Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A061H691

Protein Details
Accession A0A061H691    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-30APSSYRDSRARENRQEQQRALHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 13, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027157  NCBP2  
IPR034148  NCBP2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG pfp:PFL1_04311  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12240  RRM_NCBP2  
Amino Acid Sequences MSHVLEPLDAPSSYRDSRARENRQEQQRALQSTATLYLGNLSFYTTEEQIYELFSRVANLGSGGGIKRIIMGLDRNTKTPCGFAFVEFYTHAEAVDCMRYISGTKLDERVIRCDLDPGYKDGRQYGRGKSGGQVRDEYRQEYDAGRGGWGHNRLREEEERKRIEAEEKERTRREAREDLYRETEAGASGGGGGLVPEGAEGQYDETEGRSRGLDGAASTEADGGGGGDEAAATQQGAKRARSQDDEDLEQSHKNPRFRGEERDEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.32
4 0.43
5 0.53
6 0.6
7 0.65
8 0.72
9 0.76
10 0.82
11 0.84
12 0.76
13 0.75
14 0.72
15 0.66
16 0.59
17 0.5
18 0.4
19 0.34
20 0.33
21 0.25
22 0.17
23 0.12
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.09
30 0.1
31 0.13
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.12
36 0.11
37 0.13
38 0.13
39 0.11
40 0.11
41 0.1
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.11
59 0.16
60 0.25
61 0.26
62 0.28
63 0.3
64 0.31
65 0.3
66 0.28
67 0.23
68 0.19
69 0.19
70 0.17
71 0.19
72 0.18
73 0.2
74 0.18
75 0.18
76 0.14
77 0.14
78 0.13
79 0.09
80 0.09
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.09
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.14
93 0.16
94 0.2
95 0.21
96 0.23
97 0.21
98 0.21
99 0.2
100 0.2
101 0.19
102 0.19
103 0.19
104 0.18
105 0.2
106 0.21
107 0.21
108 0.23
109 0.24
110 0.26
111 0.29
112 0.29
113 0.31
114 0.31
115 0.31
116 0.31
117 0.36
118 0.33
119 0.31
120 0.3
121 0.26
122 0.31
123 0.31
124 0.29
125 0.23
126 0.21
127 0.2
128 0.18
129 0.17
130 0.13
131 0.12
132 0.11
133 0.1
134 0.1
135 0.13
136 0.18
137 0.19
138 0.19
139 0.21
140 0.22
141 0.27
142 0.32
143 0.36
144 0.39
145 0.46
146 0.46
147 0.45
148 0.45
149 0.41
150 0.41
151 0.4
152 0.39
153 0.41
154 0.43
155 0.49
156 0.5
157 0.53
158 0.52
159 0.48
160 0.49
161 0.46
162 0.44
163 0.47
164 0.5
165 0.49
166 0.49
167 0.45
168 0.38
169 0.31
170 0.28
171 0.18
172 0.14
173 0.1
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.02
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.1
194 0.1
195 0.11
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.12
200 0.11
201 0.09
202 0.12
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.06
221 0.08
222 0.15
223 0.19
224 0.21
225 0.29
226 0.35
227 0.41
228 0.44
229 0.48
230 0.5
231 0.52
232 0.55
233 0.49
234 0.46
235 0.42
236 0.38
237 0.34
238 0.35
239 0.36
240 0.37
241 0.38
242 0.43
243 0.5
244 0.52
245 0.61
246 0.6