Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YML8

Protein Details
Accession W6YML8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-27VARPSQPPRLRRESQRPGVARHydrophilic
323-342HPNNKNPAPPRKTRKRTTAEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 5.5, cyto_mito 4, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040051  SECISBP2  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0035368  F:selenocysteine insertion sequence binding  
KEGG bze:COCCADRAFT_187  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSGSVAVARPSQPPRLRRESQRPGVARTATRQSNMEDDSAKPEEARKFVYTQQDILAKHKGKPPSLRVYLHPKHFRLNDSQETLSYASPMRELLQAIKDKVVPHNMVEELYEFNTPWYDNCLIVEVHDYRSSGVKPKDDANNTGEGSTNAFSIHNYNNFITPSPYAPFPVNKPEQKPTQPPVQSKDEDVKEDKENMPAPGQNGTPNKQAGLGKVRTVVLFPTPLSHLADIQLLATTPVPDMAALKRMQAQGRAAGMPPTPMTGVPSTPTFPNGPSPKRQKMVLDDTNLHEFEAEVLNTTCPPLYLEPTKSFGESLALMDAITHPNNKNPAPPRKTRKRTTAELAADEAEAQGLQRFMLAGDEFQSVMAAAATGNDDNAVRAAANSQTFARFKTIANIRANHEENDRRKKEEDARIAQAKRQAQMEAELQRKRELESRQQAEVAERQQAALRQQAQHQAQLQQNQLQQTQLQQNEALRAAAAAQHQMANAAAAQVTQTPQSATQSQFSPTIRQQTPMTASAASPRVGGQASHPIGGTPMVPSASNQAINSPARPPSSISHHQNQMARSISQQQNPSRTGTPHIVQGTPVMNPSMPNRNMTPTPSRMNQNSPSMAMQGQTPMMMQTPQPGQNMTPEAMQQLRVQQMRMQQLQQQGGSPGNQQQQMQQMAFQKAQQHIQQTGVPPNQNPQAYRQQLAQHYFRQLQQQHQNQQQQQQQMGMQNISTQGAMPQNAMPQQGMAFANMSLQQMRLRYQQQKATVMQNYSNTQSIPPQIMQQMQHMELQIKQREQREQQQAQMAQMQNGMGNQMNGGQMGGMQNANPANPMQMQQYQQLLQQQRQAAANQNRIMQMRQQAMANGGQLPQGMMGNMNAMGGMQGTMQGMNAMGNMGNVQGMNMGQMGQMNGGMGGMQNGQMNTGMQGMQNMQGMQGMNQMNQMNQQQMQQMMMMRQAQQQAQRMGQPGGQQGGDMGWTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.62
3 0.69
4 0.72
5 0.79
6 0.79
7 0.82
8 0.84
9 0.8
10 0.76
11 0.75
12 0.7
13 0.63
14 0.59
15 0.58
16 0.52
17 0.51
18 0.48
19 0.43
20 0.43
21 0.42
22 0.39
23 0.32
24 0.29
25 0.33
26 0.33
27 0.31
28 0.25
29 0.29
30 0.32
31 0.33
32 0.36
33 0.33
34 0.33
35 0.39
36 0.48
37 0.45
38 0.41
39 0.43
40 0.43
41 0.42
42 0.43
43 0.47
44 0.4
45 0.42
46 0.47
47 0.49
48 0.5
49 0.58
50 0.62
51 0.63
52 0.68
53 0.66
54 0.66
55 0.7
56 0.7
57 0.71
58 0.72
59 0.64
60 0.65
61 0.66
62 0.64
63 0.63
64 0.63
65 0.61
66 0.58
67 0.56
68 0.48
69 0.46
70 0.43
71 0.34
72 0.27
73 0.21
74 0.16
75 0.15
76 0.16
77 0.14
78 0.15
79 0.16
80 0.18
81 0.24
82 0.29
83 0.3
84 0.32
85 0.32
86 0.33
87 0.37
88 0.4
89 0.34
90 0.3
91 0.33
92 0.31
93 0.29
94 0.27
95 0.23
96 0.18
97 0.17
98 0.17
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.12
104 0.16
105 0.16
106 0.15
107 0.16
108 0.18
109 0.16
110 0.16
111 0.21
112 0.17
113 0.19
114 0.21
