Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6Y8U1

Protein Details
Accession W6Y8U1    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
328-349APSEPPPKPRKPPRPHIPQMSAHydrophilic
417-444ATMKSTKRGTYYKKRRRWERVKSVVDETHydrophilic
591-616EGRVEARGHHGKKKRKVGENEQVAVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
334-341PKPRKPPR
430-432KRR
597-606RGHHGKKKRK
Subcellular Location(s) cyto 12, mito 10, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG bze:COCCADRAFT_4641  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSYIRPNTHVALRLPSGLFKIVETTPNTTINLGKFGTFNSNLILGRPYYLTYELLDKDDGKTQTELRVVPASELHAEALGSDHAPSADTGDDVAEAGAGFDIVGEDGQVIMRNNRLTIDDASRQQLSMAEIEELKKAGTGSGKEIIAKIMASHNAIDEKTSFSLAKYTLRKSRKYMKRFTALPMDVGLLTEYVLEKEAYKIMELREDLLGLINSWANVHSGETNQIIIGEDGVSQIGGGRWLVVDDTGGLLTASLAEKMGILYPDDENDESDSEEDVATPEGAENGTAATTDAPQPKDEDIAMPDADGEATSASNPTNTTDPSTTAAPSEPPPKPRKPPRPHIPQMSARTNTLTVLHPNNQPNLSYLKYFGYDYGAPTVSHPLYKHLKSLSWLSLLHPEDDPSYDEPEVISEDVLATMKSTKRGTYYKKRRRWERVKSVVDETRQGGFDGLVVATAMDAKTVLKELVPLVRGGGRVVVYNPNVEPLVELCDYYSKERRAAYIAREFGSAPQTNGHKAKSEDETETNGSTTEASNEDDDFPLNPTLLLAPSLQTARARQWQVLPGRTHPMMTSKGGAEGYLFTATRVLPIEGRVEARGHHGKKKRKVGENEQVAVEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.36
3 0.34
4 0.31
5 0.28
6 0.26
7 0.2
8 0.23
9 0.2
10 0.25
11 0.26
12 0.29
13 0.29
14 0.32
15 0.32
16 0.3
17 0.32
18 0.28
19 0.29
20 0.24
21 0.22
22 0.2
23 0.21
24 0.27
25 0.24
26 0.23
27 0.2
28 0.23
29 0.22
30 0.23
31 0.24
32 0.17
33 0.17
34 0.17
35 0.16
36 0.16
37 0.18
38 0.17
39 0.16
40 0.21
41 0.21
42 0.22
43 0.23
44 0.21
45 0.21
46 0.27
47 0.27
48 0.25
49 0.26
50 0.26
51 0.29
52 0.32
53 0.31
54 0.27
55 0.31
56 0.29
57 0.27
58 0.26
59 0.23
60 0.21
61 0.21
62 0.17
63 0.13
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.05
83 0.04
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.04
96 0.07
97 0.08
98 0.09
99 0.13
100 0.14
101 0.14
102 0.15
103 0.17
104 0.18
105 0.21
106 0.25
107 0.27
108 0.28
109 0.32
110 0.31
111 0.29
112 0.26
113 0.24
114 0.2
115 0.16
116 0.14
117 0.12
118 0.13
119 0.14
120 0.15
121 0.13
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.11
126 0.13
127 0.14
128 0.17
129 0.21
130 0.21
131 0.21
132 0.22
133 0.2
134 0.17
135 0.15
136 0.12
137 0.11
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.15
143 0.15
144 0.15
145 0.12
146 0.14
147 0.14
148 0.15
149 0.14
150 0.12
151 0.15
152 0.16
153 0.23
154 0.25
155 0.3
156 0.37
157 0.44
158 0.48
159 0.52
160 0.61
161 0.64
162 0.68
163 0.71
164 0.71
165 0.72
166 0.7
167 0.68
168 0.67
169 0.58
170 0.5
171 0.4
172 0.33
173 0.25
174 0.22
175 0.18
176 0.08
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.11
189 0.11
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.11
198 0.07
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.09
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.04
279 0.08
