FuNGI

A0A061HER2

Protein Details

Accession

A0A061HER2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MPPKKTKAKSAFRSDKAQHF	Hydrophilic
720-752	EKKARKAAVKAAKQSRRTQKSQTKKVFAHERKL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
717-762	TKEEKKARKAAVKAAKQSRRTQKSQTKKVFAHERKLQARAESGRKA

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
KEGG	pfp:PFL1_03399 -
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKKTKAKSAFRSDKAQHFQVVHRSQRDPLINDPDAGQHVLKAVNAPNSKGKTRAQLEQDERILYGNDGKPLRTNVGEAALYGVYYDDTEYDYMQHLRPIRDSENSRRGGVDEQDDTEAILIAAAPKKAPRQKGDGFALKEGEDGAAPGPSSRPRGEPQLSLPASAFASKEERPFSYTSHLNVEPSLQGFQPDMDPHLRQALEALDDEAFVDGDLEDDFFADIAKGGEWDGEVDAQADAWRELPPEGDESIWMDPAQRAQQQLEDEGKESLSLEARVALFKKAQEMERALAAQQSGAKAKTRAGNAGSDDEAGDDGEDRDQLRSLPPASRAGTAYTAGGSVLGKKGKPGAMARRAASTRAGSVGGGSTAWSMTSSSMSRNKGLTDLDDRFDKVGRLYGIREDFDPSLDNLSAMGPDEFEDEDDDDDEGEGEEGEEVSREDFENIMDDFLDRYEVIAGRLKENLGAKDATGAEKLDLLRKALGAARIDGKDWEGRDKDVGKGTEESLGAYDDYDSGDDDDGQLDLDNHPALMPRSAQREKWDVETVLTTKTNLENHPRTISARESVVGTGRNSALPKKIANGGSGRPLGSGATLTSSYSQRPNAAAFLDDDERLPKIRVNPRTGFPEIVGYSKPRNSKTKAKAKAEADAEAGAGEAAAVAAAADDDVKADGPDSGDDTAGEQEGDDDDDDGFDSDATEGAGGHYGGGVTVARDRHETKEEKKARKAAVKAAKQSRRTQKSQTKKVFAHERKLQARAESGRKAAEGGPSGMRLV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.8
3	0.76
4	0.7
5	0.65
6	0.57
7	0.58
8	0.59
9	0.61
10	0.59
11	0.58
12	0.56
13	0.54
14	0.59
15	0.6
16	0.53
17	0.52
18	0.53
19	0.48
20	0.46
21	0.44
22	0.38
23	0.34
24	0.33
25	0.25
26	0.16
27	0.17
28	0.17
29	0.17
30	0.18
31	0.2
32	0.26
33	0.28
34	0.31
35	0.37
36	0.41
37	0.44
38	0.45
39	0.45
40	0.46
41	0.49
42	0.54
43	0.53
44	0.58
45	0.61
46	0.63
47	0.62
48	0.53
49	0.48
50	0.41
51	0.35
52	0.26
53	0.28
54	0.23
55	0.27
56	0.27
57	0.27
58	0.3
59	0.32
60	0.35
61	0.28
62	0.28
63	0.23
64	0.26
65	0.25
66	0.21
67	0.21
68	0.16
69	0.15
70	0.13
71	0.11
72	0.07
73	0.07
74	0.07
75	0.05
76	0.07
77	0.08
78	0.08
79	0.09
80	0.12
81	0.15
82	0.15
83	0.2
84	0.23
85	0.25
86	0.28
87	0.33
88	0.33
89	0.39
90	0.45
91	0.51
92	0.55
93	0.55
94	0.53
95	0.48
96	0.46
97	0.42
98	0.39
99	0.34
100	0.27
101	0.26
102	0.27
103	0.26
104	0.24
105	0.19
106	0.15
107	0.1
108	0.07
109	0.05
110	0.07
111	0.1
112	0.11
113	0.11
114	0.14
115	0.23
116	0.3
117	0.37
118	0.39
119	0.45
120	0.5
121	0.58
122	0.63
123	0.62
124	0.59
125	0.54
126	0.5
127	0.42
128	0.36
129	0.28
130	0.2
131	0.12
132	0.1
133	0.08
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.09
138	0.12
139	0.17
140	0.18
141	0.22
142	0.24
143	0.33
144	0.37
145	0.37
146	0.38
147	0.44
148	0.43
149	0.39
150	0.37
151	0.29
152	0.26
153	0.24
154	0.2
155	0.11
156	0.16
157	0.17
158	0.2
159	0.22
160	0.22
161	0.25
162	0.26
163	0.26
164	0.28