115 0.2
116 0.19
117 0.23
118 0.24
119 0.27
120 0.3
121 0.32
122 0.32
123 0.39
124 0.47
125 0.47
126 0.49
127 0.44
128 0.45
129 0.41
130 0.4
131 0.34
132 0.25
133 0.24
134 0.2
135 0.17
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.15
140 0.19
141 0.2
142 0.23
143 0.23
144 0.25
145 0.26
146 0.26
147 0.25
148 0.21
149 0.21
150 0.19
151 0.19
152 0.19
153 0.21
154 0.24
155 0.25
156 0.33
157 0.38
158 0.42
159 0.47
160 0.52
161 0.57
162 0.61
163 0.66
164 0.61
165 0.63
166 0.64
167 0.64
168 0.63
169 0.63
170 0.57
171 0.52
172 0.56
173 0.49
174 0.47
175 0.44
176 0.42
177 0.38
178 0.41
179 0.39
180 0.35
181 0.35
182 0.31
183 0.31
184 0.29
185 0.27
186 0.25
187 0.24
188 0.26
189 0.28
190 0.3
191 0.32
192 0.31
193 0.29
194 0.31
195 0.32
196 0.3
197 0.34
198 0.32
199 0.29
200 0.31
201 0.32
202 0.27
203 0.26
204 0.22
205 0.16
206 0.16
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.16
211 0.18
212 0.17
213 0.15
214 0.14
215 0.15
216 0.13
217 0.11
218 0.1
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.08
228 0.08
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.19
233 0.22
234 0.24
235 0.26
236 0.26
237 0.25
238 0.27
239 0.27
240 0.23
241 0.21
242 0.2
243 0.18
244 0.16
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.13
252 0.14
253 0.15
254 0.15
255 0.17
256 0.15
257 0.15
258 0.23
259 0.29
260 0.32
261 0.4
262 0.48
263 0.53
264 0.55
265 0.57
266 0.52
267 0.52
268 0.58
269 0.54
270 0.5
271 0.45
272 0.46
273 0.47
274 0.42
275 0.34
276 0.24
277 0.18
278 0.15
279 0.14
280 0.11
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.07
288 0.09
289 0.08
290 0.13
291 0.17
292 0.21
293 0.23
294 0.27
295 0.28
296 0.27
297 0.25
298 0.21
299 0.17
300 0.14
301 0.12
302 0.09
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.09
308 0.09
309 0.12
310 0.12
311 0.15
312 0.2
313 0.2
314 0.26
315 0.33
316 0.43
317 0.46
318 0.55
319 0.63
320 0.7
321 0.79
322 0.79
323 0.81
324 0.77
325 0.77
326 0.75
327 0.74
328 0.65
329 0.57
330 0.51
331 0.41
332 0.33
333 0.27
334 0.19
335 0.1
336 0.07
337 0.05
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.07
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.05
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.09
373 0.12
374 0.13
375 0.14
376 0.16
377 0.15
378 0.15
379 0.22
380 0.27
381 0.31
382 0.35
383 0.36
384 0.36
385 0.42
386 0.43
387 0.37
388 0.37
389 0.37
390 0.41
391 0.49
392 0.48
393 0.44
394 0.44
395 0.49
396 0.52
397 0.54
398 0.54
399 0.49
400 0.53
401 0.56
