FuNGI

A0A061HBU1

Protein Details

Accession

A0A061HBU1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
145-169	RMAEKASKKERKRAAEKRKLKVEGR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
29-46	GGRGRGRGRGRGRGAGPR
144-175	PRMAEKASKKERKRAAEKRKLKVEGRLKKEAG

Subcellular Location(s)

mito 11, cyto_nucl 8.5, cyto 8, nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	pfp:PFL1_04388 -
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPQRRRPVEVQVKAEAPSDGLAAAASPAGGRGRGRGRGRGRGAGPRPMVEMTASGPFAMGPSAARPGSRSLRTAIGPGGSNLASSKPDPSHDSLSASDPARSAYRNPDKLKDAEQYSDPEEEGVEIIDIDQVHELDELAPRALPRMAEKASKKERKRAAEKRKLKVEGRLKKEAGGSSGSGGGGGGGGGDGEVVIKPDPEDDDGDVAMRGGDDDKARATTVSSGSGTPRPGATSASDDSDDDADDEGKNNADALDLSESEEEELMDDLVDDFVFDPSDDATLENRLYMFQFPQLFPKFTEAPDQGAPSDDEGGDGKKEEEGEAGGEGGSEPKSEGPQSILKKRTVAFAEGTAGGSGVAGTTPKLEGGVGGGGGAKVKREGKAGAGQDDDDDGAKIEGQAGRLDVYKDGRVFFRFGDLVMEVTGGSQPTFLQQLMLLDATRGQATTMGEIHRKFIVSPELDCMLSDFDAFDRQRRIENEQRRREEEARLEKERNRFGGIGLGGGAAGGGGGLGARRME