165	0.29
166	0.27
167	0.3
168	0.3
169	0.27
170	0.26
171	0.25
172	0.2
173	0.19
174	0.18
175	0.12
176	0.12
177	0.11
178	0.12
179	0.13
180	0.12
181	0.14
182	0.16
183	0.16
184	0.16
185	0.21
186	0.2
187	0.18
188	0.18
189	0.16
190	0.14
191	0.14
192	0.14
193	0.09
194	0.09
195	0.1
196	0.08
197	0.07
198	0.05
199	0.05
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.06
218	0.06
219	0.05
220	0.05
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.07
228	0.07
229	0.08
230	0.08
231	0.09
232	0.09
233	0.11
234	0.11
235	0.1
236	0.1
237	0.12
238	0.12
239	0.11
240	0.1
241	0.09
242	0.09
243	0.11
244	0.15
245	0.15
246	0.16
247	0.16
248	0.2
249	0.2
250	0.23
251	0.23
252	0.2
253	0.19
254	0.18
255	0.17
256	0.14
257	0.13
258	0.11
259	0.09
260	0.08
261	0.07
262	0.09
263	0.09
264	0.11
265	0.12
266	0.12
267	0.12
268	0.12
269	0.17
270	0.17
271	0.19
272	0.21
273	0.22
274	0.22
275	0.22
276	0.22
277	0.18
278	0.16
279	0.14
280	0.11
281	0.1
282	0.1
283	0.11
284	0.11
285	0.13
286	0.13
287	0.16
288	0.2
289	0.2
290	0.22
291	0.22
292	0.23
293	0.23
294	0.24
295	0.21
296	0.17
297	0.15
298	0.12
299	0.11
300	0.08
301	0.06
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.1
312	0.11
313	0.13
314	0.15
315	0.19
316	0.2
317	0.21
318	0.2
319	0.19
320	0.19
321	0.17
322	0.15
323	0.11
324	0.09
325	0.07
326	0.07
327	0.06
328	0.05
329	0.08
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.12
334	0.13
335	0.16
336	0.21
337	0.27
338	0.33
339	0.36
340	0.36
341	0.38
342	0.38
343	0.35
344	0.32
345	0.24
346	0.17
347	0.15
348	0.14
349	0.1
350	0.09
351	0.08
352	0.06
353	0.05
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.06
362	0.06
363	0.1
364	0.16
365	0.17
366	0.19
367	0.19
368	0.19
369	0.19
370	0.19
371	0.17
372	0.17
373	0.18
374	0.17
375	0.17
376	0.17
377	0.16
378	0.17
379	0.15
380	0.09
381	0.11
382	0.1
383	0.11
384	0.11
385	0.15
386	0.16
387	0.16
388	0.16
389	0.15
390	0.15
391	0.14
392	0.14
393	0.11
394	0.11
395	0.1
396	0.1
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.04
403	0.04
404	0.06
405	0.05
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.07
411	0.06
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.04
416	0.04
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.03
422	0.03
423	0.03
424	0.03
425	0.04
426	0.04
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.07
438	0.05
439	0.05
440	0.06
441	0.06
442	0.08
443	0.12
444	0.13
445	0.13
446	0.14
447	0.14
448	0.15
449	0.17
450	0.17
451	0.15
452	0.14
453	0.13
454	0.15
455	0.16
456	0.14
457	0.12
458	0.12
459	0.09
460	0.11
461	0.12
462	0.13
463	0.14
464	0.14
465	0.13
466	0.13
467	0.14
468	0.14
469	0.17
470	0.13
471	0.14
472	0.17
473	0.17
474	0.18
475	0.17
476	0.16
477	0.16
478	0.16
479	0.2
480	0.17
481	0.18
482	0.21
483	0.22
484	0.24
485	0.26
486	0.26
487	0.23
488	0.23
489	0.23
490	0.22
491	0.21
492	0.18
493	0.13
494	0.13
495	0.11
496	0.09
497	0.09
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.05
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.07
513	0.07
514	0.06
515	0.06
516	0.08
517	0.08
518	0.09
519	0.11
520	0.13
521	0.22
522	0.25
523	0.27
524	0.3
525	0.35
526	0.35
527	0.38
528	0.38
529	0.3
530	0.29
531	0.3
532	0.26
533	0.24
534	0.22
535	0.18
536	0.16
537	0.18
538	0.21
539	0.21
540	0.29
541	0.3
542	0.33
543	0.35
544	0.35
545	0.34
546	0.34
547	0.33
548	0.26
549	0.23
550	0.2
551	0.19
552	0.18
553	0.19
554	0.18
555	0.16
556	0.16
557	0.16
558	0.18
559	0.18
560	0.2
561	0.21
562	0.21
563	0.22
564	0.22
565	0.28
566	0.27
567	0.29
568	0.3
569	0.28
570	0.31
571	0.31
572	0.29
573	0.22
574	0.21
575	0.18
576	0.15
577	0.13
578	0.07
579	0.08
580	0.08
581	0.09
582	0.11
583	0.13
584	0.15
585	0.18
586	0.2
587	0.19
588	0.21
589	0.21
590	0.21
591	0.2
592	0.18
593	0.16
594	0.17
595	0.17
596	0.16
597	0.15
598	0.15
599	0.15
600	0.16
601	0.15
602	0.15
603	0.22
604	0.31
605	0.39
606	0.45
607	0.49
608	0.51
609	0.58
610	0.57
611	0.49
612	0.41
613	0.39
614	0.32
615	0.3
616	0.28
617	0.24
618	0.26
619	0.3
620	0.36
621	0.35
622	0.42
623	0.46
624	0.55
625	0.62
626	0.68
627	0.73
628	0.75
629	0.77
630	0.72
631	0.73
632	0.65
633	0.57
634	0.48
635	0.38
636	0.3
637	0.21
638	0.19
639	0.1
640	0.07
641	0.05
642	0.03
643	0.02
644	0.02
645	0.02
646	0.02
647	0.02
648	0.02
649	0.02
650	0.03
651	0.03
652	0.03
653	0.04
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.06
658	0.07
659	0.08
660	0.1
661	0.1
662	0.1
663	0.1
664	0.11
665	0.12
666	0.11
667	0.1
668	0.07
669	0.07
670	0.08
671	0.09
672	0.08
673	0.08
674	0.07
675	0.08
676	0.08
677	0.08
678	0.08
679	0.06
680	0.07
681	0.06
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.05
686	0.06
687	0.07
688	0.07
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.06
693	0.07
694	0.06
695	0.06
696	0.1
697	0.11
698	0.13
699	0.18
700	0.21
701	0.26
702	0.34
703	0.4
704	0.42
705	0.52
706	0.6
707	0.65
708	0.71
709	0.74
710	0.74
711	0.76
712	0.75
713	0.74
714	0.75
715	0.75
716	0.76
717	0.78
718	0.79
719	0.76
720	0.81
721	0.82
722	0.8
723	0.78
724	0.79
725	0.79
726	0.81
727	0.86
728	0.86
729	0.85
730	0.8
731	0.83
732	0.83
733	0.81
734	0.8
735	0.78
736	0.77
737	0.74
738	0.76
739	0.7
740	0.62
741	0.62
742	0.6
743	0.6
744	0.55
745	0.52
746	0.49
747	0.45
748	0.44
749	0.38
750	0.36
751	0.31
752	0.28
753	0.28

A0A061HER2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer