Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6Y5X1

Protein Details
Accession W6Y5X1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-98VDTGSRGKSKKRKRDGKDESEGTVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-90RGKSKKRKRDG
205-211KKRKRKT
444-451RKGKKKLE
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12, nucl 10.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR014816  tRNA_MeTrfase_Gcd14  
Gene Ontology GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0016429  F:tRNA (adenine-N1-)-methyltransferase activity  
KEGG bze:COCCADRAFT_92171  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08704  GCD14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51620  SAM_TRM61  
Amino Acid Sequences MAPVPSPFLDPGAYATADNLGILQLRRDHLIPALLKPNADSDYAEGKVENTRFGSFPHSTLVGQPWGTQILASVVDTGSRGKSKKRKRDGKDESEGTVSAEPEVAKKDIVKAATASSGFAHLIPPTPEMWTLSLPHRTQVVYTPDYSYILQRLRARPGDHIIEAGAGSGSFTHAAIRAVYNGYPGTRDALDEPNGEEENAVGMSKKRKRKTRTGGVYSFEYHEPRANQLRAEIKDHGLEPLVTVTHRDVYNDGFGLENSPGPDADCIFLDLPAPWHALKHLTRSPPSTAALNSVATDISTPTSGDNDPTTPTAQPAETNRKPFATPLNPRNAVRICTFSPCIEQVTKTVSALRTLGWQEIDMVEINAKRLDVRRERVGLQEEGVRGGNAHPANVQEAVQRLRDVEGRAAVFHSMQREKQEEVMRKAEARKRGENVDCDVDGGARKGKKKLEGVPPSKHDRLAQTKKDFETRPLYKEGRLVHRTEPELKTHTSYLVFAILPREWSKADEEKARRKWG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.15
4 0.14
5 0.14
6 0.11
7 0.08
8 0.1
9 0.11
10 0.14
11 0.16
12 0.17
13 0.2
14 0.21
15 0.22
16 0.21
17 0.28
18 0.27
19 0.28
20 0.34
21 0.33
22 0.32
23 0.31
24 0.33
25 0.28
26 0.27
27 0.22
28 0.19
29 0.23
30 0.24
31 0.24
32 0.2
33 0.19
34 0.25
35 0.25
36 0.24
37 0.21
38 0.22
39 0.22
40 0.23
41 0.29
42 0.24
43 0.25
44 0.25
45 0.24
46 0.23
47 0.25
48 0.28
49 0.24
50 0.23
51 0.22
52 0.21
53 0.2
54 0.2
55 0.16
56 0.13
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.1
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.11
65 0.12
66 0.16
67 0.19
68 0.27
69 0.38
70 0.48
71 0.59
72 0.68
73 0.76
74 0.79
75 0.89
76 0.9
77 0.89
78 0.89
79 0.81
80 0.72
81 0.64
82 0.56
83 0.46
84 0.37
85 0.27
86 0.17
87 0.16
88 0.13
89 0.12
90 0.15
91 0.14
92 0.13
93 0.13
94 0.17
95 0.19
96 0.2
97 0.2
98 0.18
99 0.18
100 0.21
101 0.2
102 0.17
103 0.13
104 0.14
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.09
109 0.11
110 0.12
111 0.13
112 0.12
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.16
117 0.15
118 0.16
119 0.19
120 0.26
121 0.25
122 0.25
123 0.26
124 0.24
125 0.24
126 0.28
127 0.29
128 0.25
129 0.26
130 0.26
131 0.25
132 0.27
133 0.26
134 0.21
135 0.2
136 0.19
137 0.24
138 0.28
139 0.31
140 0.36
141 0.4
142 0.4
143 0.39
144 0.42
145 0.4
146 0.34
147 0.31
148 0.24
149 0.2
150 0.18
151 0.14
152 0.09
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.14
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.17
181 0.17
182 0.16
183 0.13
184 0.1
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.05
189 0.07
190 0.16
191 0.23
192 0.32
193 0.39
194 0.48
195 0.56
196 0.66
197 0.74
198 0.77
199 0.8
200 0.8
201 0.77
202 0.71
203 0.66
204 0.56
205 0.48
206 0.38
207 0.29
208 0.21
209 0.2
210 0.18
211 0.2
212 0.25
213 0.23
214 0.22
215 0.24
216 0.3
217 0.29
218 0.32
219 0.29
220 0.23
221 0.24
222 0.24
223 0.21
224 0.14
225 0.13
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.08
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.14
265 0.15
266 0.2
267 0.23
268 0.26
269 0.29
270 0.32
271 0.34
272 0.31
273 0.3
274 0.26
275 0.21
276 0.2
277 0.19
278 0.16
279 0.14
280 0.12
281 0.11
282 0.09
283 0.09
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.12
296 0.13
297 0.11
298 0.12
299 0.12
300 0.11
301 0.13
302 0.18
303 0.27
304 0.3
305 0.34
306 0.34
307 0.34
308 0.34
309 0.34
310 0.36
311 0.35
312 0.39
313 0.42
314 0.5
315 0.52
316 0.52
317 0.56
318 0.5
319 0.43
320 0.37
321 0.34
322 0.26
323 0.27
324 0.29
325 0.23
326 0.24
327 0.22
328 0.23
329 0.2
330 0.2
331 0.17
332 0.2
333 0.2
334 0.18
335 0.2
336 0.17
337 0.18
338 0.18
339 0.16
340 0.16
341 0.17
342 0.18
343 0.14
344 0.14
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.09
349 0.08
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.14
357 0.23
358 0.28
359 0.34
360 0.39
361 0.42
362 0.43
363 0.47
364 0.48
365 0.4
366 0.33
367 0.32
368 0.26
369 0.24
370 0.23
371 0.17
372 0.13
373 0.13
374 0.18
375 0.14
376 0.14
377 0.13
378 0.14
379 0.16
380 0.16
381 0.16
382 0.12
383 0.16
384 0.17
385 0.18
386 0.17
387 0.16
388 0.17
389 0.2
390 0.2
391 0.19
392 0.21
393 0.2
394 0.2
395 0.2
396 0.19
397 0.17
398 0.17
399 0.21
400 0.21
401 0.23
402 0.27
403 0.3
404 0.3
405 0.36
406 0.43
407 0.44
408 0.46
409 0.48
410 0.45
411 0.46
412 0.53
413 0.52
414 0.52
415 0.51
416 0.53
417 0.53
418 0.59
419 0.61
420 0.56
421 0.55
422 0.52
423 0.45
424 0.39
425 0.34
426 0.27
427 0.23
428 0.2
429 0.22
430 0.21
431 0.25
432 0.3
433 0.36
434 0.42
435 0.48
436 0.55
437 0.6
438 0.66
439 0.7
440 0.73
441 0.74
442 0.75
443 0.71
444 0.64
445 0.57
446 0.56
447 0.59
448 0.61
449 0.64
450 0.64
451 0.68
452 0.69
453 0.73
454 0.66
455 0.62
456 0.62
457 0.57
458 0.54
459 0.55
460 0.54
461 0.48
462 0.52
463 0.53
464 0.52
465 0.52
466 0.51
467 0.49
468 0.53
469 0.56
470 0.58
471 0.54
472 0.5
473 0.5
474 0.49
475 0.47
476 0.41
477 0.39
478 0.33
479 0.31
480 0.26
481 0.24
482 0.22
483 0.18
484 0.21
485 0.18
486 0.21
487 0.22
488 0.24
489 0.21
490 0.23
491 0.29
492 0.32
493 0.37
494 0.43
495 0.51
496 0.59