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.4
3	0.3
4	0.22
5	0.17
6	0.12
7	0.09
8	0.08
9	0.06
10	0.06
11	0.05
12	0.05
13	0.04
14	0.06
15	0.07
16	0.1
17	0.1
18	0.16
19	0.23
20	0.32
21	0.37
22	0.45
23	0.51
24	0.59
25	0.64
26	0.65
27	0.64
28	0.65
29	0.66
30	0.65
31	0.61
32	0.52
33	0.5
34	0.42
35	0.38
36	0.28
37	0.24
38	0.17
39	0.18
40	0.17
41	0.14
42	0.13
43	0.12
44	0.11
45	0.1
46	0.08
47	0.06
48	0.07
49	0.12
50	0.13
51	0.13
52	0.15
53	0.21
54	0.29
55	0.31
56	0.31
57	0.3
58	0.34
59	0.34
60	0.35
61	0.3
62	0.25
63	0.23
64	0.21
65	0.21
66	0.16
67	0.16
68	0.14
69	0.14
70	0.14
71	0.13
72	0.18
73	0.17
74	0.2
75	0.24
76	0.29
77	0.33
78	0.32
79	0.34
80	0.31
81	0.33
82	0.34
83	0.3
84	0.27
85	0.21
86	0.22
87	0.21
88	0.21
89	0.2
90	0.26
91	0.35
92	0.43
93	0.47
94	0.5
95	0.53
96	0.55
97	0.57
98	0.53
99	0.46
100	0.41
101	0.39
102	0.37
103	0.34
104	0.33
105	0.27
106	0.2
107	0.17
108	0.14
109	0.12
110	0.09
111	0.06
112	0.04
113	0.05
114	0.06
115	0.06
116	0.06
117	0.07
118	0.06
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.09
124	0.09
125	0.08
126	0.09
127	0.08
128	0.1
129	0.11
130	0.11
131	0.12
132	0.17
133	0.19
134	0.26
135	0.29
136	0.38
137	0.47
138	0.56
139	0.58
140	0.62
141	0.68
142	0.7
143	0.78
144	0.79
145	0.8
146	0.82
147	0.87
148	0.86
149	0.87
150	0.84
151	0.76
152	0.74
153	0.74
154	0.72
155	0.69
156	0.69
157	0.6
158	0.56
159	0.56
160	0.47
161	0.39
162	0.31
163	0.24
164	0.17
165	0.18
166	0.14
167	0.11
168	0.1
169	0.07
170	0.05
171	0.04
172	0.03
173	0.02
174	0.02
175	0.02
176	0.02
177	0.02
178	0.02
179	0.02
180	0.03
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.05
185	0.06
186	0.07
187	0.09
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.1
192	0.09
193	0.08
194	0.06
195	0.05
196	0.04
197	0.04
198	0.06
199	0.06
200	0.07
201	0.07
202	0.08
203	0.08
204	0.08
205	0.08
206	0.09
207	0.1
208	0.11
209	0.12
210	0.12
211	0.14
212	0.16
213	0.16
214	0.14
215	0.13
216	0.12
217	0.12
218	0.12
219	0.11
220	0.13
221	0.13
222	0.14
223	0.14
224	0.13
225	0.13
226	0.12
227	0.11
228	0.08
229	0.07
230	0.06
231	0.06
232	0.07
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.05
241	0.06
242	0.06
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.05
249	0.04
250	0.04
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.1
277	0.13
278	0.13
279	0.2
280	0.22
281	0.23
282	0.22
283	0.26
284	0.24
285	0.22
286	0.28
287	0.21
288	0.22
289	0.22
290	0.22
291	0.18
292	0.18
293	0.18
294	0.12
295	0.12
296	0.09
297	0.08
298	0.08
299	0.09
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.07
304	0.08
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.06
310	0.06
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.06
319	0.07
320	0.08
321	0.08
322	0.11
323	0.17
324	0.23
325	0.31
326	0.35
327	0.35
328	0.38
329	0.38
330	0.4
331	0.36
332	0.32
333	0.26
334	0.22
335	0.23
336	0.2
337	0.2
338	0.14
339	0.12
340	0.09
341	0.07
342	0.06
343	0.04
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.06
354	0.06
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.07
360	0.07
361	0.06
362	0.1
363	0.12
364	0.14
365	0.16
366	0.17
367	0.2
368	0.27
369	0.29
370	0.28
371	0.27
372	0.25
373	0.23
374	0.23
375	0.19
376	0.12
377	0.1
378	0.08
379	0.07
380	0.07
381	0.06
382	0.09
383	0.09
384	0.1
385	0.11
386	0.11
387	0.12
388	0.13
389	0.14
390	0.14
391	0.15
392	0.18
393	0.19
394	0.2
395	0.22
396	0.23
397	0.24
398	0.21
399	0.23
400	0.19
401	0.18
402	0.19
403	0.16
404	0.15
405	0.13
406	0.13
407	0.08
408	0.08
409	0.09
410	0.07
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.08
415	0.1
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.1
420	0.12
421	0.12
422	0.11
423	0.09
424	0.1
425	0.11
426	0.1
427	0.09
428	0.08
429	0.1
430	0.11
431	0.13
432	0.15
433	0.17
434	0.22
435	0.23
436	0.25
437	0.24
438	0.24
439	0.21
440	0.23
441	0.28
442	0.25
443	0.26
444	0.28
445	0.28
446	0.27
447	0.27
448	0.24
449	0.18
450	0.16
451	0.14
452	0.11
453	0.09
454	0.17
455	0.18
456	0.22
457	0.26
458	0.27
459	0.34
460	0.37
461	0.45
462	0.48
463	0.58
464	0.64
465	0.69
466	0.75
467	0.74
468	0.78
469	0.73
470	0.71
471	0.7
472	0.7
473	0.67
474	0.66
475	0.68
476	0.66
477	0.71
478	0.7
479	0.63
480	0.57
481	0.49
482	0.43
483	0.44
484	0.38
485	0.3
486	0.23
487	0.19
488	0.14
489	0.13
490	0.12
491	0.04
492	0.04
493	0.02
494	0.02
495	0.02
496	0.02
497	0.02

A0A061HBU1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer