Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A061H357

Protein Details
Accession A0A061H357    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-126YWSAYRSDARRQRRETKKSRDATRRLFEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-118RQRRETKKSR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9, cyto 6.5, extr 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
IPR036167  tRNA_intron_Endo_cat-like_sf  
IPR006677  tRNA_intron_Endonuc_cat-like  
IPR016690  tRNA_splic_SEN34  
Gene Ontology GO:0000214  C:tRNA-intron endonuclease complex  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000213  F:tRNA-intron endonuclease activity  
GO:0000379  P:tRNA-type intron splice site recognition and cleavage  
KEGG pfp:PFL1_06220  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01974  tRNA_int_endo  
CDD cd22363  tRNA-intron_lyase_C  
Amino Acid Sequences MSTLQALRDEYPDRIPLHIHDDQVFVWHPSDVERLRRDHAICGLMTGTLPLIPQQNVFLGLPLQLCHEEVAWLLRHGVGMLIVDAPAHRRATSQEIQEYWSAYRSDARRQRRETKKSRDATRRLFEAKLGRSEPVDSPTTPSTAADDQEDHDDDDDDDEAELEKIPYQHLTLGSSSDLPWFAPSLSQPGATAFLTLSSARQAGVFTFPRTEMDVATLCVFETLHSQGFYLGVGLRFGGQFTVYPGDPLRYHAHYSAAVSARPTSSISGLEMVASGRLGTAVKKSHLICSVDSPLSPSPAAAAAAAAAAAAASTAAESGPGAGEGDEEAQTKARIDEAVKAGRFDSTRQPWGKVGFFSLSWAGFGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.27
4 0.33
5 0.34
6 0.33
7 0.29
8 0.29
9 0.28
10 0.29
11 0.28
12 0.22
13 0.19
14 0.16
15 0.15
16 0.15
17 0.23
18 0.24
19 0.3
20 0.34
21 0.36
22 0.4
23 0.46
24 0.46
25 0.42
26 0.43
27 0.38
28 0.33
29 0.31
30 0.28
31 0.21
32 0.19
33 0.15
34 0.1
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.11
39 0.12
40 0.13
41 0.14
42 0.14
43 0.16
44 0.16
45 0.15
46 0.12
47 0.13
48 0.13
49 0.12
50 0.13
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.13
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.08
73 0.11
74 0.12
75 0.11
76 0.12
77 0.15
78 0.23
79 0.28
80 0.3
81 0.31
82 0.31
83 0.33
84 0.33
85 0.32
86 0.24
87 0.23
88 0.18
89 0.15
90 0.2
91 0.2
92 0.29
93 0.36
94 0.46
95 0.52
96 0.59
97 0.69
98 0.74
99 0.83
100 0.83
101 0.85
102 0.85
103 0.84
104 0.87
105 0.86
106 0.84
107 0.83
108 0.77
109 0.72
110 0.66
111 0.58
112 0.52
113 0.49
114 0.43
115 0.39
116 0.35
117 0.3
118 0.27
119 0.29
120 0.26
121 0.23
122 0.22
123 0.17
124 0.2
125 0.2
126 0.2
127 0.18
128 0.16
129 0.16
130 0.14
131 0.15
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.14
136 0.15
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.07
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.14
196 0.15
197 0.15
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.06
208 0.07
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.07
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.13
233 0.13
234 0.16
235 0.19
236 0.19
237 0.22
238 0.21
239 0.23
240 0.21
241 0.22
242 0.24
243 0.21
244 0.19
245 0.18
246 0.18
247 0.16
248 0.16
249 0.16
250 0.12
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.11
256 0.1
257 0.1
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.05
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.11
267 0.13
268 0.15
269 0.21
270 0.22
271 0.26
272 0.31
273 0.33
274 0.29
275 0.32
276 0.36
277 0.31
278 0.3
279 0.3
280 0.25
281 0.25
282 0.23
283 0.18
284 0.13
285 0.14
286 0.14
287 0.1
288 0.09
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.03
294 0.02
295 0.02
296 0.02
297 0.02
298 0.02
299 0.02
300 0.02
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.1
315 0.11
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.12
320 0.14
321 0.14
322 0.21
323 0.26
324 0.33
325 0.33
326 0.34
327 0.33
328 0.35
329 0.35
330 0.31
331 0.35
332 0.34
333 0.43
334 0.45
335 0.48
336 0.49
337 0.53
338 0.53
339 0.44
340 0.41
341 0.35
342 0.31
343 0.32
344 0.3
345 0.25