Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6XPJ7

Protein Details
Accession W6XPJ7    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MAPDDTKGKKRKSAPETTPKAKKAKKABasic
32-51ASEPKPTRKSARKQASDFMDHydrophilic
64-83AEPVKPKKGKQSKAAAPAKVHydrophilic
118-139TETPKETTKKTKKTKVAADVPAHydrophilic
144-165TTVVTKPKKTKGGKKQEAPEPEHydrophilic
480-505VVEPAADKKTKKDKKRKSDVALETSTHydrophilic
511-554VVEAPAKNKRAKKEKESKPETIVEEVEEKKVAAKPKKASKKAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-43KGKKRKSAPETTPKAKKAKKADDVAASEPKPTRKSAR
68-78KPKKGKQSKAA
101-106KKQAKK
150-158PKKTKGGKK
341-342KK
365-368KRRG
425-434KAKKGKKGAK
457-463KKGKKAT
487-496KKTKKDKKRK
516-530AKNKRAKKEKESKPE
537-554EEKKVAAKPKKASKKAKA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG bze:COCCADRAFT_10168  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDDTKGKKRKSAPETTPKAKKAKKADDVAASEPKPTRKSARKQASDFMDVDEEKEVAPVVAAEPVKPKKGKQSKAAAPAKVPEPAAEVAEVVEVQEKPKKQAKKAKTAVVEETTVTETPKETTKKTKKTKVAADVPAVVEETTVVTKPKKTKGGKKQEAPEPEPEPEVDATEPAAASDDEDVAEDDQTAALLAGFSDDDSDDADEDVDFNEDEKIPKLSAKQRKAIKQAEDAPKSNQPGVIYVGRVPRGFYEPQMKKYFSQFGKVNQLRLSRNKKTGASKHYAFVEFQSQEVADIVARTMNNYLLFGHVLKVHLIPTDQVHPDLFKGAKQRFKVDPRNKKAGLEMERGAERSQWEKRVVNENKRRGTKAKELKEIFDYEFEAPILKTVDSVPAHTTIKKLKSSESKKLITDTPAEEVTVAEPKAKKGKKGAKAEVETPATEAVEPTKVASPAQAKKGKKATKAAVPEKSNDVAEEPAVVEPAADKKTKKDKKRKSDVALETSTAVEEAVVEAPAKNKRAKKEKESKPETIVEEVEEKKVAAKPKKASKKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.82
3 0.85
4 0.87
5 0.87
6 0.84
7 0.85
8 0.81
9 0.79
10 0.79
11 0.8
12 0.79
13 0.78
14 0.77
15 0.75
16 0.74
17 0.71
18 0.68
19 0.58
20 0.53
21 0.5
22 0.49
23 0.43
24 0.44
25 0.48
26 0.5
27 0.61
28 0.67
29 0.73
30 0.76
31 0.79
32 0.82
33 0.78
34 0.73
35 0.63
36 0.55
37 0.5
38 0.4
39 0.36
40 0.29
41 0.22
42 0.17
43 0.16
44 0.14
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.06
49 0.11
50 0.11
51 0.12
52 0.2
53 0.24
54 0.32
55 0.34
56 0.36
57 0.42
58 0.52
59 0.59
60 0.6
61 0.67
62 0.68
63 0.77
64 0.81
65 0.73
66 0.66
67 0.62
68 0.55
69 0.48
70 0.4
71 0.3
72 0.26
73 0.24
74 0.22
75 0.17
76 0.15
77 0.11
78 0.12
79 0.11
80 0.07
81 0.09
82 0.09
83 0.11
84 0.17
85 0.18
86 0.24
87 0.32
88 0.39
89 0.45
90 0.56
91 0.62
92 0.68
93 0.74
94 0.76
95 0.76
96 0.72
97 0.68
98 0.61
99 0.53
100 0.42
101 0.36
102 0.3
103 0.24
104 0.2
105 0.15
106 0.13
107 0.13
108 0.2
109 0.21
110 0.23
111 0.34
112 0.44
113 0.54
114 0.64
115 0.72
116 0.74
117 0.79
118 0.84
119 0.83
120 0.82
121 0.76
122 0.69
123 0.62
124 0.54
125 0.45
126 0.36
127 0.26
128 0.17
129 0.12
130 0.09
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.11
135 0.16
136 0.23
137 0.3
138 0.39
139 0.46
140 0.56
141 0.65
142 0.75
143 0.79
144 0.81
145 0.82
146 0.8
147 0.8
148 0.73
149 0.68
150 0.6
151 0.52
152 0.45
153 0.36
154 0.31
155 0.23
156 0.21
157 0.14
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.1
204 0.09
205 0.11
