Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A061HB42

Protein Details
Accession A0A061HB42    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-77AQHASQQLFRDRQRRRQQLRAANLAAHydrophilic
1188-1208AINTRTKQLKNEAERRQLKELHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG pfp:PFL1_02491  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MSARSQPTAANPSAANPSSSTANSNQSSAAATPSIAASNIPTAPAKDDAAAAQHASQQLFRDRQRRRQQLRAANLAAWSAGPSIPSSSLDSNLKKNTAFIKRVKQSLAQDARDQLIRDLGTLSLDKYREEIVQAVPEGLQKCINPKDCMAAAEILSAFHCRFGGDAFSAPLTSILSATLAPPNKLALQSIPQEQRERDEAARVARQKQLLRVAADLALVEVVGHSKDQSSAVWLYQVTKELLATDKDHVNVPILITLLRALAPALVDPPSTADAGTSADPEGIAKGVSAISLQDAAGAAGAVAELDAADPEAAPLVTTEMKAKFRKLFETYFATLSRKIVKEHERLQEQDRRNHEAYIRYGEIFEDRQQTYEKMTKGFERYHEWGKLLSDLLGVPMPKLVDAAKSNAIGLGVNLDSKSALFNERSDEDFGSNQSPWEDEDTRRFYEDLLDLSDVIPPSVLAGTSSSTASASKDTDGDASARDGQDPASPDPSRSPRPVSDGEDASEGAVGTTSGADAASEDQMNAGPAAQLNSLLAKLPDLTNRAMIDSAAVDFAFLASKPARRKLVKHLSSIPRSRLDLIPYYARLAATLNRYMPDVGSGLVGTLDDEFRYFQRKKNVELTESRAKNARFLAELTKFKVTPSHTIFHCLKVCLEDFSGPNIDVLATLLETCGRYLLRTEESSAKMRSMLEMLRRKRGLVNLDARQLLMLDNAYYQCNPPERKAIEQKVRSPMELFVRHLVYDVLTKKTLDKVLKLLRKLHWEDPTTVDTLKALFTRVWKMKFSNIHLLAILVYDLQAYHLAFTVDVIDQVLENIRTGLEQNIFKHNQRRVATVRYLGELYNYRLINSGIVFDQLWSLTTFGHPGGRPLPGQVTPIDAPDDYFRIRLICTLLDTCGMCFDRGSLKKKLDEFLVFLNLYVLSKERPLPMEVDFMLSDTLESLRPKFQLKTDFAEAALEVDLMLAAHRASNPASGSGAEGAGDGDYDDEFDEDEDEDDDSDDDDDDDDGRSGDESRRGPKMRNGGDSTGVSQLGDDDFDDDDEDDDDAINDFSEGGSHLGRDTDAEEDEAMVRRREEEATIKREADDEFDRELAKMMSESGSSVGIKTQNRGLSDVGIPMIRSRRASQSSAYASKSDRSDRELGTGTSGDDDDDDDDDDEGQHMRFSLLSKKGNKQTTHEVKVPATSAIAINTRTKQLKNEAERRQLKELVLAYEGREEEADRRSLEQTLSRRGFKVKFADEQRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.29
3 0.23
4 0.25
5 0.26
6 0.26
7 0.27
8 0.24
9 0.31
10 0.31
11 0.31
12 0.29
13 0.26
14 0.27
15 0.23
16 0.22
17 0.14
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.11
23 0.11
24 0.1
25 0.13
26 0.13
27 0.15
28 0.15
29 0.15
30 0.18
31 0.21
32 0.2
33 0.17
34 0.18
35 0.17
36 0.19
37 0.19
38 0.17
39 0.16
40 0.18
41 0.2
42 0.2
43 0.21
44 0.22
45 0.29
46 0.35
47 0.42
48 0.48
49 0.54
50 0.64
51 0.73
52 0.8
53 0.81
54 0.83
55 0.86
56 0.86
57 0.87
58 0.85
59 0.76
60 0.67
61 0.59
62 0.49
63 0.39
64 0.29
65 0.21
66 0.13
67 0.11
68 0.09
69 0.09
70 0.11
71 0.12
72 0.14
73 0.18
74 0.18
75 0.22
76 0.29
77 0.32
78 0.37
79 0.4
80 0.41
81 0.37
82 0.4
83 0.44
84 0.46
85 0.5
86 0.51
87 0.57
88 0.61
89 0.66
90 0.66
91 0.63
92 0.6
93 0.63
94 0.64
95 0.57
96 0.54
97 0.52
98 0.51
99 0.47
100 0.42
101 0.32
102 0.28
