Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YML4

Protein Details
Accession W6YML4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-373SQTTSHKPEKGKKRKRGDEATKADABasic
548-568VVPVVEEPKGRKKKKRKHSKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
355-365KPEKGKKRKRG
555-568PKGRKKKKRKHSKK
Subcellular Location(s) cyto 18, nucl 7.5, mito_nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001678  MeTrfase_RsmB/NOP2  
IPR023267  RCMT  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008173  F:RNA methyltransferase activity  
GO:0008757  F:S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity  
KEGG bze:COCCADRAFT_81372  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01189  Methyltr_RsmB-F  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51686  SAM_MT_RSMB_NOP  
Amino Acid Sequences MSLYYEAATILANSDNVGGSLKSRIYNKKDLKSTPGQLFALIAETSKWSLVLKDVIEKCKLLAEEKKLTPILALLLSHDLLLAKNGVAAPANHVLKLAITRHKARLSAELTKARIRHGFATLEAFKAAVNDGGLDKEDGDASKSRHPRWVRVNTIKTTLQEQLATTFSGYTKTEVLKDVLIAPKSSKVYYEDPNIPNLLALPSKVDLSRSIAYTKGQIIFQDKASCFPAYFLDPTPDDGHVIDATAAPGNKTTHLAAIVSDRRQPGEEQKVIAFERDKGRTFTLQKMVKLASADSIVQVKGNSDFIAAKPGSDEYANVGAILLDPSCSGTGIVGRDDAIKMHLPDAPGSQTTSHKPEKGKKRKRGDEATKADAQPTLNLDMDDSAPEETPIQGKLTERLAALSSFQLHILTHAMRFESAHKITYSTCSIHFEENEGVVFQALASSVAKEREWRILKRDQQVDGLQKWHRRGIWEEDKIDGDMDESFKKDVLEACIRCDKGTEEGTMGFFVAAFIREGNQQPVQVTEVAVSEDEEWGGFSDHGEVEEAVVPVVEEPKGRKKKKRKHSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.1
5 0.09
6 0.09
7 0.13
8 0.16
9 0.19
10 0.27
11 0.36
12 0.42
13 0.53
14 0.61
15 0.66
16 0.72
17 0.72
18 0.72
19 0.72
20 0.73
21 0.68
22 0.65
23 0.56
24 0.48
25 0.44
26 0.36
27 0.3
28 0.21
29 0.16
30 0.1
31 0.11
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.1
36 0.1
37 0.13
38 0.17
39 0.17
40 0.25
41 0.31
42 0.35
43 0.37
44 0.36
45 0.33
46 0.34
47 0.34
48 0.3
49 0.32
50 0.36
51 0.42
52 0.43
53 0.49
54 0.44
55 0.43
56 0.37
57 0.3
58 0.25
59 0.18
60 0.16
61 0.12
62 0.14
63 0.14
64 0.13
65 0.13
66 0.11
67 0.09
68 0.1
69 0.09
70 0.07
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.14
77 0.21
78 0.21
79 0.2
80 0.2
81 0.19
82 0.19
83 0.23
84 0.24
85 0.24
86 0.29
87 0.34
88 0.4
89 0.43
90 0.44
91 0.42
92 0.45
93 0.44
94 0.46
95 0.49
96 0.48
97 0.48
98 0.5
99 0.49
100 0.45
101 0.43
102 0.38
103 0.34
104 0.32
105 0.3
106 0.27
107 0.33
108 0.3
109 0.27
110 0.24
111 0.2
112 0.16
113 0.15
114 0.14
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.1
127 0.13
128 0.15
129 0.23
130 0.29
131 0.31
132 0.39
133 0.42
134 0.48
135 0.54
136 0.61
137 0.64
138 0.67
139 0.73
140 0.67
141 0.69
142 0.63
143 0.54
144 0.48
145 0.41
146 0.32
147 0.26
148 0.23
149 0.2
150 0.18
151 0.17
152 0.14
153 0.12
154 0.1
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.13
159 0.14
160 0.15
161 0.16
162 0.17
163 0.15
164 0.15
165 0.17
166 0.19
167 0.19
168 0.18
169 0.17
170 0.21
171 0.22
172 0.21
173 0.19
174 0.19
175 0.23
176 0.26
177 0.31
178 0.35
179 0.34
180 0.36
181 0.35
182 0.3
183 0.26
184 0.22
185 0.18
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.14
195 0.16
196 0.16
197 0.16
198 0.16
199 0.17
