Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YNK0

Protein Details
Accession W6YNK0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-37DAYFSRYQVKYKRRRQGKTDYYARKRLIHydrophilic
269-295EWAAESKKYRTKKLTKAEKEERVKAKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-293KKEEGAGPKKTKEEWAAESKKYRTKKLTKAEKEERVKA
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005485  Rbsml_L5_euk/L18_arc  
IPR025607  Rbsml_L5e_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG bze:COCCADRAFT_5332  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14204  Ribosomal_L18_c  
PF17144  Ribosomal_L5e  
CDD cd00432  Ribosomal_L18_L5e  
Amino Acid Sequences MPFSKLQKNDAYFSRYQVKYKRRRQGKTDYYARKRLITQAKNKYNAPKYRLVVRFTNKDIICQIVHSEIGGDKVFMAAYAHELKAYGITHGLTNWAAAYATGLLLARRVLKKLKIDENFVGVEEADGEFTLTEAAEVDGEERRPFKVFLDVGLTRTSTGARVFGAMKGCSDGGVFVPHSENRFPGYDIEAKELDAETLRKYIFGGHVAEYMETLADDDEERYKSQFSGYIEDDIEADGLEELYQDAHKQIREDPWKKEEGAGPKKTKEEWAAESKKYRTKKLTKAEKEERVKAKIAELTSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.47
3 0.5
4 0.54
5 0.6
6 0.63
7 0.72
8 0.78
9 0.78
10 0.84
11 0.85
12 0.87
13 0.87
14 0.86
15 0.86
16 0.87
17 0.85
18 0.85
19 0.79
20 0.72
21 0.64
22 0.63
23 0.63
24 0.62
25 0.64
26 0.66
27 0.72
28 0.72
29 0.75
30 0.75
31 0.74
32 0.73
33 0.68
34 0.66
35 0.6
36 0.65
37 0.66
38 0.61
39 0.6
40 0.59
41 0.6
42 0.55
43 0.61
44 0.5
45 0.47
46 0.44
47 0.39
48 0.32
49 0.26
50 0.23
51 0.16
52 0.16
53 0.13
54 0.13
55 0.1
56 0.12
57 0.11
58 0.09
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.05
65 0.08
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.13
72 0.13
73 0.1
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.08
80 0.08
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.06
86 0.04
87 0.04
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.1
94 0.11
95 0.14
96 0.17
97 0.21
98 0.28
99 0.33
100 0.41
101 0.4
102 0.44
103 0.42
104 0.42
105 0.37
106 0.32
107 0.25
108 0.16
109 0.13
110 0.09
111 0.08
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.03
116 0.03
117 0.04
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.04
125 0.05
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.15
134 0.14
135 0.14
136 0.19
137 0.19
138 0.19
139 0.19
140 0.19
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.06
148 0.08
149 0.08
150 0.1
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.09
158 0.07
159 0.05
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.09
164 0.1
165 0.12
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.16
173 0.19
174 0.19
175 0.22
176 0.2
177 0.19
178 0.18
179 0.17
180 0.14
181 0.11
182 0.11
183 0.08
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.12
189 0.12
190 0.14
191 0.15
192 0.13
193 0.15
194 0.16
195 0.16
196 0.13
197 0.12
198 0.09
199 0.07
200 0.06
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.06
205 0.08
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.16
213 0.16
214 0.2
215 0.21
216 0.23
217 0.22
218 0.22
219 0.21
220 0.17
221 0.15
222 0.09
223 0.08
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.08
233 0.11
234 0.12
235 0.14
236 0.19
237 0.28
238 0.38
239 0.44
240 0.48
241 0.51
242 0.54
243 0.53
244 0.53
245 0.49
246 0.49
247 0.53
248 0.56
249 0.56
250 0.57
251 0.59
252 0.57
253 0.57
254 0.52
255 0.49
256 0.46
257 0.5
258 0.53
259 0.55
260 0.6
261 0.61
262 0.63
263 0.63
264 0.65
265 0.65
266 0.68
267 0.73
268 0.76
269 0.81
270 0.83
271 0.88
272 0.9
273 0.89
274 0.88
275 0.87
276 0.84
277 0.77
278 0.72
279 0.62
280 0.58
281 0.53