Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A061HCH2

Protein Details
Accession A0A061HCH2    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-147QDAKPAKKAAKKSKAKAKVEHydrophilic
181-200VEEKPKKKRGRPSKAETAARBasic
216-235AEPESPKKKRGRPRKSDVEABasic
266-285APASAKKRGRPPKAKAEKVEBasic
390-409ATSTSDEPAKKKRGRPKKSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
131-146KPAKKAAKKSKAKAKV
156-170EKPKKAAKKAKSKAR
184-195KPKKKRGRPSKA
220-241SPKKKRGRPRKSDVEAAAKPKK
270-282AKKRGRPPKAKAE
301-311AKKRGRPPKAK
333-346PAKKKAVGRPKKEV
355-366APVPKKRGRPPK
398-409AKKKRGRPKKSV
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR001510  Znf_PARP  
IPR036957  Znf_PARP_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG pfp:PFL1_02960  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF00645  zf-PARP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50064  ZF_PARP_2  
Amino Acid Sequences MPYRIERAPSNRSGCRGPKPCAGTKILKGELRLGTLVTIQGNDTFHWRHWGCTTPKILSNMRNGDGIETADDLDGAEDLDQDARDKITTALQAGHVAAEDIPESAKEKPKADDGDEADAQDDEHKHVQDAKPAKKAAKKSKAKAKVESDDEAEVEEKPKKAAKKAKSKARIEDEDEVDVEVEEKPKKKRGRPSKAETAARDAAEVEAATSAAAAAAEPESPKKKRGRPRKSDVEAAAKPKKEEHDEDEDESTAPNGSGSNGATEAAPASAKKRGRPPKAKAEKVEADDEPTSSDVPVAPAAKKRGRPPKAKAVEAATDEPSSEDAPVAAAAAPAKKKAVGRPKKEVSEGDGEADAPVPKKRGRPPKDQAAAAAAAAAAAAAPSTDSEAAATSTSDEPAKKKRGRPKKSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.65
3 0.65
4 0.62
5 0.63
6 0.66
7 0.69
8 0.67
9 0.66
10 0.62
11 0.62
12 0.65
13 0.63
14 0.58
15 0.52
16 0.53
17 0.48
18 0.44
19 0.37
20 0.28
21 0.22
22 0.21
23 0.21
24 0.15
25 0.13
26 0.11
27 0.13
28 0.14
29 0.14
30 0.18
31 0.18
32 0.19
33 0.28
34 0.27
35 0.28
36 0.3
37 0.38
38 0.38
39 0.43
40 0.47
41 0.42
42 0.46
43 0.5
44 0.52
45 0.49
46 0.54
47 0.52
48 0.48
49 0.46
50 0.41
51 0.36
52 0.32
53 0.26
54 0.18
55 0.13
56 0.12
57 0.1
58 0.09
59 0.08
60 0.07
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.04
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.13
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.15
79 0.17
80 0.16
81 0.15
82 0.11
83 0.1
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.08
91 0.11
92 0.19
93 0.22
94 0.24
95 0.26
96 0.32
97 0.35
98 0.36
99 0.39
100 0.35
101 0.37
102 0.35
103 0.33
104 0.27
105 0.23
106 0.21
107 0.17
108 0.15
109 0.12
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.22
114 0.23
115 0.27
116 0.35
117 0.38
118 0.41
119 0.44
120 0.49
121 0.49
122 0.57
123 0.6
124 0.63
125 0.66
126 0.68
127 0.76
128 0.81
129 0.8
130 0.79
131 0.75
132 0.71
133 0.66
134 0.6
135 0.52
136 0.42
137 0.37
138 0.29
139 0.22
140 0.15
141 0.13
142 0.14
143 0.12
144 0.13
145 0.17
146 0.19
147 0.27
148 0.36
149 0.42
150 0.51
151 0.59
152 0.68
153 0.74
154 0.76
155 0.76
156 0.75
157 0.7
158 0.64
159 0.61
160 0.52
161 0.43
162 0.38
163 0.3
164 0.22
165 0.17
166 0.13
167 0.08
168 0.09
169 0.11
170 0.15
171 0.18
172 0.26
173 0.33
174 0.39
175 0.49
176 0.58
177 0.66
178 0.72
179 0.77
180 0.79
181 0.8
182 0.78
183 0.69
184 0.64
185 0.56
186 0.46
187 0.38
188 0.27
189 0.19
190 0.15
191 0.13
192 0.07
193 0.04
194 0.04
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.07
206 0.12
207 0.14
208 0.2
209 0.27
210 0.35
211 0.45
212 0.56
213 0.65
214 0.7
215 0.78
216 0.83
217 0.8
218 0.78
219 0.72
220 0.69
221 0.62
222 0.59
223 0.55
224 0.45
225 0.42
226 0.37
227 0.37
228 0.33
229 0.34
230 0.31
231 0.35
232 0.36
233 0.38
234 0.37
235 0.33
236 0.28
237 0.25
238 0.2
239 0.11
240 0.08
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.13
257 0.16
258 0.2
259 0.3
260 0.4
261 0.5
262 0.6
263 0.66
264 0.71
265 0.8
266 0.82
267 0.76
268 0.75
269 0.7
270 0.63
271 0.6
272 0.49
273 0.43
274 0.36
275 0.32
276 0.24
277 0.19
278 0.16
279 0.12
280 0.12
281 0.08
282 0.08
283 0.11
284 0.12
285 0.13
286 0.18
287 0.25
288 0.3
289 0.35
290 0.43
291 0.52
292 0.58
293 0.66
294 0.69
295 0.73
296 0.74
297 0.72
298 0.66
299 0.6
300 0.56
301 0.51
302 0.46
303 0.37
304 0.3
305 0.27
306 0.24
307 0.2
308 0.16
309 0.12
310 0.09
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.11
319 0.12
320 0.13
321 0.14
322 0.17
323 0.2
324 0.29
325 0.39
326 0.45
327 0.52
328 0.61
329 0.69
330 0.7
331 0.72
332 0.65
333 0.6
334 0.57
335 0.49
336 0.41
337 0.33
338 0.28
339 0.24
340 0.23
341 0.19
342 0.14
343 0.16
344 0.18
345 0.21
346 0.29
347 0.39
348 0.48
349 0.54
350 0.63
351 0.7
352 0.76
353 0.8
354 0.73
355 0.66
356 0.6
357 0.53
358 0.42
359 0.33
360 0.21
361 0.13
362 0.11
363 0.09
364 0.04
365 0.03
366 0.03
367 0.02
368 0.03
369 0.03
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.09
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.11
379 0.11
380 0.13
381 0.16
382 0.18
383 0.23
384 0.32
385 0.43
386 0.48
387 0.56
388 0.65
389 0.73