FuNGI

W6Y155

Protein Details

Accession

W6Y155

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
28-59	QQPQPPQQQMPVRRRRPRPQADVLRKPRRPLQ	Hydrophilic
538-564	EASGNESSRKKHKKKHHEKLADGSRKS	Basic
578-602	SEMTDAGKKRKKEKKEKNRIMLGGS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
40-56	RRRRPRPQADVLRKPRR
185-186	RK
199-208	GMKKPPAFHK
521-563	KPGESKSKKRPGSPNLSEASGNESSRKKHKKKHHEKLADGSRK
584-597	GKKRKKEKKEKNRI

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	bze:COCCADRAFT_108365 -

Amino Acid Sequences

MNGAMNGSQPPTAAPVAPVASNGQQPSQQPQPPQQQMPVRRRRPRPQADVLRKPRRPLQNITKPMVSLSQMNEARKPPPGPAADGTHSKDALRQEYLDQGATVFPLIVSRKDLKELRHHVMRLQSKSHVDITDEKQFTPPIKLHRRDPRAPPSGIGSHYEEEDTKEDLEEIKERERIEQQKEERRKVREENQAKIAPTGMKKPPAFHKKTEQKYRPDDTPEAKKRQLLRYEETLPWHLEDYENKQTWVGTYESELSETHVMLSATHPGDPNTAIQMAPMERWYRFNVKGKIKPTSDDVDKILAKVESGGPRFFAELERRQAQRMKAEDEARMFSGVRTRVGGGADDEGRIKRERFDDDTIGFVKREADADDIDFNLEEDFADDEEGLNGLFEGEEQDVKEAAEKLKRDQLQAALWDRPDEQLIAQKEEEERRAAEETRAMEKITRKTLAKREKQYDYLDSDPENPYLTESESDTDSETERQQAKEEAEKKAAEQNGKAPEAGNVPSGASTKGSNTPSGNHKPGESKSKKRPGSPNLSEASGNESSRKKHKKKHHEKLADGSRKSTLGNLKGAGSGSDSEMTDAGKKRKKEKKEKNRIMLGGSPAGTPGASRAGSPAANGSRAGSPSAGPSKPSLPSAKEIYESLPPQGMNIQNLILKFKGRVDKSNTQVFIKLVKAVSRFDKAKSWLTPLEKLPSDEHINAFMNAANAPKPA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.16
3	0.18
4	0.18
5	0.18
6	0.17
7	0.19
8	0.23
9	0.23
10	0.22
11	0.24
12	0.26
13	0.31
14	0.37
15	0.39
16	0.4
17	0.48
18	0.57
19	0.61
20	0.63
21	0.65
22	0.65
23	0.7
24	0.76
25	0.78
26	0.78
27	0.8
28	0.86
29	0.88
30	0.9
31	0.91
32	0.89
33	0.89
34	0.9
35	0.91
36	0.91
37	0.92
38	0.92
39	0.85
40	0.82
41	0.79
42	0.79
43	0.74
44	0.74
45	0.74
46	0.74
47	0.78
48	0.77
49	0.71
50	0.6
51	0.55
52	0.48
53	0.38
54	0.31
55	0.26
56	0.31
57	0.33
58	0.35
59	0.38
60	0.38
61	0.38
62	0.41
63	0.39
64	0.33
65	0.36
66	0.36
67	0.37
68	0.38
69	0.42
70	0.4
71	0.44
72	0.45
73	0.41
74	0.39
75	0.34
76	0.33
77	0.32
78	0.33
79	0.29
80	0.27
81	0.25
82	0.3
83	0.31
84	0.28
85	0.23
86	0.19
87	0.16
88	0.15
89	0.13
90	0.08
91	0.06
92	0.09
93	0.11
94	0.12
95	0.17
96	0.21
97	0.22
98	0.3
99	0.34
100	0.35
101	0.44
102	0.5
103	0.53
104	0.56
105	0.55
106	0.52
107	0.57
108	0.6
109	0.54
110	0.51
111	0.49
112	0.44
113	0.47
114	0.47
115	0.38
116	0.33
117	0.35
118	0.37
119	0.41
120	0.39
121	0.36
122	0.34
123	0.36
124	0.34
125	0.33
126	0.31
127	0.32
128	0.42
129	0.46
130	0.54
131	0.62
132	0.69
133	0.71
134	0.77
135	0.76
136	0.73
137	0.69
138	0.61
139	0.56
140	0.52
141	0.46
142	0.4
143	0.33
144	0.27
145	0.26
146	0.26
