Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B2VW44

Protein Details
Accession B2VW44    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAPARKRSTNIARRRRTDDEDHydrophilic
64-83TQGKSKRKANGARDAKPRQSHydrophilic
149-168TLAERRRREHDEYKKKRDSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-77SKRKANGARD
193-216RPAGRGRGRGAPIRGPFSPAKALR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.833, mito 8.5, cyto_mito 7.333, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MAPARKRSTNIARRRRTDDEDESQSVATLADDSQSDASVLSDVDEDADADNSDLSEVDSAPSLTQGKSKRKANGARDAKPRQSASDRQPSPPIARSDVAFTALKETEIMMNGLKIGEGANEAKVVDFETGVAAGEVAPAVGAPSSRAETLAERRRREHDEYKKKRDSDPAFIPNRGAFFMHDQRHAPGQNGFRPAGRGRGRGAPIRGPFSPAKALRPNQQGFGRGRGRFGSFGGGFSSRRTSAYGGSVYSPSVAMSRRSSIAREMGRDNLVSPAGSIMSRNGGFADPSRPVVRLPPGGPRMPSGPSIISPTNGAVQPPYPLPQKPTFRENWQGQIPMHQPRPQKTVSVAGIESPASMSFNPPQQQEQQPFHQQVPAHINGATQANDQSFYQHGRHPSYPSQVSTGTPLNNIPERAIHAPTFQPYAQPGFQPQAFVPQGYYYPQNNAQPQYMAPAGMVPMFVPGAQQPGYVMPVSAPPVAAPPAPAGPPNMVAYESNGMTYYVDSAQLYPAPAVDNYAQPSYAVPGMGGMMTPGPDGAYYYPQQMQPAAYYPQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.82
3 0.79
4 0.77
5 0.75
6 0.73
7 0.7
8 0.66
9 0.59
10 0.51
11 0.43
12 0.34
13 0.25
14 0.17
15 0.11
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.1
23 0.09
24 0.09
25 0.09
26 0.08
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.11
49 0.13
50 0.12
51 0.18
52 0.26
53 0.35
54 0.43
55 0.5
56 0.55
57 0.63
58 0.72
59 0.74
60 0.77
61 0.76
62 0.77
63 0.8
64 0.81
65 0.77
66 0.74
67 0.68
68 0.63
69 0.61
70 0.61
71 0.6
72 0.62
73 0.59
74 0.56
75 0.6
76 0.57
77 0.55
78 0.53
79 0.48
80 0.41
81 0.4
82 0.37
83 0.35
84 0.32
85 0.3
86 0.25
87 0.21
88 0.21
89 0.2
90 0.19
91 0.15
92 0.15
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.08
101 0.07
102 0.06
103 0.05
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.08
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.03
124 0.03
125 0.02
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.04
130 0.06
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.14
136 0.24
137 0.32
138 0.38
139 0.4
140 0.43
141 0.49
142 0.54
143 0.58
144 0.59
145 0.61
146 0.65
147 0.73
148 0.8
149 0.82
150 0.78
151 0.74
152 0.74
153 0.68
154 0.65
155 0.64
156 0.63
157 0.58
158 0.56
159 0.53
160 0.44
161 0.39
162 0.31
163 0.23
164 0.15
165 0.18
166 0.25
167 0.27
168 0.28
169 0.28
170 0.29
171 0.34
172 0.33
173 0.28
174 0.26
175 0.28
176 0.3
177 0.33
178 0.32
179 0.27
180 0.3
181 0.29
182 0.33
183 0.31
184 0.29
185 0.28
186 0.34
187 0.37
188 0.38
189 0.4
190 0.37
191 0.35
192 0.37
193 0.35
194 0.32
195 0.3
196 0.28
197 0.32
198 0.27
199 0.3
200 0.34
201 0.36
202 0.4
203 0.48
204 0.46
205 0.44
206 0.45
207 0.45
208 0.4
209 0.45
210 0.44
211 0.36
212 0.36
213 0.33
214 0.32
215 0.27
216 0.26
217 0.23
218 0.17
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.15
223 0.15
224 0.18
225 0.13
226 0.13
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.16
231 0.16
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.1
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.14
245 0.15
246 0.16
247 0.16
248 0.21
249 0.21
250 0.22
251 0.22
252 0.22
253 0.22
254 0.21
255 0.19
256 0.14
257 0.13
258 0.1
259 0.08
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.11
273 0.09
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.15
279 0.17
280 0.17
281 0.18
282 0.23
283 0.26
284 0.27
285 0.27
286 0.26
287 0.25
288 0.23
289 0.23
290 0.17
291 0.14
292 0.14
293 0.17
294 0.16
295 0.15
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.12
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.13
306 0.13
307 0.14
308 0.19
309 0.26
310 0.33
311 0.34
312 0.39
313 0.4
314 0.42
315 0.5
316 0.47
317 0.45
318 0.41
319 0.41
320 0.35
321 0.37
322 0.36
323 0.34
324 0.36
325 0.35
326 0.37
327 0.38
328 0.43
329 0.38
330 0.36
331 0.31
332 0.34
333 0.31
334 0.29
335 0.25
336 0.2
337 0.2
338 0.18
339 0.16
340 0.1
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.1
346 0.15
347 0.18
348 0.19
349 0.22
350 0.26
351 0.33
352 0.37
353 0.4
354 0.41
355 0.45
356 0.46
357 0.44
358 0.42
359 0.35
360 0.34
361 0.36
362 0.31
363 0.25
364 0.23
365 0.22
366 0.2
367 0.22
368 0.18
369 0.12
370 0.12
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.15
377 0.16
378 0.18
379 0.23
380 0.28
381 0.3
382 0.34
383 0.37
384 0.41
385 0.42
386 0.39
387 0.37
388 0.33
389 0.31
390 0.29
391 0.28
392 0.22
393 0.2
394 0.19
395 0.2
396 0.22
397 0.22
398 0.19
399 0.17
400 0.2
401 0.22
402 0.23
403 0.2
404 0.19
405 0.21
406 0.22
407 0.25
408 0.21
409 0.2
410 0.19
411 0.23
412 0.22
413 0.21
414 0.22
415 0.23
416 0.23
417 0.23
418 0.21
419 0.25
420 0.25
421 0.24
422 0.22
423 0.19
424 0.19
425 0.2
426 0.25
427 0.17
428 0.22
429 0.27
430 0.32
431 0.35
432 0.37
433 0.36
434 0.33
435 0.31
436 0.31
437 0.26
438 0.2
439 0.15
440 0.13
441 0.12
442 0.11
443 0.11
444 0.06
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.11
455 0.14
456 0.13
457 0.12
458 0.09
459 0.12
460 0.15
461 0.14
462 0.13
463 0.11
464 0.13
465 0.15
466 0.15
467 0.13
468 0.12
469 0.14
470 0.15
471 0.16
472 0.16
473 0.16
474 0.19
475 0.19
476 0.18
477 0.17
478 0.16
479 0.18
480 0.2
481 0.18
482 0.16
483 0.15
484 0.15
485 0.14
486 0.14
487 0.13
488 0.1
489 0.11
490 0.11
491 0.12
492 0.13
493 0.14
494 0.15
495 0.13
496 0.13
497 0.13
498 0.12
499 0.15
500 0.15
501 0.18
502 0.2
503 0.21
504 0.21
505 0.19
506 0.2
507 0.19
508 0.19
509 0.15
510 0.11
511 0.1
512 0.11
513 0.11
514 0.1
515 0.07
516 0.06
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.06
521 0.06
522 0.08
523 0.1
524 0.15
525 0.16
526 0.2
527 0.25
528 0.26
529 0.28
530 0.28
531 0.27
532 0.25
533 0.28