Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YP02

Protein Details
Accession W6YP02    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-78SRDTKPAPVRRERGRERRLFGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-72VRRERGR
121-126RAARRK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039853  Pinin  
IPR006786  Pinin_SDK_MemA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG bze:COCCADRAFT_86248  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04696  Pinin_SDK_memA  
Amino Acid Sequences MDASIASAVVVPDELSAPASPVYSQKRRQESFSDDPAKRPRIEADDTSGDNDRRDSGSRDTKPAPVRRERGRERRLFGAVLGALSQNTATTAQKRRFEIEQRQLAQRKQEDHESEQRRAERAARRKEQRWIEQKRFERESMRIRHDNLLSMAHFLQTKTEPRLYYKPWETSPDEDDRIQDQIAEAKDIIRHEVAEYEARQHADNQRKRDTADEMNRHATDSQTGKSHDTDAPHTTSTANGATNDSTAPPEDMEIDRRHSDNPNTTMEVRDEHATEDTQDGRDASRDIVPEEPTKDDEDENGEDVVEEAAEDTVIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.08
4 0.09
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.17
9 0.26
10 0.33
11 0.42
12 0.49
13 0.59
14 0.61
15 0.65
16 0.66
17 0.66
18 0.65
19 0.66
20 0.67
21 0.58
22 0.63
23 0.67
24 0.65
25 0.57
26 0.51
27 0.46
28 0.43
29 0.48
30 0.43
31 0.41
32 0.41
33 0.41
34 0.41
35 0.41
36 0.35
37 0.3
38 0.28
39 0.23
40 0.21
41 0.23
42 0.24
43 0.28
44 0.37
45 0.39
46 0.45
47 0.45
48 0.5
49 0.56
50 0.59
51 0.59
52 0.58
53 0.63
54 0.66
55 0.74
56 0.77
57 0.79
58 0.81
59 0.81
60 0.75
61 0.73
62 0.67
63 0.57
64 0.47
65 0.4
66 0.3
67 0.23
68 0.19
69 0.13
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.05
74 0.05
75 0.07
76 0.08
77 0.14
78 0.23
79 0.29
80 0.35
81 0.37
82 0.39
83 0.44
84 0.51
85 0.54
86 0.56
87 0.58
88 0.56
89 0.62
90 0.63
91 0.59
92 0.58
93 0.52
94 0.47
95 0.42
96 0.46
97 0.43
98 0.44
99 0.52
100 0.5
101 0.49
102 0.49
103 0.48
104 0.42
105 0.39
106 0.4
107 0.39
108 0.43
109 0.5
110 0.54
111 0.59
112 0.62
113 0.69
114 0.7
115 0.7
116 0.71
117 0.71
118 0.7
119 0.72
120 0.74
121 0.73
122 0.69
123 0.61
124 0.55
125 0.51
126 0.51
127 0.49
128 0.5
129 0.46
130 0.44
131 0.47
132 0.43
133 0.39
134 0.31
135 0.26
136 0.19
137 0.18
138 0.16
139 0.12
140 0.12
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.14
145 0.15
146 0.18
147 0.18
148 0.22
149 0.27
150 0.28
151 0.33
152 0.34
153 0.35
154 0.33
155 0.38
156 0.36
157 0.34
158 0.35
159 0.32
160 0.3
161 0.26
162 0.26
163 0.22
164 0.21
165 0.18
166 0.14
167 0.1
168 0.12
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.15
185 0.15
186 0.16
187 0.18
188 0.25
189 0.32
190 0.38
191 0.41
192 0.46
193 0.46
194 0.47
195 0.47
196 0.44
197 0.43
198 0.47
199 0.47
200 0.45
201 0.48
202 0.48
203 0.45
204 0.4
205 0.31
206 0.26
207 0.23
208 0.21
209 0.2
210 0.21
211 0.22
212 0.23
213 0.26
214 0.24
215 0.24
216 0.25
217 0.25
218 0.27
219 0.25
220 0.24
221 0.21
222 0.19
223 0.19
224 0.16
225 0.14
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.09
236 0.09
237 0.11
238 0.13
239 0.17
240 0.18
241 0.22
242 0.24
243 0.25
244 0.28
245 0.31
246 0.36
247 0.39
248 0.41
249 0.41
250 0.42
251 0.42
252 0.41
253 0.37
254 0.32
255 0.27
256 0.25
257 0.21
258 0.19
259 0.2
260 0.18
261 0.17
262 0.18
263 0.18
264 0.17
265 0.17
266 0.16
267 0.15
268 0.16
269 0.16
270 0.15
271 0.17
272 0.17
273 0.18
274 0.21
275 0.23
276 0.26
277 0.28
278 0.28
279 0.27
280 0.29
281 0.29
282 0.26
283 0.25
284 0.26
285 0.26
286 0.24
287 0.22
288 0.19
289 0.17
290 0.16
291 0.15
292 0.09
293 0.06
294 0.05
295 0.05