402 0.56
403 0.52
404 0.48
405 0.42
406 0.35
407 0.31
408 0.26
409 0.19
410 0.21
411 0.24
412 0.24
413 0.28
414 0.28
415 0.28
416 0.3
417 0.3
418 0.28
419 0.3
420 0.28
421 0.32
422 0.39
423 0.42
424 0.4
425 0.41
426 0.39
427 0.35
428 0.34
429 0.25
430 0.2
431 0.16
432 0.16
433 0.16
434 0.18
435 0.17
436 0.18
437 0.19
438 0.17
439 0.2
440 0.27
441 0.27
442 0.28
443 0.28
444 0.3
445 0.29
446 0.32
447 0.31
448 0.28
449 0.29
450 0.28
451 0.26
452 0.21
453 0.19
454 0.19
455 0.23
456 0.19
457 0.18
458 0.17
459 0.17
460 0.18
461 0.18
462 0.14
463 0.08
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.05
475 0.05
476 0.04
477 0.04
478 0.03
479 0.03
480 0.04
481 0.04
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.06
486 0.08
487 0.11
488 0.12
489 0.13
490 0.14
491 0.15
492 0.19
493 0.19
494 0.21
495 0.2
496 0.27
497 0.25
498 0.27
499 0.26
500 0.25
501 0.28
502 0.25
503 0.24
504 0.16
505 0.16
506 0.17
507 0.18
508 0.15
509 0.12
510 0.11
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.09
515 0.16
516 0.16
517 0.16
518 0.16
519 0.15
520 0.15
521 0.15
522 0.14
523 0.06
524 0.06
525 0.05
526 0.06
527 0.06
528 0.09
529 0.1
530 0.11
531 0.1
532 0.1
533 0.14
534 0.15
535 0.16
536 0.14
537 0.16
538 0.15
539 0.16
540 0.18
541 0.17
542 0.24
543 0.31
544 0.34
545 0.37
546 0.4
547 0.44
548 0.44
549 0.42
550 0.38
551 0.33
552 0.28
553 0.24
554 0.29
555 0.29
556 0.3
557 0.36
558 0.36
559 0.39
560 0.4
561 0.42
562 0.35
563 0.32
564 0.31
565 0.29
566 0.26
567 0.26
568 0.26
569 0.23
570 0.21
571 0.22
572 0.19
573 0.16
574 0.15
575 0.11
576 0.09
577 0.1
578 0.13
579 0.19
580 0.19
581 0.21
582 0.22
583 0.25
584 0.26
585 0.29
586 0.32
587 0.28
588 0.31
589 0.33
590 0.36
591 0.35
592 0.4
593 0.4
594 0.4
595 0.36
596 0.33
597 0.3
598 0.27
599 0.24
600 0.19
601 0.14
602 0.11
603 0.1
604 0.08
605 0.08
606 0.06
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.09
611 0.13
612 0.16
613 0.17
614 0.17
615 0.17
616 0.2
617 0.22
618 0.19
619 0.16
620 0.13
621 0.15
622 0.15
623 0.16
624 0.13
625 0.15
626 0.2
627 0.2
628 0.21
629 0.21
630 0.27
631 0.32
632 0.33
633 0.31
634 0.3
635 0.35
636 0.37
637 0.34
638 0.29
639 0.24
640 0.23
641 0.22
642 0.2
643 0.2
644 0.22
645 0.23
646 0.23
647 0.24
648 0.29
649 0.31
650 0.29
651 0.27
652 0.28
653 0.29
654 0.3
655 0.29
656 0.28
657 0.27
658 0.31
659 0.3
660 0.29
661 0.27
662 0.28
663 0.29
664 0.27
665 0.32
666 0.32
667 0.31
668 0.27
669 0.3
670 0.34
671 0.33
672 0.31
673 0.29
674 0.36
675 0.37