103 0.25
104 0.21
105 0.19
106 0.17
107 0.16
108 0.16
109 0.16
110 0.17
111 0.17
112 0.17
113 0.17
114 0.19
115 0.18
116 0.19
117 0.2
118 0.17
119 0.21
120 0.21
121 0.2
122 0.18
123 0.22
124 0.21
125 0.2
126 0.2
127 0.17
128 0.23
129 0.31
130 0.36
131 0.34
132 0.35
133 0.39
134 0.38
135 0.38
136 0.34
137 0.28
138 0.22
139 0.22
140 0.2
141 0.15
142 0.14
143 0.15
144 0.13
145 0.11
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.13
151 0.12
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.1
159 0.09
160 0.08
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.14
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.18
170 0.19
171 0.2
172 0.2
173 0.17
174 0.2
175 0.23
176 0.31
177 0.35
178 0.37
179 0.41
180 0.41
181 0.42
182 0.41
183 0.41
184 0.35
185 0.34
186 0.33
187 0.34
188 0.4
189 0.4
190 0.41
191 0.41
192 0.46
193 0.43
194 0.46
195 0.5
196 0.47
197 0.44
198 0.41
199 0.38
200 0.32
201 0.29
202 0.23
203 0.14
204 0.09
205 0.07
206 0.06
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.15
220 0.15
221 0.16
222 0.17
223 0.2
224 0.16
225 0.15
226 0.15
227 0.14
228 0.16
229 0.16
230 0.17
231 0.18
232 0.19
233 0.2
234 0.21
235 0.21
236 0.2
237 0.18
238 0.17
239 0.15
240 0.12
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.03
287 0.03
288 0.02
289 0.02
290 0.02
291 0.02
292 0.02
293 0.02
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.06
303 0.07
304 0.08
305 0.12
306 0.15
307 0.22
308 0.24
309 0.29
310 0.32
311 0.34
312 0.4
313 0.41
314 0.4
315 0.38
316 0.43
317 0.41
318 0.38
319 0.37
320 0.33
321 0.3
322 0.29
323 0.31
324 0.25
325 0.25
326 0.31
327 0.37
328 0.42
329 0.49
330 0.55
331 0.53
332 0.54
333 0.59
334 0.6
335 0.57
336 0.57
337 0.55
338 0.54
339 0.51
340 0.5
341 0.47
342 0.43
343 0.41
344 0.39
345 0.36
346 0.28
347 0.27
348 0.25
349 0.24
350 0.21
351 0.21
352 0.2
353 0.19
354 0.2
355 0.22
356 0.22
357 0.25
358 0.28
359 0.26
360 0.23
361 0.25
362 0.28
363 0.31
364 0.33
365 0.32
366 0.33
367 0.36
368 0.4
369 0.4
370 0.37
371 0.34
372 0.31
373 0.29
374 0.22
375 0.18
376 0.12
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.08
386 0.07
387 0.1
388 0.11
389 0.14
390 0.15
391 0.16
392 0.16
393 0.15
394 0.15
395 0.11
396 0.09
397 0.08
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.07
405 0.06
406 0.09
407 0.09
408 0.1
409 0.14
410 0.15
411 0.17
412 0.18
413 0.18
414 0.17
415 0.17
416 0.18
417 0.16
418 0.15
419 0.13
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.15
424 0.17
425 0.16
426 0.23
427 0.27
428 0.28
429 0.29
430 0.28
431 0.23
432 0.24
433 0.23
434 0.17
435 0.14
436 0.14
437 0.13
438 0.13
439 0.14
440 0.11
441 0.09
442 0.08
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.04
448 0.05
449 0.06
450 0.07
451 0.07
452 0.06
453 0.07
454 0.07
455 0.08
456 0.09
457 0.09
458 0.08
459 0.09
460 0.09
461 0.09
462 0.1
463 0.09
464 0.08
465 0.09
466 0.11
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.1
471 0.12
472 0.15
473 0.15
474 0.18
475 0.18
476 0.19
477 0.24
478 0.29
479 0.31
480 0.31
481 0.33
482 0.29
483 0.34
484 0.37
485 0.37
486 0.36
487 0.32
488 0.3
489 0.27
490 0.25
491 0.19
492 0.16
493 0.1
494 0.06
495 0.05
496 0.04
497 0.03
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.04
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.05
513 0.04
514 0.04
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.06
521 0.06
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.06
526 0.09
527 0.11
528 0.11
529 0.13
530 0.14
531 0.14
532 0.13
533 0.12
534 0.1
535 0.08
536 0.07
537 0.05
538 0.05
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.06
545 0.06
546 0.11
547 0.14
548 0.19
549 0.26
550 0.28
551 0.32
552 0.4
553 0.5
554 0.51
555 0.52
556 0.56
557 0.57
558 0.62
559 0.63
560 0.55
561 0.47
562 0.43
563 0.41
564 0.34
565 0.29
566 0.24
567 0.23
568 0.21
569 0.19
570 0.19
571 0.18
572 0.16
573 0.13
574 0.11
575 0.12
576 0.13
577 0.14
578 0.14
579 0.13
580 0.14
581 0.14
582 0.13
583 0.11
584 0.08
585 0.06
586 0.06
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.03
595 0.04
596 0.05
597 0.05
598 0.13
599 0.14
600 0.17
601 0.27
602 0.29
603 0.33
604 0.41
605 0.44
606 0.4
607 0.43
608 0.46
609 0.45
610 0.43
611 0.4
612 0.36
613 0.33
614 0.32
615 0.3
616 0.24
617 0.16
618 0.16
619 0.21
620 0.22
621 0.24
622 0.23
623 0.24
624 0.23
625 0.22
626 0.25
627 0.22
628 0.23
629 0.26
630 0.28
631 0.26
632 0.32
633 0.33
634 0.33
635 0.33
636 0.26
637 0.22
638 0.2
639 0.2
640 0.16
641 0.15
642 0.12
643 0.11
644 0.12
645 0.13
646 0.11
647 0.1
648 0.09
649 0.08
650 0.06
651 0.06
652 0.04
653 0.03
654 0.03
655 0.03
656 0.04
657 0.04
658 0.04
659 0.05
660 0.05
661 0.05
662 0.06
663 0.09
664 0.11
665 0.12
666 0.14
667 0.18
668 0.21
669 0.24
670 0.24
671 0.21
672 0.19
673 0.19
674 0.17
675 0.15
676 0.14
677 0.19
678 0.27
679 0.29
680 0.35
681 0.36
682 0.36
683 0.37
684 0.38
685 0.34
686 0.33
687 0.38
688 0.34
689 0.37
690 0.36
691 0.33
692 0.29
693 0.25
694 0.18
695 0.11
696 0.07
697 0.05
698 0.05
699 0.06
700 0.07
701 0.07
702 0.08
703 0.1
704 0.16
705 0.17
706 0.18
707 0.25
708 0.26
709 0.33
710 0.41
711 0.47
712 0.5
713 0.53
714 0.57
715 0.58
716 0.57
717 0.51
718 0.44
719 0.38
720 0.36
721 0.34
722 0.3
723 0.24
724 0.24
725 0.23
726 0.22
727 0.19
728 0.13
729 0.15
730 0.16
731 0.15
732 0.15
733 0.15
734 0.16
735 0.2
736 0.24
737 0.21
738 0.21
739 0.26
740 0.34
741 0.39
742 0.41
743 0.43
744 0.41
745 0.47
746 0.5
747 0.49
748 0.47
749 0.44
750 0.43
751 0.42
752 0.4
753 0.33
754 0.28
755 0.22
756 0.16
757 0.14
758 0.13
759 0.09
760 0.09
761 0.09
762 0.11
763 0.19
764 0.24
765 0.26
766 0.27
767 0.28
768 0.34
769 0.38
770 0.41
771 0.43
772 0.39
773 0.37
774 0.35
775 0.33
776 0.27
777 0.21
778 0.16
779 0.06
780 0.04
781 0.04
782 0.03
783 0.04
784 0.05
785 0.05
786 0.05
787 0.06
788 0.06
789 0.06
790 0.06
791 0.07
792 0.06
793 0.06
794 0.06
795 0.05
796 0.05
797 0.05
798 0.07
799 0.05
800 0.05
801 0.06
802 0.05
803 0.06
804 0.07
805 0.09
806 0.12
807 0.14
808 0.16
809 0.24
810 0.27
811 0.3
812 0.37
813 0.38
814 0.43
815 0.41
816 0.45
817 0.42
818 0.46
819 0.46
820 0.43
821 0.4
822 0.33
823 0.32
824 0.27
825 0.25
826 0.21
827 0.21
828 0.22
829 0.2
830 0.19
831 0.19
832 0.19
833 0.18
834 0.15
835 0.14
836 0.08
837 0.09
838 0.09
839 0.08
840 0.08
841 0.07
842 0.08
843 0.07
844 0.07
845 0.06
846 0.07
847 0.08
848 0.08
849 0.12
850 0.11
851 0.13
852 0.15
853 0.16
854 0.16
855 0.17
856 0.19
857 0.16
858 0.18
859 0.16
860 0.18
861 0.17
862 0.17
863 0.18
864 0.14
865 0.14
866 0.14
867 0.16
868 0.12
869 0.12
870 0.12
871 0.11
872 0.12
873 0.12
874 0.12
875 0.1
876 0.12
877 0.13
878 0.13
879 0.14
880 0.14
881 0.12
882 0.15
883 0.15
884 0.13
885 0.12
886 0.13
887 0.2
888 0.26
889 0.31
890 0.33
891 0.36
892 0.41
893 0.44
894 0.45
895 0.41
896 0.36
897 0.33
898 0.29
899 0.3
900 0.25
901 0.22
902 0.2
903 0.16
904 0.14
905 0.13
906 0.11
907 0.07
908 0.1
909 0.12
910 0.14
911 0.16
912 0.17
913 0.19
914 0.19
915 0.22
916 0.2
917 0.2
918 0.17
919 0.16
920 0.15
921 0.12
922 0.11
923 0.08
924 0.08
925 0.08
926 0.1
927 0.11
928 0.14
929 0.17
930 0.2
931 0.22
932 0.26
933 0.32
934 0.35
935 0.39
936 0.4
937 0.39
938 0.36
939 0.34
940 0.29
941 0.21
942 0.17
943 0.11
944 0.06
945 0.05
946 0.05
947 0.04
948 0.04
949 0.04
950 0.03
951 0.04
952 0.05
953 0.07
954 0.07
955 0.1
956 0.11
957 0.11
958 0.12
959 0.11
960 0.12
961 0.12
962 0.11
963 0.08
964 0.08
965 0.07
966 0.06
967 0.06
968 0.05
969 0.04
970 0.04
971 0.04