147	0.21
148	0.2
149	0.2
150	0.18
151	0.14
152	0.13
153	0.13
154	0.14
155	0.15
156	0.17
157	0.17
158	0.2
159	0.23
160	0.23
161	0.26
162	0.33
163	0.38
164	0.41
165	0.47
166	0.52
167	0.59
168	0.68
169	0.73
170	0.72
171	0.7
172	0.71
173	0.7
174	0.71
175	0.72
176	0.69
177	0.66
178	0.66
179	0.65
180	0.58
181	0.5
182	0.43
183	0.37
184	0.32
185	0.34
186	0.3
187	0.34
188	0.34
189	0.38
190	0.46
191	0.52
192	0.55
193	0.53
194	0.6
195	0.62
196	0.71
197	0.78
198	0.76
199	0.74
200	0.78
201	0.77
202	0.72
203	0.68
204	0.64
205	0.59
206	0.63
207	0.62
208	0.61
209	0.58
210	0.57
211	0.57
212	0.6
213	0.61
214	0.56
215	0.52
216	0.52
217	0.54
218	0.51
219	0.48
220	0.42
221	0.35
222	0.3
223	0.26
224	0.2
225	0.17
226	0.18
227	0.21
228	0.28
229	0.27
230	0.27
231	0.26
232	0.26
233	0.25
234	0.24
235	0.18
236	0.09
237	0.1
238	0.12
239	0.12
240	0.13
241	0.13
242	0.12
243	0.12
244	0.12
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.09
249	0.09
250	0.12
251	0.12
252	0.13
253	0.13
254	0.12
255	0.13
256	0.14
257	0.14
258	0.1
259	0.1
260	0.09
261	0.09
262	0.1
263	0.09
264	0.09
265	0.11
266	0.11
267	0.11
268	0.14
269	0.17
270	0.21
271	0.26
272	0.35
273	0.41
274	0.47
275	0.53
276	0.55
277	0.58
278	0.54
279	0.5
280	0.45
281	0.42
282	0.36
283	0.32
284	0.29
285	0.26
286	0.26
287	0.24
288	0.21
289	0.16
290	0.13
291	0.12
292	0.14
293	0.15
294	0.16
295	0.16
296	0.16
297	0.16
298	0.16
299	0.16
300	0.15
301	0.16
302	0.2
303	0.25
304	0.29
305	0.29
306	0.31
307	0.35
308	0.34
309	0.35
310	0.33
311	0.32
312	0.32
313	0.33
314	0.33
315	0.31
316	0.29
317	0.23
318	0.21
319	0.18
320	0.13
321	0.16
322	0.14
323	0.13
324	0.12
325	0.12
326	0.13
327	0.13
328	0.13
329	0.09
330	0.1
331	0.1
332	0.09
333	0.1
334	0.09
335	0.1
336	0.12
337	0.11
338	0.12
339	0.15
340	0.18
341	0.22
342	0.26
343	0.27
344	0.26
345	0.27
346	0.26
347	0.24
348	0.2
349	0.15
350	0.12
351	0.09
352	0.1
353	0.08
354	0.09
355	0.08
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.08
360	0.08
361	0.07
362	0.05
363	0.05
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.02
378	0.02
379	0.04
380	0.04
381	0.05
382	0.05
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.08
387	0.08
388	0.1
389	0.14
390	0.14
391	0.16
392	0.23
393	0.25
394	0.25
395	0.25
396	0.26
397	0.24
398	0.28
399	0.29
400	0.24
401	0.22
402	0.22
403	0.2
404	0.18
405	0.16
406	0.12
407	0.09
408	0.14
409	0.15
410	0.17
411	0.16
412	0.17
413	0.19
414	0.21
415	0.23
416	0.18
417	0.17
418	0.16
419	0.19
420	0.18
421	0.17
422	0.17
423	0.18
424	0.2
425	0.2
426	0.18
427	0.19
428	0.24
429	0.27
430	0.29
431	0.3
432	0.29
433	0.35
434	0.45
435	0.52
436	0.56
437	0.6
438	0.62
439	0.63
440	0.66
441	0.63
442	0.58
443	0.53
444	0.46
445	0.39
446	0.33
447	0.31
448	0.28
449	0.24
450	0.21
451	0.15
452	0.14
453	0.13
454	0.13
455	0.11
456	0.1
457	0.11
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.11
462	0.11
463	0.12
464	0.12
465	0.17
466	0.19
467	0.19
468	0.2
469	0.22
470	0.24
471	0.3
472	0.34
473	0.32
474	0.33
475	0.33
476	0.33
477	0.35
478	0.37
479	0.3
480	0.27
481	0.3
482	0.31
483	0.32
484	0.31
485	0.25
486	0.23
487	0.23
488	0.23
489	0.18
490	0.12
491	0.11
492	0.12
493	0.13
494	0.11
495	0.1
496	0.09
497	0.11
498	0.17
499	0.18
500	0.2
501	0.21
502	0.24
503	0.32
504	0.38
505	0.4
506	0.35
507	0.35
508	0.38
509	0.41
510	0.48
511	0.48
512	0.5
513	0.57
514	0.66
515	0.69
516	0.72
517	0.77
518	0.76
519	0.78
520	0.74
521	0.71
522	0.62
523	0.6
524	0.51
525	0.42
526	0.39
527	0.31
528	0.26
529	0.24
530	0.25
531	0.28
532	0.38
533	0.49
534	0.51
535	0.57
536	0.68
537	0.74
538	0.83
539	0.9
540	0.91
541	0.9
542	0.87
543	0.88
544	0.88
545	0.85
546	0.75
547	0.66
548	0.56
549	0.47
550	0.42
551	0.37
552	0.33
553	0.28
554	0.31
555	0.3
556	0.28
557	0.29
558	0.29
559	0.23
560	0.18
561	0.14
562	0.13
563	0.13
564	0.12
565	0.12
566	0.12
567	0.12
568	0.16
569	0.21
570	0.28
571	0.32
572	0.38
573	0.48
574	0.57
575	0.67
576	0.73
577	0.79
578	0.82
579	0.87
580	0.93
581	0.92
582	0.92
583	0.84
584	0.77
585	0.7
586	0.63
587	0.55
588	0.45
589	0.35
590	0.26
591	0.23
592	0.19
593	0.13
594	0.11
595	0.11
596	0.11
597	0.11
598	0.12
599	0.15
600	0.16
601	0.16
602	0.21
603	0.19
604	0.2
605	0.2
606	0.2
607	0.21
608	0.21
609	0.22
610	0.17
611	0.15
612	0.2
613	0.27
614	0.25
615	0.24
616	0.26
617	0.28
618	0.3
619	0.34
620	0.33
621	0.3
622	0.35
623	0.38
624	0.38
625	0.36
626	0.35
627	0.32
628	0.34
629	0.32
630	0.29
631	0.27
632	0.24
633	0.23
634	0.28
635	0.29
636	0.23
637	0.23
638	0.23
639	0.22
640	0.23
641	0.25
642	0.2
643	0.19
644	0.19
645	0.24
646	0.31
647	0.33
648	0.41
649	0.47
650	0.55
651	0.59
652	0.67
653	0.63
654	0.56
655	0.55
656	0.49
657	0.44
658	0.36
659	0.35
660	0.28
661	0.3
662	0.3
663	0.32
664	0.36
665	0.4
666	0.4
667	0.39
668	0.44
669	0.44
670	0.5
671	0.49
672	0.5
673	0.49
674	0.52
675	0.55
676	0.52
677	0.56
678	0.5
679	0.49
680	0.45
681	0.44
682	0.45
683	0.42
684	0.39
685	0.36
686	0.35
687	0.33
688	0.31
689	0.26
690	0.2
691	0.18
692	0.19

W6Y155

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer