Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A061H8H6

Protein Details
Accession A0A061H8H6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
541-560AEAEAKRKHKENKRARQEANBasic
873-894TRAPAQHQQRPQQQQQHQQQAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
546-574KRKHKENKRARQEANGTDRGNKRQKGSGK
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 9.5, nucl 6, mito 5, extr 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
Gene Ontology GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG pfp:PFL1_05526  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MSIMGSEQSRPRTEAQAKAVPAAATVDAEVAADAVGDVKATADESVDRAADHQPLPPNDNPEVVSVSVKEATSTKPVETMAPARTIPDEAKVKTERADADTAPSSLAATPPESAAETELDSSELKTDDAAAVPSNLEIKTEGDNAAIAAEAKLTAEEATQPPAATPTKAQEDAETAGALSTKEEGQEKEDRDDFVPGDMEHIVATGASESAGQSMESLRDAVRKAREAAGTPREALPPGFEDDMEGQASGEEASIAKDEDNEEPAEDLKDAVRKAMQASGMSATGDNGDDAASSNSTSDSDDEDGGSSSSDDSDSEDSDEEDAGEVDAALGVGADDYDDDDDEAGAGGAGEAPKTKNEVVAPDVELPAIQTLSPGDLAMVRPLGQVHSIVDSVVVVAQDVTKKEGEAGNAAGSASAGAGYKGKQAVRGAPIDSTGRRGEADEGEYSVLDTGSLLCFEDGKVLGLVFETFGSVHAPLYSIRYPSAAAIDRDVVQVGRVVCYLPNASTYVLTRVLKAMKGSDASNIYDEEVGEDEVEFSDDEAEAEAKRKHKENKRARQEANGTDRGNKRQKGSGKHPQHQNPQQGQQQQQHQQQLRHGGHPRPSLPARPMAAALPARPNFDIDAPPSRSGTGGGIGGRTILSYDDAGAGGDAGVVAMAPRSSGAAAGAAVLGRPPQLAGLPPVPRGMGGGGGGGSGAGPAAIKDKGRGIAGLPPKPASLPQSPHSSAATSPALPQGSSAFNATPPMGASSGRFNSPPGSAGSPLPPVIGPPQHYPRSFGGQHAVSPPVGGGHPQQLPPPPTDSAGGHYNPHFAGYWAQHQQQQQPPAYWGQPVAAPGPSYGGYPGQMYPPAHYAGQQYPPHVAPSATAMASGPTRAPAQHQQRPQQQQQHQQQAEGPPTQYGGYGMGYGSAGYPAGAAAGGGYPGYNPAAAAYGGSGYGYPGGTGRPDANAAYPSAYPTSGGVPDAGEGGSSGSYDPKRPSYPGQASPASGYPPPPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.52
3 0.54
4 0.52
5 0.51
6 0.51
7 0.4
8 0.34
9 0.28
10 0.21
11 0.14
12 0.13
13 0.12
14 0.09
15 0.09
16 0.08
17 0.06
18 0.05
19 0.04
20 0.04
21 0.04
22 0.04
23 0.04
24 0.04
25 0.05
26 0.05
27 0.06
28 0.06
29 0.07
30 0.08
31 0.09
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.13
36 0.16
37 0.2
38 0.2
39 0.23
40 0.29
41 0.32
42 0.38
43 0.4
44 0.43
45 0.4
46 0.41
47 0.37
48 0.32
49 0.31
50 0.26
51 0.24
52 0.19
53 0.2
54 0.2
55 0.19
56 0.18
57 0.17
58 0.19
59 0.24
60 0.25
61 0.23
62 0.23
63 0.24
64 0.24
65 0.27
66 0.29
67 0.26
68 0.27
69 0.27
70 0.26
71 0.27
72 0.27
73 0.23
74 0.26
75 0.29
76 0.27
77 0.34
78 0.35
79 0.36
80 0.36
81 0.4
82 0.35
83 0.33
84 0.36
85 0.29
86 0.32
87 0.33
88 0.3
89 0.26
90 0.22
91 0.19
92 0.15
93 0.16
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.11
109 0.12
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.12
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.14
127 0.16
128 0.16
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.12
133 0.1
134 0.08
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.09
144 0.1
145 0.14
146 0.15
147 0.15
148 0.15
149 0.19
150 0.2
151 0.18
152 0.19
153 0.2
154 0.26
155 0.28
156 0.28
157 0.25
158 0.27
159 0.27
160 0.26
161 0.2
162 0.14
163 0.12
164 0.13
165 0.11
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.09
170 0.12
171 0.13
172 0.17
173 0.24
174 0.27
175 0.31
176 0.32
177 0.33
178 0.31
179 0.33
180 0.28
181 0.23
182 0.22
183 0.16
184 0.16
185 0.14
186 0.13
187 0.1
188 0.09
189 0.08
190 0.06
191 0.06
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.12
207 0.14
208 0.19
209 0.23
210 0.25
211 0.27
212 0.31
213 0.33
214 0.33
215 0.39
216 0.4
217 0.37
218 0.35
219 0.35
220 0.31
221 0.3
222 0.26
223 0.2
224 0.16
225 0.17
226 0.16
227 0.14
228 0.15
229 0.15
230 0.17
231 0.15
232 0.13
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.07
237 0.06
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.09
246 0.1
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.13
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.14
261 0.15
262 0.18
263 0.18
264 0.14
265 0.16
266 0.16
267 0.15
268 0.14
269 0.13
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.07
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.09
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.07
300 0.08
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.04
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.02
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.02
322 0.02
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.03
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.09
342 0.1
343 0.11
344 0.12
345 0.14
346 0.15
347 0.17
348 0.18
349 0.17
350 0.17
351 0.14
352 0.13
353 0.11
354 0.09
355 0.07
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.04
363 0.05
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.05
382 0.03
383 0.04
384 0.05
385 0.06
386 0.07
387 0.09
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.12
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.08
399 0.06
400 0.05
401 0.04
402 0.04
403 0.03
404 0.03
405 0.04
406 0.05
407 0.07
408 0.1
409 0.1
410 0.13
411 0.14
412 0.18
413 0.2
414 0.22
415 0.2
416 0.18
417 0.19
418 0.18
419 0.17
420 0.17
421 0.14
422 0.13
423 0.13
424 0.13
425 0.14
426 0.13
427 0.14
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.1
432 0.1
433 0.08
434 0.06
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.03
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.06
445 0.05
446 0.06
447 0.06
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.03
456 0.04
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.09
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.14
471 0.12
472 0.11
473 0.11
474 0.12
475 0.12
476 0.12
477 0.12
478 0.09
479 0.06
480 0.09
481 0.08
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.08
487 0.08
488 0.06
489 0.07
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.09
494 0.1
495 0.13
496 0.13
497 0.12
498 0.14
499 0.15
500 0.15
501 0.15
502 0.13
503 0.11
504 0.12
505 0.12
506 0.13
507 0.13
508 0.13
509 0.13
510 0.13
511 0.12
512 0.11
513 0.1
514 0.08
515 0.07
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.04
521 0.05
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.05
529 0.04
530 0.08
531 0.11
532 0.14
533 0.16
534 0.23
535 0.32
536 0.4
537 0.51
538 0.59
539 0.68
540 0.75
541 0.82
542 0.77
543 0.76
544 0.73
545 0.69
546 0.65
547 0.61
548 0.51
549 0.48
550 0.5
551 0.5
552 0.52
553 0.47
554 0.42
555 0.43
556 0.48
557 0.49
558 0.55
559 0.58
560 0.59
561 0.64
562 0.71
563 0.72
564 0.75
565 0.75
566 0.75
567 0.69
568 0.66
569 0.65
570 0.61
571 0.6
572 0.55
573 0.55
574 0.54
575 0.55
576 0.56
577 0.54
578 0.51
579 0.49
580 0.53
581 0.47
582 0.45
583 0.46
584 0.42
585 0.44
586 0.46
587 0.44
588 0.4
589 0.4
590 0.38
591 0.34
592 0.35
593 0.3
594 0.26
595 0.26
596 0.2
597 0.22
598 0.19
599 0.19
600 0.2
601 0.2
602 0.21
603 0.21
604 0.21
605 0.18
606 0.19
607 0.19
608 0.15
609 0.21
610 0.23
611 0.23
612 0.23
613 0.22
614 0.21
615 0.2
616 0.18
617 0.11
618 0.1
619 0.09
620 0.09
621 0.08
622 0.08
623 0.07
624 0.06
625 0.05
626 0.04
627 0.05
628 0.05
629 0.05
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.05
634 0.05
635 0.04
636 0.03
637 0.03
638 0.02
639 0.02
640 0.02
641 0.02
642 0.02
643 0.02
644 0.02
645 0.03
646 0.03
647 0.03
648 0.04
649 0.04
650 0.04
651 0.04
652 0.04
653 0.05
654 0.04
655 0.04
656 0.04
657 0.04
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.05
663 0.06
664 0.09
665 0.14
666 0.16
667 0.17
668 0.18
669 0.17
670 0.16
671 0.16
672 0.13
673 0.09
674 0.07
675 0.06
676 0.06
677 0.05
678 0.05
679 0.04
680 0.04
681 0.03
682 0.02
683 0.02
684 0.02
685 0.02
686 0.05
687 0.07
688 0.07
689 0.09
690 0.11
691 0.13
692 0.14
693 0.14
694 0.13
695 0.19
696 0.26
697 0.28
698 0.28
699 0.27
700 0.26
701 0.27
702 0.27
703 0.26
704 0.25
705 0.26
706 0.28
707 0.35
708 0.36
709 0.38
710 0.37
711 0.32
712 0.26
713 0.26
714 0.25
715 0.17
716 0.17
717 0.19
718 0.18
719 0.17
720 0.17
721 0.14
722 0.14
723 0.14
724 0.15
725 0.11
726 0.11
727 0.13
728 0.13
729 0.11
730 0.1
731 0.11
732 0.1
733 0.1
734 0.1
735 0.15
736 0.17
737 0.18
738 0.18
739 0.17
740 0.19
741 0.19
742 0.2
743 0.16
744 0.17
745 0.17
746 0.18
747 0.2
748 0.19
749 0.19
750 0.18
751 0.15
752 0.13
753 0.16
754 0.19
755 0.2
756 0.24
757 0.32
758 0.38
759 0.39
760 0.42
761 0.41
762 0.45
763 0.42
764 0.38
765 0.36
766 0.31
767 0.32
768 0.3
769 0.29
770 0.21
771 0.2
772 0.18
773 0.13
774 0.12
775 0.11
776 0.11
777 0.15
778 0.18
779 0.19
780 0.22
781 0.27
782 0.29
783 0.29
784 0.31
785 0.27
786 0.26
787 0.27
788 0.25
789 0.23
790 0.26
791 0.25
792 0.24
793 0.23
794 0.24
795 0.22
796 0.22
797 0.19
798 0.14
799 0.18
800 0.18
801 0.24
802 0.27
803 0.3
804 0.33
805 0.36
806 0.44
807 0.45
808 0.5
809 0.46
810 0.43
811 0.43
812 0.42
813 0.4
814 0.33
815 0.27
816 0.21
817 0.19
818 0.18
819 0.18
820 0.15
821 0.14
822 0.13
823 0.15
824 0.14
825 0.13
826 0.13
827 0.12
828 0.11
829 0.13
830 0.13
831 0.14
832 0.18
833 0.18
834 0.19
835 0.21
836 0.23
837 0.21
838 0.22
839 0.24
840 0.25
841 0.33
842 0.33
843 0.32
844 0.33
845 0.34
846 0.34
847 0.3
848 0.25
849 0.17
850 0.19
851 0.21
852 0.17
853 0.16
854 0.14
855 0.15
856 0.15
857 0.16
858 0.11
859 0.1
860 0.12
861 0.12
862 0.18
863 0.26
864 0.35
865 0.43
866 0.51
867 0.58
868 0.67
869 0.76
870 0.79
871 0.8
872 0.78
873 0.81
874 0.83
875 0.84
876 0.75
877 0.68
878 0.64
879 0.59
880 0.56
881 0.49
882 0.39
883 0.29
884 0.29
885 0.27
886 0.22
887 0.17
888 0.13
889 0.11
890 0.11
891 0.1
892 0.09
893 0.09
894 0.09
895 0.08
896 0.07
897 0.06
898 0.05
899 0.05
900 0.04
901 0.05
902 0.04
903 0.04
904 0.04
905 0.04
906 0.04
907 0.04
908 0.04
909 0.04
910 0.06
911 0.07
912 0.07
913 0.06
914 0.07
915 0.08
916 0.08
917 0.08
918 0.07
919 0.07
920 0.07
921 0.07
922 0.07
923 0.06
924 0.07
925 0.07
926 0.07
927 0.07
928 0.08
929 0.1
930 0.12
931 0.13
932 0.13
933 0.15
934 0.16
935 0.18
936 0.19
937 0.18
938 0.19
939 0.18
940 0.18
941 0.18
942 0.17
943 0.15
944 0.15
945 0.17
946 0.16
947 0.16
948 0.14
949 0.13
950 0.13
951 0.13
952 0.12
953 0.08
954 0.07
955 0.08
956 0.07
957 0.07
958 0.07
959 0.13
960 0.15
961 0.2
962 0.25
963 0.31
964 0.35
965 0.39
966 0.46
967 0.5
968 0.56
969 0.59
970 0.61
971 0.58
972 0.56
973 0.54
974 0.49
975 0.42
976 0.35