972 0.05
973 0.04
974 0.05
975 0.05
976 0.06
977 0.06
978 0.07
979 0.07
980 0.07
981 0.07
982 0.07
983 0.07
984 0.07
985 0.07
986 0.07
987 0.06
988 0.06
989 0.07
990 0.07
991 0.07
992 0.07
993 0.07
994 0.07
995 0.07
996 0.09
997 0.11
998 0.17
999 0.2
1000 0.25
1001 0.34
1002 0.36
1003 0.39
1004 0.44
1005 0.52
1006 0.52
1007 0.56
1008 0.56
1009 0.5
1010 0.52
1011 0.49
1012 0.44
1013 0.37
1014 0.3
1015 0.22
1016 0.17
1017 0.15
1018 0.11
1019 0.1
1020 0.08
1021 0.07
1022 0.07
1023 0.08
1024 0.09
1025 0.08
1026 0.08
1027 0.09
1028 0.09
1029 0.07
1030 0.07
1031 0.07
1032 0.07
1033 0.07
1034 0.06
1035 0.05
1036 0.05
1037 0.05
1038 0.05
1039 0.06
1040 0.07
1041 0.07
1042 0.07
1043 0.08
1044 0.08
1045 0.09
1046 0.09
1047 0.09
1048 0.1
1049 0.1
1050 0.11
1051 0.11
1052 0.11
1053 0.13
1054 0.16
1055 0.18
1056 0.17
1057 0.16
1058 0.17
1059 0.19
1060 0.2
1061 0.22
1062 0.27
1063 0.34
1064 0.37
1065 0.41
1066 0.4
1067 0.38
1068 0.38
1069 0.35
1070 0.31
1071 0.27
1072 0.25
1073 0.24
1074 0.24
1075 0.24
1076 0.23
1077 0.24
1078 0.18
1079 0.15
1080 0.12
1081 0.1
1082 0.1
1083 0.1
1084 0.1
1085 0.1
1086 0.12
1087 0.11
1088 0.11
1089 0.13
1090 0.18
1091 0.2
1092 0.22
1093 0.27
1094 0.28
1095 0.3
1096 0.32
1097 0.29
1098 0.27
1099 0.27
1100 0.26
1101 0.21
1102 0.18
1103 0.17
1104 0.19
1105 0.23
1106 0.22
1107 0.24
1108 0.26
1109 0.34
1110 0.39
1111 0.41
1112 0.4
1113 0.44
1114 0.48
1115 0.5
1116 0.49
1117 0.42
1118 0.39
1119 0.42
1120 0.44
1121 0.42
1122 0.37
1123 0.39
1124 0.42
1125 0.41
1126 0.44
1127 0.42
1128 0.38
1129 0.34
1130 0.32
1131 0.26
1132 0.22
1133 0.2
1134 0.15
1135 0.12
1136 0.13
1137 0.1
1138 0.11
1139 0.11
1140 0.1
1141 0.1
1142 0.11
1143 0.11
1144 0.1
1145 0.1
1146 0.1
1147 0.09
1148 0.09
1149 0.09
1150 0.1
1151 0.12
1152 0.2
1153 0.26
1154 0.35
1155 0.41
1156 0.5
1157 0.59
1158 0.66
1159 0.67
1160 0.65
1161 0.68
1162 0.71
1163 0.7
1164 0.67
1165 0.63
1166 0.56
1167 0.56
1168 0.5
1169 0.4
1170 0.3
1171 0.25
1172 0.2
1173 0.18
1174 0.2
1175 0.19
1176 0.23
1177 0.25
1178 0.32
1179 0.35
1180 0.36
1181 0.39
1182 0.46
1183 0.54
1184 0.59
1185 0.66
1186 0.69
1187 0.75
1188 0.81
1189 0.81
1190 0.78
1191 0.72
1192 0.62
1193 0.59
1194 0.52
1195 0.45
1196 0.39
1197 0.34
1198 0.28
1199 0.29
1200 0.28
1201 0.22
1202 0.2
1203 0.18
1204 0.19
1205 0.23
1206 0.25
1207 0.22
1208 0.25
1209 0.26
1210 0.28
1211 0.29
1212 0.33
1213 0.35
1214 0.42
1215 0.47
1216 0.47
1217 0.48
1218 0.53
1219 0.54
1220 0.53
1221 0.56
1222 0.51
1223 0.55