Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A061H5L2

Protein Details
Accession A0A061H5L2    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-48PSSSQASTPRSKDKKHKSSKKHKSSKRSSSSAGAHydrophilic
383-432DDDDDRKGKKGSKRKSRKSLDGEDEAPVDQDGSAKSRDKKKRKRDREAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-41RSKDKKHKSSKKHKSSKR
388-400RKGKKGSKRKSRK
416-432AKSRDKKKRKRDREAKA
Subcellular Location(s) cyto 9, extr 6, nucl 5, cyto_pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG pfp:PFL1_04030  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MAVVAAAAAAAVAGPSSSQASTPRSKDKKHKSSKKHKSSKRSSSSAGAADDDAAAPPTDVVMDDAEAGVVDGGILESAFETLYPVLNLAIPPVWTPNPYAAFSDLMDTLVMRYVPQLSGVLITHRPLRFLADSAKFYADNASASAPVQFECVVWRPKIGHRLEGTITLSSPSHVSLLLYGTFNASIPASHLSKDSWEFVIDAEADLHVHGMGADRGLGHWRSKADGSRLGGDDGRLSFTVISMTVANHILSLHGSLLDDPFSVPAPTQDASYLAKSLSDANVLGFAAGKKGDRNAKKAAAAAAAGAAGGAAGSAEASMDSPKPQNRRVRWEDESDDEAPALASQQLDGEDTDGATSGASDDDDDEDRAAAVSITARRLDDDDDDDDDRKGKKGSKRKSRKSLDGEDEAPVDQDGSAKSRDKKKRKRDREAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.02
2 0.04
3 0.06
4 0.07
5 0.09
6 0.13
7 0.2
8 0.28
9 0.34
10 0.44
11 0.5
12 0.59
13 0.68
14 0.75
15 0.8
16 0.84
17 0.89
18 0.89
19 0.93
20 0.95
21 0.96
22 0.95
23 0.94
24 0.94
25 0.94
26 0.94
27 0.92
28 0.87
29 0.8
30 0.75
31 0.71
32 0.63
33 0.54
34 0.44
35 0.35
36 0.28
37 0.24
38 0.18
39 0.13
40 0.1
41 0.09
42 0.07
43 0.07
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.04
56 0.04
57 0.03
58 0.03
59 0.03
60 0.03
61 0.03
62 0.03
63 0.03
64 0.03
65 0.03
66 0.03
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.08
78 0.09
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.15
83 0.19
84 0.21
85 0.22
86 0.23
87 0.21
88 0.21
89 0.2
90 0.21
91 0.15
92 0.13
93 0.11
94 0.1
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.06
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.1
106 0.1
107 0.12
108 0.11
109 0.13
110 0.18
111 0.18
112 0.19
113 0.18
114 0.21
115 0.2
116 0.21
117 0.27
118 0.25
119 0.27
120 0.27
121 0.29
122 0.24
123 0.23
124 0.24
125 0.17
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.09
133 0.08
134 0.09
135 0.08
136 0.07
137 0.09
138 0.14
139 0.17
140 0.16
141 0.18
142 0.2
143 0.24
144 0.33
145 0.32
146 0.33
147 0.31
148 0.34
149 0.34
150 0.34
151 0.31
152 0.23
153 0.21
154 0.16
155 0.14
156 0.11
157 0.11
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.05
173 0.06
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.12
180 0.14
181 0.14
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.09
188 0.08
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.03
202 0.04
203 0.06
204 0.08
205 0.08
206 0.1
207 0.1
208 0.12
209 0.14
210 0.16
211 0.17
212 0.2
213 0.21
214 0.22
215 0.23
216 0.22
217 0.21
218 0.18
219 0.16
220 0.12
221 0.12
222 0.09
223 0.09
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.07
229 0.05
230 0.05
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.1
261 0.09
262 0.1
263 0.11
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.13
278 0.22
279 0.25
280 0.3
281 0.35
282 0.38
283 0.39
284 0.4
285 0.37
286 0.3
287 0.25
288 0.2
289 0.14
290 0.1
291 0.08
292 0.06
293 0.04
294 0.03
295 0.02
296 0.02
297 0.01
298 0.01
299 0.02
300 0.02
301 0.02
302 0.02
303 0.03
304 0.04
305 0.05
306 0.08
307 0.13
308 0.19
309 0.25
310 0.33
311 0.42
312 0.48
313 0.57
314 0.63
315 0.66
316 0.66
317 0.67
318 0.63
319 0.58
320 0.56
321 0.47
322 0.4
323 0.31
324 0.26
325 0.19
326 0.15
327 0.11
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.06
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.08
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.07
357 0.06
358 0.09
359 0.12
360 0.14
361 0.15
362 0.15
363 0.17
364 0.18
365 0.2
366 0.2
367 0.21
368 0.22
369 0.24
370 0.27
371 0.27
372 0.26
373 0.27
374 0.25
375 0.24
376 0.26
377 0.29
378 0.37
379 0.46
380 0.56
381 0.64
382 0.74
383 0.82
384 0.89
385 0.91
386 0.92
387 0.91
388 0.9
389 0.87
390 0.82
391 0.73
392 0.65
393 0.56
394 0.46
395 0.37
396 0.26
397 0.19
398 0.12
399 0.12
400 0.11
401 0.13
402 0.18
403 0.24
404 0.32
405 0.42
406 0.53
407 0.62
408 0.72
409 0.8
410 0.87
411 0.91
412 0.95