Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A061H2A5

Protein Details
Accession A0A061H2A5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-124TSQFVPPLKLNRKNPPRPKLPRPKPGDPVTDKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
103-117NRKNPPRPKLPRPKP
176-186RPPKGKLFQKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG pfp:PFL1_06594  -  
Amino Acid Sequences MPPVKSEPGAAGGVKSEHSNGVASGSHRNRNGTSNAVAAAATATARKQEAKRDLPPPPPTTYRDIPLFSTDAGPWLTHLMKFAHHTRVDPADTSQFVPPLKLNRKNPPRPKLPRPKPGDPVTDKYGRPMLAKDGQPLTWPAPGEDLARIEEVIRKEDKPKAPGADQSLIAPGSAARPPKGKLFQKKVKEVHKAADSTRRTMKQEYFPWVLEDFETSEEWESTRNPVPTGAKALEGWIDELKAKGQLQQPGSSEARDGDVSMASAGPSSAVKDEGEAAKASAAGPSSSSASASSHAPWIGKLEGDSDENATSHHVLFVFDERDAGGFKVVPVTRMYKFLQKPKHSTMSNEEVEAEYQKYQKTKEMDRWAMRKARGDGGPTSASAVKSEGGGSGGGWGDWPGVGRLALPSGGSSSGGGRRRNLMAVHGGALLNDDDDEGGGSRRRKREDDGGTYGELDYEEEFADDEEKMDEGDPYAEDEETRELEERLKREMARANKIGDDAADSDVEGEGSAAEDDNKMLTGSGEQMRKLVRALARKDGNEVYDRDEEERNPYASDDSDDDDDETYVANPEKALQIAREEREKREREAAKNNKLAKSGTATATPGTPSGSQTPTGRAEKRPQAAAGPRVPANAVEAEIIQLVREGKIANTSELVHHFRKRLKTEPQIKELLSAAVRKVAVMDKATNKLKLKDGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.15
4 0.14
5 0.15
6 0.15
7 0.13
8 0.15
9 0.17
10 0.17
11 0.26
12 0.31
13 0.37
14 0.39
15 0.43
16 0.43
17 0.46
18 0.48
19 0.43
20 0.39
21 0.34
22 0.32
23 0.28
24 0.25
25 0.19
26 0.16
27 0.11
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.1
32 0.12
33 0.18
34 0.22
35 0.31
36 0.41
37 0.48
38 0.55
39 0.6
40 0.66
41 0.69
42 0.74
43 0.68
44 0.65
45 0.63
46 0.59
47 0.59
48 0.55
49 0.52
50 0.48
51 0.46
52 0.42
53 0.4
54 0.37
55 0.3
56 0.29
57 0.23
58 0.21
59 0.19
60 0.17
61 0.14
62 0.17
63 0.17
64 0.15
65 0.18
66 0.16
67 0.18
68 0.24
69 0.28
70 0.32
71 0.32
72 0.33
73 0.36
74 0.4
75 0.4
76 0.36
77 0.34
78 0.31
79 0.31
80 0.32
81 0.29
82 0.26
83 0.24
84 0.25
85 0.25
86 0.3
87 0.38
88 0.45
89 0.51
90 0.59
91 0.69
92 0.78
93 0.85
94 0.85
95 0.86
96 0.87
97 0.9
98 0.91
99 0.9
100 0.89
101 0.88
102 0.87
103 0.85
104 0.82
105 0.81
106 0.76
107 0.72
108 0.68
109 0.66
110 0.57
111 0.53
112 0.5
113 0.41
114 0.37
115 0.32
116 0.33
117 0.33
118 0.35
119 0.36
120 0.34
121 0.32
122 0.32
123 0.33
124 0.29
125 0.24
126 0.23
127 0.18
128 0.18
129 0.19
130 0.18
131 0.17
132 0.16
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.13
137 0.16
138 0.16
139 0.18
140 0.2
141 0.2
142 0.25
143 0.34
144 0.39
145 0.38
146 0.42
147 0.43
148 0.43
149 0.46
150 0.48
151 0.42
152 0.37
153 0.34
154 0.3
155 0.25
156 0.22
157 0.17
158 0.11
159 0.1
160 0.12
161 0.14
162 0.14
163 0.17
164 0.19
165 0.26
166 0.35
167 0.42
168 0.49
169 0.58
170 0.65
171 0.71
172 0.79
173 0.79
174 0.79
175 0.8
176 0.72
177 0.68
178 0.65
179 0.59
180 0.53
181 0.54
182 0.48
183 0.43
184 0.48
185 0.45
186 0.43
187 0.45
188 0.48
189 0.47
190 0.5
191 0.52
192 0.48
193 0.45
194 0.43
195 0.38
196 0.33
197 0.25
198 0.2
199 0.14
200 0.12
201 0.12
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.13
209 0.17
210 0.17
211 0.17
212 0.2
213 0.23
214 0.23
215 0.27
216 0.23
217 0.2
218 0.19
219 0.19
220 0.17
221 0.15
222 0.14
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.11
229 0.11
230 0.15
231 0.19
232 0.24
233 0.26
234 0.29
235 0.3
236 0.33
237 0.33
238 0.28
239 0.24
240 0.19
241 0.18
242 0.14
243 0.13
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.12
285 0.11
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.09
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.08
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.1
315 0.1
316 0.11
317 0.12
318 0.15
319 0.16
320 0.2
321 0.21
322 0.24
323 0.28
324 0.35
325 0.43
326 0.44
327 0.5
328 0.51
329 0.57
330 0.5
331 0.49
332 0.47
333 0.45
334 0.4
335 0.34
336 0.29
337 0.22
338 0.22
339 0.2
340 0.15
341 0.09
342 0.1
343 0.11
344 0.12
345 0.13
346 0.18
347 0.21
348 0.25
349 0.32
350 0.39
351 0.45
352 0.49
353 0.52
354 0.52
355 0.54
356 0.51
357 0.47
358 0.41
359 0.38
360 0.35
361 0.34
362 0.29
363 0.27
364 0.26
365 0.21
366 0.2
367 0.17
368 0.15
369 0.13
370 0.12
371 0.09
372 0.08
373 0.09
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.13
401 0.18
402 0.2
403 0.2
404 0.23
405 0.24
406 0.26
407 0.25
408 0.21
409 0.19
410 0.18
411 0.18
412 0.16
413 0.15
414 0.12
415 0.12
416 0.1
417 0.07
418 0.06
419 0.05
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.05
425 0.09
426 0.14
427 0.2
428 0.26
429 0.3
430 0.33
431 0.38
432 0.46
433 0.5
434 0.53
435 0.53
436 0.49
437 0.46
438 0.43
439 0.38
440 0.28
441 0.2
442 0.13
443 0.08
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.06
448 0.05
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.07
461 0.08
462 0.08
463 0.07
464 0.08
465 0.1
466 0.1
467 0.11
468 0.1
469 0.1
470 0.15
471 0.2
472 0.2
473 0.23
474 0.26
475 0.25
476 0.29
477 0.36
478 0.38
479 0.42
480 0.43
481 0.41
482 0.38
483 0.39
484 0.34
485 0.27
486 0.22
487 0.15
488 0.13
489 0.11
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.09
494 0.06
495 0.05
496 0.03
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.1
510 0.15
511 0.17
512 0.17
513 0.2
514 0.21
515 0.21
516 0.21
517 0.22
518 0.22
519 0.28
520 0.32
521 0.39
522 0.43
523 0.43
524 0.46
525 0.43
526 0.41
527 0.36
528 0.34
529 0.3
530 0.28
531 0.29
532 0.28
533 0.28
534 0.26
535 0.28
536 0.31
537 0.26
538 0.23
539 0.23
540 0.21
541 0.2
542 0.21
543 0.17
544 0.16
545 0.16
546 0.16
547 0.16
548 0.15
549 0.15
550 0.12
551 0.11
552 0.09
553 0.1
554 0.1
555 0.09
556 0.09
557 0.1
558 0.11
559 0.12
560 0.13
561 0.12
562 0.18
563 0.24
564 0.28
565 0.36
566 0.37
567 0.43
568 0.52
569 0.54
570 0.52
571 0.56
572 0.6
573 0.59
574 0.67
575 0.7
576 0.7
577 0.75
578 0.77
579 0.71
580 0.66
581 0.59
582 0.51
583 0.47
584 0.42
585 0.36
586 0.31
587 0.28
588 0.27
589 0.27
590 0.24
591 0.18
592 0.16
593 0.15
594 0.16
595 0.19
596 0.21
597 0.23
598 0.23
599 0.28
600 0.32
601 0.39
602 0.4
603 0.42
604 0.49
605 0.55
606 0.59
607 0.57
608 0.52
609 0.52
610 0.55
611 0.56
612 0.52
613 0.48
614 0.44
615 0.41
616 0.4
617 0.32
618 0.28
619 0.21
620 0.17
621 0.13
622 0.12
623 0.12
624 0.12
625 0.12
626 0.09
627 0.1
628 0.1
629 0.09
630 0.11
631 0.1
632 0.1
633 0.17
634 0.19
635 0.19
636 0.19
637 0.2
638 0.23
639 0.28
640 0.33
641 0.33
642 0.36
643 0.41
644 0.47
645 0.55
646 0.58
647 0.61
648 0.65
649 0.7
650 0.76
651 0.78
652 0.78
653 0.75
654 0.69
655 0.62
656 0.53
657 0.47
658 0.39
659 0.33
660 0.27
661 0.26
662 0.25
663 0.22
664 0.24
665 0.23
666 0.24
667 0.25
668 0.31
669 0.32
670 0.41
671 0.46
672 0.51
673 0.52
674 0.52