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.15
284 0.15
285 0.16
286 0.15
287 0.12
288 0.1
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.06
305 0.07
306 0.08
307 0.1
308 0.1
309 0.12
310 0.13
311 0.14
312 0.13
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.13
317 0.18
318 0.19
319 0.26
320 0.32
321 0.37
322 0.46
323 0.56
324 0.65
325 0.67
326 0.75
327 0.78
328 0.82
329 0.84
330 0.82
331 0.79
332 0.76
333 0.74
334 0.69
335 0.61
336 0.5
337 0.45
338 0.37
339 0.3
340 0.24
341 0.18
342 0.15
343 0.17
344 0.2
345 0.24
346 0.26
347 0.28
348 0.27
349 0.26
350 0.24
351 0.24
352 0.21
353 0.17
354 0.16
355 0.14
356 0.15
357 0.15
358 0.13
359 0.14
360 0.13
361 0.13
362 0.15
363 0.15
364 0.13
365 0.14
366 0.18
367 0.15
368 0.16
369 0.15
370 0.19
371 0.24
372 0.25
373 0.28
374 0.25
375 0.26
376 0.26
377 0.3
378 0.27
379 0.23
380 0.22
381 0.2
382 0.26
383 0.26
384 0.25
385 0.21
386 0.19
387 0.17
388 0.18
389 0.19
390 0.13
391 0.15
392 0.14
393 0.14
394 0.13
395 0.13
396 0.13
397 0.1
398 0.09
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.08
406 0.1
407 0.14
408 0.15
409 0.16
410 0.21
411 0.29
412 0.38
413 0.46
414 0.56
415 0.63
416 0.71
417 0.8
418 0.85
419 0.89
420 0.9
421 0.9
422 0.9
423 0.9
424 0.88
425 0.82
426 0.78
427 0.72
428 0.63
429 0.55
430 0.46
431 0.38
432 0.31
433 0.27
434 0.2
435 0.15
436 0.13
437 0.11
438 0.09
439 0.06
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.05
444 0.05
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.05
449 0.06
450 0.07
451 0.06
452 0.07
453 0.09
454 0.13
455 0.14
456 0.13
457 0.13
458 0.15
459 0.16
460 0.14
461 0.15
462 0.11
463 0.12
464 0.14
465 0.18
466 0.17
467 0.18
468 0.18
469 0.18
470 0.18
471 0.17
472 0.15
473 0.11
474 0.15
475 0.13
476 0.13
477 0.11
478 0.15
479 0.17
480 0.22
481 0.29
482 0.26
483 0.3
484 0.31
485 0.32
486 0.34
487 0.37
488 0.39
489 0.4
490 0.41
491 0.38
492 0.38
493 0.36
494 0.33
495 0.36
496 0.3
497 0.22
498 0.24
499 0.25
500 0.31
501 0.34
502 0.33
503 0.3
504 0.31
505 0.35
506 0.36
507 0.38
508 0.36
509 0.35
510 0.39
511 0.36
512 0.35
513 0.3
514 0.25
515 0.21
516 0.17
517 0.15
518 0.12
519 0.11
520 0.12
521 0.13
522 0.14
523 0.15
524 0.15
525 0.15
526 0.14
527 0.15
528 0.15
529 0.13
530 0.12
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.12
535 0.09
536 0.09
537 0.12
538 0.13
539 0.14
540 0.16
541 0.18
542 0.23
543 0.31
544 0.33
545 0.33
546 0.37
547 0.43
548 0.48
549 0.53
550 0.51
551 0.46
552 0.51
553 0.49
554 0.45
555 0.38
556 0.36
557 0.33
558 0.32
559 0.31
560 0.25
561 0.27
562 0.26
563 0.25
564 0.2
565 0.17
566 0.17
567 0.16
568 0.16
569 0.13
570 0.15
571 0.14
572 0.16
573 0.17
574 0.16
575 0.14
576 0.16
577 0.19
578 0.2
579 0.22
580 0.21
581 0.2
582 0.19
583 0.26
584 0.35
585 0.37
586 0.44
587 0.51
588 0.6
589 0.69
590 0.79
591 0.81
592 0.81
593 0.86
594 0.88
595 0.89
596 0.88
597 0.82