Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A061H4J3

Protein Details
Accession A0A061H4J3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
457-485LIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGEIDTYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-278KETKKAAPAAPAPNSKKRKA
463-475KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG pfp:PFL1_05520  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MGKKSAPSTPLKASTSTTPATPITDPALVQTFQMVHAFLQEHAPAVAPSLLSAAPVEAQAPANAAKEMAKHLVTAIQNSPKKEWASPSTTASKAKAAPAPAPDAASPSSSDESDDSGDESDSESSDSSSDDDSSDSDSSDSDSSDDDDDNDDDKEKPKAEKMDEDSSSSDDSSDSDDSSSSSSSSSSSSSSSSSSDSDSDSDSSSSSDSDANDAKEVEAASITAAVAPASHHSSETSETVKNDDSESDSSSSSDEEEKKETKKAAPAAPAPNSKKRKAASPSSSSSSESDSDSSSDSDSDSSSSSSSSSDSDSDSSDSDSSDSSSGSSSSSDSDSDSDSDSDSSSSSASSADKATTPPNVDPDAHKSKKLKTAAGAAAAPVVAEWQPNPLYATPPAGSGKKNGGGGSGGAARGGAQNTPFQRVKADQVTYLDDRMKDMSYDAKPGAGDWGAKASADLIVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGEIDTYGTHSIKFSYDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.45
3 0.41
4 0.33
5 0.3
6 0.28
7 0.3
8 0.28
9 0.24
10 0.22
11 0.23
12 0.22
13 0.21
14 0.24
15 0.21
16 0.2
17 0.2
18 0.16
19 0.16
20 0.17
21 0.15
22 0.11
23 0.14
24 0.15
25 0.13
26 0.16
27 0.15
28 0.15
29 0.14
30 0.15
31 0.12
32 0.12
33 0.13
34 0.09
35 0.09
36 0.1
37 0.1
38 0.09
39 0.09
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.11
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.13
54 0.16
55 0.18
56 0.17
57 0.16
58 0.16
59 0.22
60 0.22
61 0.24
62 0.26
63 0.32
64 0.35
65 0.38
66 0.4
67 0.4
68 0.41
69 0.41
70 0.42
71 0.39
72 0.42
73 0.42
74 0.45
75 0.45
76 0.46
77 0.46
78 0.4
79 0.38
80 0.34
81 0.35
82 0.34
83 0.3
84 0.3
85 0.31
86 0.33
87 0.29
88 0.29
89 0.24
90 0.23
91 0.22
92 0.19
93 0.17
94 0.16
95 0.17
96 0.15
97 0.16
98 0.14
99 0.15
100 0.15
101 0.15
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.11
132 0.11
133 0.09
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.14
141 0.17
142 0.17
143 0.19
144 0.23
145 0.28
146 0.3
147 0.37
148 0.41
149 0.45
150 0.44
151 0.44
152 0.4
153 0.35
154 0.33
155 0.25
156 0.19
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.11
166 0.1
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.13
180 0.12
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.13
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.1
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.08
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.05
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.11
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.13
234 0.13
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.09
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.16
244 0.18
245 0.2
246 0.23
247 0.24
248 0.23
249 0.26
250 0.3
251 0.3
252 0.32
253 0.35
254 0.37
255 0.4
256 0.45
257 0.45
258 0.49
259 0.51
260 0.48
261 0.49
262 0.45
263 0.48
264 0.47
265 0.53
266 0.51
267 0.52
268 0.53
269 0.51
270 0.52
271 0.45
272 0.39
273 0.32
274 0.25
275 0.2
276 0.17
277 0.14
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.12
301 0.11
302 0.12
303 0.11
304 0.1
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.12
341 0.14
342 0.16
343 0.19
344 0.19
345 0.22
346 0.23
347 0.23
348 0.25
349 0.31
350 0.38
351 0.36
352 0.41
353 0.41
354 0.45
355 0.52
356 0.54
357 0.49
358 0.42
359 0.49
360 0.45
361 0.44
362 0.38
363 0.3
364 0.26
365 0.22
366 0.18
367 0.09
368 0.08
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.09
373 0.1
374 0.11
375 0.13
376 0.13
377 0.15
378 0.16
379 0.2
380 0.17
381 0.19
382 0.22
383 0.23
384 0.23
385 0.23
386 0.28
387 0.27
388 0.29
389 0.26
390 0.24
391 0.22
392 0.21
393 0.21
394 0.17
395 0.13
396 0.11
397 0.11
398 0.1
399 0.12
400 0.12
401 0.11
402 0.1
403 0.16
404 0.18
405 0.26
406 0.26
407 0.24
408 0.28
409 0.3
410 0.36
411 0.37
412 0.38
413 0.34
414 0.35
415 0.41
416 0.38
417 0.39
418 0.35
419 0.28
420 0.28
421 0.26
422 0.24
423 0.19
424 0.18
425 0.23
426 0.21
427 0.26
428 0.24
429 0.24
430 0.23
431 0.22
432 0.25
433 0.19
434 0.18
435 0.14
436 0.18
437 0.16
438 0.16
439 0.16
440 0.12
441 0.12
442 0.12
443 0.11
444 0.1
445 0.13
446 0.14
447 0.15
448 0.16
449 0.15
450 0.21
451 0.27
452 0.35
453 0.43
454 0.53
455 0.63
456 0.73
457 0.82
458 0.85
459 0.9
460 0.91
461 0.9
462 0.9
463 0.87
464 0.87
465 0.86
466 0.8
467 0.7
468 0.6
469 0.52
470 0.42
471 0.38
472 0.3
473 0.21
474 0.18
475 0.18
476 0.18
477 0.18