Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6Y1M8

Protein Details
Accession W6Y1M8    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-226KVDDAIKRLKKQKRKEKERAKRKDRHSRRDGSRDRDRDRBasic
234-271HGEHDERDRRSRRKEHRSKSRERSKDRSEDRHGRRRSEBasic
274-314RDESENSRDRHRKRDRRRSASSERERRHSRTRDARSPLPYRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-316KRLKKQKRKEKERAKRKDRHSRRDGSRDRDRDRERRRIKEHGEHDERDRRSRRKEHRSKSRERSKDRSEDRHGRRRSERARDESENSRDRHRKRDRRRSASSERERRHSRTRDARSPLPYRAR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG bze:COCCADRAFT_6364  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MNSIRAIQQLNKRELEAGISPEGSWHTDYRDTAFIYIGGLPFELSEGDIITIFSQYGEPVWIKLARDKETGKSRGFAWIKYEDQRSCDLAVDNLGGASIMDRIIRVDHARYKPKDDEDMRDNTMGELDIDPGVESDNGRGKRRKTESESDSDEDRPLLPEEIELGRLMDKLDEEDPMRDSLIKRQQEKVDDAIKRLKKQKRKEKERAKRKDRHSRRDGSRDRDRDRERRRIKEHGEHDERDRRSRRKEHRSKSRERSKDRSEDRHGRRRSERARDESENSRDRHRKRDRRRSASSERERRHSRTRDARSPLPYRARSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.38
3 0.32
4 0.27
5 0.24
6 0.22
7 0.21
8 0.2
9 0.22
10 0.19
11 0.19
12 0.16
13 0.18
14 0.21
15 0.23
16 0.25
17 0.27
18 0.26
19 0.24
20 0.24
21 0.2
22 0.17
23 0.18
24 0.14
25 0.11
26 0.1
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.07
31 0.06
32 0.05
33 0.05
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.12
48 0.14
49 0.15
50 0.2
51 0.26
52 0.27
53 0.32
54 0.34
55 0.39
56 0.46
57 0.51
58 0.47
59 0.43
60 0.39
61 0.44
62 0.44
63 0.37
64 0.33
65 0.32
66 0.34
67 0.38
68 0.44
69 0.35
70 0.36
71 0.38
72 0.35
73 0.3
74 0.28
75 0.23
76 0.17
77 0.17
78 0.14
79 0.11
80 0.09
81 0.08
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.06
91 0.08
92 0.09
93 0.13
94 0.21
95 0.27
96 0.37
97 0.38
98 0.44
99 0.47
100 0.48
101 0.53
102 0.47
103 0.47
104 0.42
105 0.45
106 0.41
107 0.37
108 0.34
109 0.25
110 0.23
111 0.17
112 0.13
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.13
124 0.15
125 0.2
126 0.24
127 0.26
128 0.35
129 0.41
130 0.46
131 0.47
132 0.53
133 0.54
134 0.55
135 0.58
136 0.51
137 0.47
138 0.4
139 0.34
140 0.25
141 0.21
142 0.16
143 0.12
144 0.1
145 0.08
146 0.07
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.17
168 0.25
169 0.29
170 0.31
171 0.36
172 0.39
173 0.41
174 0.43
175 0.41
176 0.4
177 0.36
178 0.36
179 0.4
180 0.4
181 0.42
182 0.49
183 0.53
184 0.54
185 0.64
186 0.72
187 0.74
188 0.81
189 0.87
190 0.89
191 0.92
192 0.94
193 0.94
194 0.94
195 0.92
196 0.91
197 0.91
198 0.91
199 0.9
200 0.89
201 0.88
202 0.86
203 0.88
204 0.85
205 0.83
206 0.82
207 0.81
208 0.76
209 0.76
210 0.75
211 0.75
212 0.75
213 0.78
214 0.76
215 0.77
216 0.79
217 0.78
218 0.79
219 0.78
220 0.77
221 0.77
222 0.74
223 0.67
224 0.69
225 0.68
226 0.63
227 0.62
228 0.63
229 0.6
230 0.63
231 0.7
232 0.74
233 0.76
234 0.84
235 0.86
236 0.89
237 0.91
238 0.92
239 0.93
240 0.93
241 0.91
242 0.89
243 0.88
244 0.86
245 0.86
246 0.84
247 0.83
248 0.82
249 0.82
250 0.83
251 0.84
252 0.81
253 0.79
254 0.78
255 0.79
256 0.79
257 0.79
258 0.79
259 0.77
260 0.79
261 0.77
262 0.75
263 0.73
264 0.72
265 0.68
266 0.6
267 0.62
268 0.63
269 0.62
270 0.67
271 0.7
272 0.72
273 0.77
274 0.86
275 0.87
276 0.88
277 0.93
278 0.91
279 0.91
280 0.91
281 0.91
282 0.9
283 0.85
284 0.85
285 0.83
286 0.81
287 0.8
288 0.78
289 0.78
290 0.78
291 0.81
292 0.81
293 0.82
294 0.82
295 0.8
296 0.78
297 0.77
298 0.76