Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A061H5J3

Protein Details
Accession A0A061H5J3    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
251-298SSSSSSSRHHHRRRHGDEDKDRERRRSSERRRHSSRSRSRPARNDDDDBasic
338-365NREAARPRRSRSRSRSRSPRPGSRDEADBasic
393-416DDDARERSRRRYGRDDGRRERERGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
223-292REEKMRRKEERARIRAERAARKAAKAGPSSSSSSSRHHHRRRHGDEDKDRERRRSSERRRHSSRSRSRPA
320-379RERSLREARSDARRGAEVNREAARPRRSRSRSRSRSPRPGSRDEADRRYRDGRDGRGGRD
398-416ERSRRRYGRDDGRRERERG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pfp:PFL1_04504  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16367  RRM_7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MNVVREIQRINQQELDIAINNPSASWHEQYKDSAYIFVGGLPYDLTEGDVVTIFSQYGEVVDVNLPRGNPQPPGQGSQRNDGQPGSQQQQQQGQQQQQQQQGKGKHRGFGFLMYEDQRSTVLAVDNLNGASILGRTIRVDHVAKYKHKGHRDDDGNYVEPEQPSMNAAPQLVDPGSGSGRGAGDGDGDGDDDLEDPMAAYFRRKRSEAKSRGGDDGDGDGDSREEKMRRKEERARIRAERAARKAAKAGPSSSSSSSRHHHRRRHGDEDKDRERRRSSERRRHSSRSRSRPARNDDDDGGSSDDDDAGGRNRYEEMKAARERSLREARSDARRGAEVNREAARPRRSRSRSRSRSPRPGSRDEADRRYRDGRDGRGGRDQGERGGSRHAVDDDDDARERSRRRYGRDDGRRERERG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.27
4 0.23
5 0.2
6 0.18
7 0.17
8 0.16
9 0.15
10 0.16
11 0.18
12 0.21
13 0.24
14 0.25
15 0.28
16 0.32
17 0.35
18 0.35
19 0.32
20 0.3
21 0.25
22 0.24
23 0.22
24 0.2
25 0.16
26 0.11
27 0.11
28 0.09
29 0.09
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.07
46 0.06
47 0.07
48 0.1
49 0.11
50 0.12
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.19
55 0.2
56 0.22
57 0.24
58 0.31
59 0.32
60 0.37
61 0.41
62 0.45
63 0.46
64 0.49
65 0.52
66 0.45
67 0.44
68 0.4
69 0.35
70 0.33
71 0.36
72 0.33
73 0.31
74 0.32
75 0.35
76 0.42
77 0.45
78 0.47
79 0.48
80 0.51
81 0.52
82 0.57
83 0.59
84 0.6
85 0.61
86 0.58
87 0.59
88 0.6
89 0.63
90 0.66
91 0.61
92 0.57
93 0.52
94 0.52
95 0.46
96 0.43
97 0.36
98 0.28
99 0.29
100 0.26
101 0.26
102 0.22
103 0.21
104 0.16
105 0.13
106 0.12
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.08
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.08
124 0.09
125 0.13
126 0.14
127 0.16
128 0.23
129 0.29
130 0.32
131 0.37
132 0.45
133 0.48
134 0.54
135 0.58
136 0.54
137 0.57
138 0.6
139 0.56
140 0.53
141 0.5
142 0.44
143 0.38
144 0.36
145 0.28
146 0.22
147 0.2
148 0.15
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.07
187 0.12
188 0.17
189 0.2
190 0.22
191 0.27
192 0.35
193 0.46
194 0.51
195 0.54
196 0.56
197 0.55
198 0.56
199 0.51
200 0.42
201 0.32
202 0.25
203 0.17
204 0.11
205 0.09
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.08
211 0.1
212 0.16
213 0.24
214 0.33
215 0.38
216 0.46
217 0.55
218 0.62
219 0.7
220 0.72
221 0.7
222 0.66
223 0.66
224 0.62
225 0.6
226 0.58
227 0.51
228 0.54
229 0.48
230 0.45
231 0.44
232 0.43
233 0.42
234 0.36
235 0.33
236 0.27
237 0.29
238 0.31
239 0.29
240 0.3
241 0.26
242 0.28
243 0.3
244 0.37
245 0.45
246 0.51
247 0.57
248 0.63
249 0.72
250 0.76
251 0.82
252 0.8
253 0.8
254 0.8
255 0.82
256 0.81
257 0.8
258 0.75
259 0.7
260 0.66
261 0.62
262 0.63
263 0.64
264 0.66
265 0.67
266 0.75
267 0.79
268 0.83
269 0.86
270 0.87
271 0.87
272 0.86
273 0.86
274 0.86
275 0.86
276 0.86
277 0.87
278 0.85
279 0.83
280 0.78
281 0.71
282 0.63
283 0.57
284 0.49
285 0.41
286 0.34
287 0.24
288 0.19
289 0.15
290 0.12
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.08
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.12
299 0.14
300 0.15
301 0.2
302 0.21
303 0.28
304 0.33
305 0.35
306 0.38
307 0.4
308 0.42
309 0.45
310 0.51
311 0.44
312 0.43
313 0.46
314 0.47
315 0.53
316 0.55
317 0.49
318 0.42
319 0.42
320 0.4
321 0.39
322 0.41
323 0.34
324 0.35
325 0.35
326 0.34
327 0.36
328 0.42
329 0.47
330 0.45
331 0.48
332 0.54
333 0.59
334 0.68
335 0.75
336 0.79
337 0.8
338 0.84
339 0.9
340 0.89
341 0.93
342 0.91
343 0.91
344 0.87
345 0.85
346 0.81
347 0.75
348 0.74
349 0.71
350 0.72
351 0.7
352 0.66
353 0.63
354 0.62
355 0.6
356 0.59
357 0.58
358 0.56
359 0.57
360 0.59
361 0.58
362 0.61
363 0.61
364 0.54
365 0.54
366 0.48
367 0.41
368 0.43
369 0.41
370 0.33
371 0.38
372 0.36
373 0.3
374 0.32
375 0.29
376 0.23
377 0.23
378 0.26
379 0.22
380 0.25
381 0.26
382 0.24
383 0.25
384 0.3
385 0.32
386 0.36
387 0.44
388 0.48
389 0.54
390 0.62
391 0.7
392 0.75
393 0.83
394 0.86
395 0.86
396 0.88