 0.19
51 0.16
52 0.15
53 0.14
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.16
60 0.17
61 0.17
62 0.23
63 0.27
64 0.31
65 0.3
66 0.32
67 0.3
68 0.33
69 0.34
70 0.29
71 0.26
72 0.25
73 0.27
74 0.3
75 0.29
76 0.29
77 0.29
78 0.28
79 0.28
80 0.26
81 0.26
82 0.23
83 0.24
84 0.25
85 0.25
86 0.25
87 0.24
88 0.23
89 0.21
90 0.17
91 0.11
92 0.09
93 0.09
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.12
98 0.11
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.12
117 0.14
118 0.14
119 0.16
120 0.21
121 0.22
122 0.23
123 0.3
124 0.27
125 0.29
126 0.34
127 0.36
128 0.3
129 0.3
130 0.33
131 0.28
132 0.29
133 0.27
134 0.21
135 0.17
136 0.17
137 0.17
138 0.16
139 0.15
140 0.13
141 0.16
142 0.18
143 0.18
144 0.18
145 0.19
146 0.16
147 0.15
148 0.15
149 0.11
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.07
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.1
179 0.09
180 0.1
181 0.12
182 0.15
183 0.16
184 0.16
185 0.16
186 0.18
187 0.17
188 0.16
189 0.13
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.05
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.1
221 0.11
222 0.09
223 0.12
224 0.13
225 0.14
226 0.18
227 0.18
228 0.17
229 0.17
230 0.16
231 0.16
232 0.2
233 0.24
234 0.2
235 0.24
236 0.27
237 0.29
238 0.29
239 0.29
240 0.26
241 0.24
242 0.23
243 0.2
244 0.17
245 0.14
246 0.13
247 0.11
248 0.1
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.1
256 0.12
257 0.12
258 0.14
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.12
263 0.1
264 0.08
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.08
269 0.1
270 0.1
271 0.14
272 0.17
273 0.21
274 0.27
275 0.33
276 0.4
277 0.49
278 0.58
279 0.62
280 0.64
281 0.61
282 0.61
283 0.59
284 0.49
285 0.4
286 0.29
287 0.22
288 0.17
289 0.17
290 0.1
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.12
306 0.12
307 0.13
308 0.13
309 0.17
310 0.22
311 0.27
312 0.32
313 0.29
314 0.34
315 0.37
316 0.46
317 0.43
318 0.41
319 0.38
320 0.37
321 0.37
322 0.32
323 0.29
324 0.21
325 0.23
326 0.22
327 0.2
328 0.17
329 0.17
330 0.23
331 0.25
332 0.3
333 0.31
334 0.3
335 0.3
336 0.3
337 0.27
338 0.26
339 0.27
340 0.22
341 0.23
342 0.23
343 0.23
344 0.22
345 0.23
346 0.19
347 0.15
348 0.15
349 0.09
350 0.11
351 0.11
352 0.1
353 0.08
354 0.09
355 0.11
356 0.11
357 0.13
358 0.13
359 0.13
360 0.16
361 0.15
362 0.16
363 0.23
364 0.25
365 0.27
366 0.32
367 0.34
368 0.32
369 0.39
370 0.38
371 0.37
372 0.37
373 0.37
374 0.39
375 0.42
376 0.44
377 0.41
378 0.46
379 0.48
380 0.54
381 0.61
382 0.62
383 0.67
384 0.75
385 0.81
386 0.85
387 0.87
388 0.89
389 0.9
390 0.89
391 0.9
392 0.91
393 0.91
394 0.88
395 0.88
396 0.82
397 0.8
398 0.78
399 0.74
400 0.7
401 0.69
402 0.64
403 0.59
404 0.58
405 0.51
406 0.43
407 0.38
408 0.32
409 0.26
410 0.25
411 0.19
412 0.16
413 0.15
414 0.14
415 0.13
416 0.12
417 0.09
418 0.07
419 0.08
420 0.09
421 0.09
422 0.08
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.08