206 0.16
207 0.24
208 0.34
209 0.38
210 0.44
211 0.5
212 0.57
213 0.64
214 0.65
215 0.6
216 0.57
217 0.61
218 0.63
219 0.6
220 0.55
221 0.49
222 0.47
223 0.45
224 0.38
225 0.31
226 0.22
227 0.18
228 0.2
229 0.18
230 0.15
231 0.16
232 0.18
233 0.18
234 0.18
235 0.17
236 0.15
237 0.18
238 0.18
239 0.18
240 0.25
241 0.27
242 0.33
243 0.37
244 0.37
245 0.34
246 0.38
247 0.43
248 0.33
249 0.36
250 0.32
251 0.32
252 0.42
253 0.42
254 0.4
255 0.36
256 0.4
257 0.37
258 0.44
259 0.49
260 0.43
261 0.47
262 0.48
263 0.49
264 0.52
265 0.56
266 0.53
267 0.51
268 0.47
269 0.44
270 0.43
271 0.4
272 0.32
273 0.26
274 0.25
275 0.19
276 0.17
277 0.15
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.1
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.13
307 0.12
308 0.13
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.15
313 0.13
314 0.11
315 0.19
316 0.23
317 0.28
318 0.3
319 0.35
320 0.39
321 0.48
322 0.57
323 0.6
324 0.66
325 0.68
326 0.75
327 0.71
328 0.64
329 0.59
330 0.57
331 0.52
332 0.45
333 0.39
334 0.33
335 0.32
336 0.33
337 0.29
338 0.22
339 0.18
340 0.19
341 0.22
342 0.24
343 0.27
344 0.29
345 0.32
346 0.42
347 0.48
348 0.54
349 0.59
350 0.63
351 0.67
352 0.69
353 0.7
354 0.64
355 0.63
356 0.62
357 0.63
358 0.62
359 0.63
360 0.61
361 0.59
362 0.58
363 0.54
364 0.44
365 0.35
366 0.3
367 0.21
368 0.2
369 0.17
370 0.14
371 0.11
372 0.12
373 0.12
374 0.09
375 0.09
376 0.08
377 0.15
378 0.15
379 0.16
380 0.16
381 0.19
382 0.21
383 0.21
384 0.24
385 0.24
386 0.3
387 0.33
388 0.32
389 0.36
390 0.45
391 0.52
392 0.59
393 0.6
394 0.58
395 0.55
396 0.57
397 0.53
398 0.45
399 0.42
400 0.34
401 0.29
402 0.25
403 0.24
404 0.2
405 0.17
406 0.16
407 0.15
408 0.14
409 0.15
410 0.15
411 0.19
412 0.29
413 0.31
414 0.34
415 0.41
416 0.51
417 0.56
418 0.65
419 0.7
420 0.7
421 0.72
422 0.7
423 0.67
424 0.59
425 0.5
426 0.41
427 0.33
428 0.24
429 0.2
430 0.17
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.11
435 0.14
436 0.14
437 0.14
438 0.19
439 0.25
440 0.29
441 0.39
442 0.45
443 0.43
444 0.51
445 0.61
446 0.63
447 0.62
448 0.65
449 0.63
450 0.64
451 0.72
452 0.73
453 0.71
454 0.67
455 0.63
456 0.59
457 0.54
458 0.46
459 0.36
460 0.3
461 0.22
462 0.19
463 0.17
464 0.13
465 0.11
466 0.11
467 0.1
468 0.08
469 0.08
470 0.13
471 0.15
472 0.18
473 0.18
474 0.27
475 0.38
476 0.48
477 0.58
478 0.65
479 0.72
480 0.8
481 0.91
482 0.93
483 0.9
484 0.91
485 0.89
486 0.85
487 0.78
488 0.67
489 0.57
490 0.47
491 0.38
492 0.28
493 0.19
494 0.1
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.13
502 0.19
503 0.23
504 0.3
505 0.35
506 0.45
507 0.55
508 0.64
509 0.7
510 0.76
511 0.82
512 0.86
513 0.88
514 0.85
515 0.8
516 0.77
517 0.7
518 0.63
519 0.53
520 0.45
521 0.43
522 0.38
523 0.33
524 0.27
525 0.24
526 0.24
527 0.27
528 0.34
529 0.37
530 0.43
531 0.51
532 0.61
533 0.72
534 0.79