676 0.38
677 0.37
678 0.38
679 0.41
680 0.46
681 0.44
682 0.38
683 0.4
684 0.42
685 0.4
686 0.43
687 0.4
688 0.44
689 0.49
690 0.54
691 0.57
692 0.62
693 0.68
694 0.64
695 0.68
696 0.65
697 0.6
698 0.52
699 0.46
700 0.41
701 0.36
702 0.35
703 0.27
704 0.22
705 0.18
706 0.18
707 0.17
708 0.13
709 0.09
710 0.1
711 0.12
712 0.13
713 0.13
714 0.13
715 0.15
716 0.17
717 0.18
718 0.15
719 0.13
720 0.12
721 0.15
722 0.14
723 0.12
724 0.11
725 0.1
726 0.11
727 0.12
728 0.13
729 0.1
730 0.1
731 0.12
732 0.13
733 0.16
734 0.21
735 0.27
736 0.34
737 0.4
738 0.45
739 0.48
740 0.52
741 0.53
742 0.54
743 0.51
744 0.46
745 0.43
746 0.41
747 0.38
748 0.35
749 0.33
750 0.26
751 0.22
752 0.23
753 0.23
754 0.22
755 0.2
756 0.21
757 0.22
758 0.26
759 0.26
760 0.28
761 0.29
762 0.27
763 0.28
764 0.25
765 0.24
766 0.24
767 0.3
768 0.31
769 0.32
770 0.36
771 0.39
772 0.46
773 0.51
774 0.58
775 0.6
776 0.59
777 0.59
778 0.62
779 0.59
780 0.52
781 0.53
782 0.44
783 0.35
784 0.32
785 0.27
786 0.2
787 0.18
788 0.18
789 0.11
790 0.1
791 0.09
792 0.1
793 0.1
794 0.09
795 0.09
796 0.07
797 0.07
798 0.08
799 0.09
800 0.08
801 0.07
802 0.11
803 0.11
804 0.12
805 0.11
806 0.11
807 0.12
808 0.13
809 0.15
810 0.16
811 0.2
812 0.22
813 0.25
814 0.29
815 0.27
816 0.29
817 0.35
818 0.35
819 0.34
820 0.38
821 0.37
822 0.36
823 0.38
824 0.38
825 0.4
826 0.43
827 0.48
828 0.45
829 0.45
830 0.46
831 0.45
832 0.45
833 0.4
834 0.39
835 0.35
836 0.34
837 0.32
838 0.29
839 0.3
840 0.3
841 0.26
842 0.2
843 0.16
844 0.15
845 0.14
846 0.13
847 0.12
848 0.1
849 0.09
850 0.08
851 0.08
852 0.08
853 0.08
854 0.08
855 0.06
856 0.06
857 0.06
858 0.05
859 0.05
860 0.04
861 0.05
862 0.06
863 0.06
864 0.06
865 0.06
866 0.06
867 0.06
868 0.06
869 0.06
870 0.05
871 0.06
872 0.06
873 0.06
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.06
878 0.06
879 0.07
880 0.07
881 0.07
882 0.06
883 0.08
884 0.08
885 0.08
886 0.08
887 0.07
888 0.07
889 0.06
890 0.06
891 0.05
892 0.06
893 0.06
894 0.08
895 0.1
896 0.1
897 0.11
898 0.11
899 0.12
900 0.11
901 0.12
902 0.11
903 0.09
904 0.12
905 0.12
906 0.14
907 0.16
908 0.15
909 0.14
910 0.16
911 0.16
912 0.15
913 0.2
914 0.19
915 0.17
916 0.22
917 0.23
918 0.21
919 0.26
920 0.28
921 0.26
922 0.26
923 0.28
924 0.27
925 0.28
926 0.28
927 0.25
928 0.25
929 0.22
930 0.25
931 0.25
932 0.24
933 0.28
934 0.32
935 0.34
936 0.38
937 0.44
938 0.44
939 0.44
940 0.46
941 0.45
942 0.43
943 0.41
944 0.39
945 0.36
946 0.34
947 0.3
948 0.25
949 0.22
950 0.2