200 0.18
201 0.19
202 0.16
203 0.15
204 0.15
205 0.18
206 0.19
207 0.2
208 0.24
209 0.21
210 0.22
211 0.24
212 0.23
213 0.18
214 0.18
215 0.17
216 0.13
217 0.15
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.17
222 0.17
223 0.16
224 0.14
225 0.13
226 0.13
227 0.1
228 0.1
229 0.08
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.08
244 0.13
245 0.16
246 0.16
247 0.19
248 0.18
249 0.18
250 0.19
251 0.2
252 0.22
253 0.27
254 0.27
255 0.25
256 0.25
257 0.28
258 0.27
259 0.27
260 0.2
261 0.16
262 0.2
263 0.22
264 0.23
265 0.22
266 0.24
267 0.28
268 0.3
269 0.31
270 0.34
271 0.34
272 0.33
273 0.33
274 0.32
275 0.27
276 0.25
277 0.2
278 0.13
279 0.1
280 0.1
281 0.08
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.13
294 0.12
295 0.11
296 0.11
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.08
302 0.1
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.05
310 0.03
311 0.03
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.04
316 0.04
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.11
330 0.11
331 0.12
332 0.13
333 0.13
334 0.12
335 0.12
336 0.13
337 0.14
338 0.17
339 0.23
340 0.25
341 0.28
342 0.33
343 0.42
344 0.51
345 0.6
346 0.68
347 0.71
348 0.79
349 0.84
350 0.87
351 0.89
352 0.87
353 0.86
354 0.82
355 0.77
356 0.71
357 0.62
358 0.54
359 0.44
360 0.35
361 0.26
362 0.21
363 0.19
364 0.14
365 0.14
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.09
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.07
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.13
382 0.15
383 0.16
384 0.15
385 0.15
386 0.15
387 0.14
388 0.14
389 0.13
390 0.12
391 0.1
392 0.11
393 0.1
394 0.09
395 0.1
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.12
403 0.14
404 0.19
405 0.19
406 0.2
407 0.2
408 0.21
409 0.22
410 0.25
411 0.25
412 0.19
413 0.2
414 0.22
415 0.24
416 0.26
417 0.25
418 0.24
419 0.22
420 0.21
421 0.2
422 0.15
423 0.13
424 0.1
425 0.09
426 0.06
427 0.05
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.06
432 0.09
433 0.11
434 0.11
435 0.14
436 0.17
437 0.25
438 0.32
439 0.34
440 0.39
441 0.46
442 0.54
443 0.6
444 0.64
445 0.56
446 0.55
447 0.58
448 0.58
449 0.52
450 0.5
451 0.47
452 0.47
453 0.48
454 0.48
455 0.43
456 0.4
457 0.42
458 0.46
459 0.51
460 0.52
461 0.5
462 0.47
463 0.47
464 0.43
465 0.38
466 0.28
467 0.18
468 0.13
469 0.14
470 0.13
471 0.13
472 0.13
473 0.14
474 0.14
475 0.15
476 0.16
477 0.21
478 0.29
479 0.28
480 0.33
481 0.4
482 0.4
483 0.38
484 0.37
485 0.32
486 0.28
487 0.31
488 0.27
489 0.21
490 0.22
491 0.23
492 0.22
493 0.2
494 0.13
495 0.1
496 0.09
497 0.08
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.08
502 0.12
503 0.15
504 0.2
505 0.21
506 0.22
507 0.22
508 0.23
509 0.24
510 0.21
511 0.19
512 0.15
513 0.13
514 0.13
515 0.12
516 0.12
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.1
524 0.09
525 0.08
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.13
530 0.11
531 0.12
532 0.15
533 0.15
534 0.12
535 0.11
536 0.11
537 0.1
538 0.12
539 0.11
540 0.11
541 0.17
542 0.28
543 0.39
544 0.48
545 0.58
546 0.67
547 0.77
548 0.86