Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YDQ3

Protein Details
Accession W6YDQ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-119PAKTTAKKPAAKKTKKKPAAKKPAAKKAAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-145KKAVKAAASEKTPPKKKKVAPAKTTAKKPAAKKTKKKPAAKKPAAKKAAPKRVKKVLTEEEKEKAKIRELRAKALK
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG bze:COCCADRAFT_85173  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09011  HMG_box_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MLAGALCRLAADVPRASPHNVPQLARHLERVLVIRSAAESSPARASSRAYAYARSYATTTRATKPTATVKKAVKAAASEKTPPKKKKVAPAKTTAKKPAAKKTKKKPAAKKPAAKKAAPKRVKKVLTEEEKEKAKIRELRAKALKEPVGQRPVSGYNVFVAELLKGKPRGSETQTAKITNATKEFNNLSPAQLEHYNHLANEQSAARKAEFDKWIQSHTPEQIRIANLARAQLRRRFAGKQKGNPAYTAKLHDPRRVKAALNPYALFFRARHASGDFKGISAVDASKLIGAEWKALNESEKQKYHSEANALATKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.27
4 0.3
5 0.33
6 0.38
7 0.4
8 0.4
9 0.4
10 0.47
11 0.51
12 0.49
13 0.46
14 0.38
15 0.34
16 0.36
17 0.35
18 0.29
19 0.23
20 0.21
21 0.18
22 0.18
23 0.19
24 0.16
25 0.17
26 0.15
27 0.16
28 0.2
29 0.22
30 0.22
31 0.21
32 0.23
33 0.24
34 0.27
35 0.31
36 0.29
37 0.31
38 0.32
39 0.37
40 0.35
41 0.31
42 0.28
43 0.23
44 0.26
45 0.29
46 0.3
47 0.31
48 0.34
49 0.35
50 0.34
51 0.38
52 0.45
53 0.47
54 0.47
55 0.48
56 0.48
57 0.52
58 0.55
59 0.51
60 0.42
61 0.37
62 0.37
63 0.36
64 0.35
65 0.35
66 0.39
67 0.48
68 0.55
69 0.58
70 0.61
71 0.65
72 0.67
73 0.72
74 0.75
75 0.75
76 0.73
77 0.77
78 0.8
79 0.78
80 0.79
81 0.76
82 0.73
83 0.68
84 0.67
85 0.68
86 0.69
87 0.72
88 0.75
89 0.79
90 0.82
91 0.85
92 0.89
93 0.89
94 0.89
95 0.91
96 0.9
97 0.89
98 0.87
99 0.88
100 0.84
101 0.76
102 0.74
103 0.73
104 0.74
105 0.74
106 0.71
107 0.68
108 0.71
109 0.73
110 0.66
111 0.64
112 0.62
113 0.62
114 0.59
115 0.55
116 0.5
117 0.49
118 0.47
119 0.43
120 0.35
121 0.33
122 0.35
123 0.37
124 0.42
125 0.41
126 0.49
127 0.51
128 0.51
129 0.47
130 0.47
131 0.44
132 0.38
133 0.4
134 0.37
135 0.36
136 0.34
137 0.31
138 0.28
139 0.28
140 0.26
141 0.22
142 0.16
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.1
147 0.08
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.15
156 0.19
157 0.22
158 0.3
159 0.32
160 0.39
161 0.41
162 0.4
163 0.37
164 0.37
165 0.35
166 0.28
167 0.27
168 0.21
169 0.18
170 0.21
171 0.23
172 0.2
173 0.22
174 0.2
175 0.17
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.17
180 0.17
181 0.15
182 0.17
183 0.17
184 0.16
185 0.17
186 0.15
187 0.11
188 0.13
189 0.12
190 0.11
191 0.13
192 0.15
193 0.14
194 0.16
195 0.18
196 0.22
197 0.24
198 0.24
199 0.29
200 0.28
201 0.31
202 0.3
203 0.31
204 0.29
205 0.32
206 0.35
207 0.29
208 0.3
209 0.3
210 0.29
211 0.29
212 0.27
213 0.24
214 0.2
215 0.23
216 0.25
217 0.27
218 0.31
219 0.34
220 0.36
221 0.37
222 0.39
223 0.43
224 0.48
225 0.55
226 0.58
227 0.61
228 0.68
229 0.72
230 0.69
231 0.65
232 0.6
233 0.54
234 0.48
235 0.45
236 0.41
237 0.42
238 0.46
239 0.5
240 0.52
241 0.5
242 0.53
243 0.51
244 0.45
245 0.44
246 0.49
247 0.49
248 0.48
249 0.45
250 0.4
251 0.4
252 0.39
253 0.34
254 0.24
255 0.22
256 0.22
257 0.22
258 0.23
259 0.24
260 0.29
261 0.28
262 0.35
263 0.3
264 0.25
265 0.25
266 0.22
267 0.2
268 0.16
269 0.15
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.13
277 0.12
278 0.16
279 0.16
280 0.17
281 0.18
282 0.19
283 0.21
284 0.24
285 0.31
286 0.35
287 0.39
288 0.41
289 0.43
290 0.47
291 0.5
292 0.48
293 0.46
294 0.41
295 0.44