Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J0XER1

Protein Details
Accession A0A0J0XER1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-62DEPVKAVKRGGRPPKSTKKERALSEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-57VKRGGRPPKSTKKE
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040349  Csm1/Pcs1  
IPR020981  Csm1/Pcs1_C  
IPR038608  Csm1/Pcs1_C_sf  
Gene Ontology GO:0033551  C:monopolin complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF12539  Csm1  
Amino Acid Sequences MPPKAPSSKRGKENAPPKVIATKISSGLEDDFDNMIEDEPVKAVKRGGRPPKSTKKERALSEMVADGAMDVEEQVQSRTSPNVIQALSKSTRNGDDLQRLQAKCEQLEKERDTFAKQFDELSSLRVSGAEALLVKFKESAEARAKAQTAVIQSQEALYEKQTAKVKSLEEALAASQEALARAEAAAAPPTFDAKLERMDQRALRDEVHKLRDVVKTKDGEIAALQREYQEEVAHSRKLQESAAHMRRSAEPPAKPIVNEVHSLSVRLYEELTGLDILDAQVRHDPKTGDERIYKCIQTTGGRNYTFRLCLRNEFDKGRKQWEKIVQIAPQDMDKETDRKLLKRLGPFREAFDIPREQLLAAYAQLTARMDPEGQFEEPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.76
3 0.68
4 0.62
5 0.62
6 0.56
7 0.5
8 0.45
9 0.39
10 0.36
11 0.35
12 0.33
13 0.28
14 0.28
15 0.25
16 0.2
17 0.18
18 0.15
19 0.13
20 0.14
21 0.12
22 0.12
23 0.11
24 0.11
25 0.09
26 0.09
27 0.12
28 0.12
29 0.13
30 0.16
31 0.22
32 0.3
33 0.4
34 0.5
35 0.57
36 0.64
37 0.73
38 0.81
39 0.84
40 0.86
41 0.86
42 0.85
43 0.83
44 0.8
45 0.77
46 0.71
47 0.62
48 0.55
49 0.46
50 0.35
51 0.27
52 0.22
53 0.14
54 0.09
55 0.07
56 0.05
57 0.04
58 0.04
59 0.05
60 0.05
61 0.06
62 0.07
63 0.08
64 0.09
65 0.11
66 0.12
67 0.13
68 0.15
69 0.19
70 0.19
71 0.2
72 0.2
73 0.25
74 0.26
75 0.26
76 0.25
77 0.23
78 0.25
79 0.26
80 0.29
81 0.28
82 0.34
83 0.35
84 0.4
85 0.45
86 0.43
87 0.43
88 0.43
89 0.4
90 0.33
91 0.37
92 0.34
93 0.32
94 0.4
95 0.41
96 0.39
97 0.4
98 0.39
99 0.38
100 0.37
101 0.34
102 0.29
103 0.25
104 0.24
105 0.21
106 0.24
107 0.2
108 0.19
109 0.17
110 0.14
111 0.14
112 0.12
113 0.12
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.06
118 0.07
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.14
125 0.14
126 0.2
127 0.24
128 0.26
129 0.27
130 0.3
131 0.31
132 0.25
133 0.25
134 0.21
135 0.17
136 0.17
137 0.16
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.09
144 0.08
145 0.13
146 0.13
147 0.19
148 0.23
149 0.23
150 0.24
151 0.27
152 0.27
153 0.22
154 0.24
155 0.19
156 0.15
157 0.15
158 0.12
159 0.09
160 0.09
161 0.07
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.07
181 0.1
182 0.13
183 0.15
184 0.16
185 0.19
186 0.2
187 0.22
188 0.25
189 0.24
190 0.22
191 0.22
192 0.26
193 0.28
194 0.3
195 0.29
196 0.25
197 0.28
198 0.33
199 0.35
200 0.33
201 0.33
202 0.31
203 0.31
204 0.34
205 0.29
206 0.23
207 0.2
208 0.2
209 0.17
210 0.15
211 0.15
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.08
217 0.08
218 0.12
219 0.15
220 0.16
221 0.15
222 0.17
223 0.18
224 0.19
225 0.19
226 0.17
227 0.2
228 0.29
229 0.36
230 0.35
231 0.33
232 0.34
233 0.37
234 0.38
235 0.39
236 0.35
237 0.3
238 0.32
239 0.36
240 0.35
241 0.32
242 0.31
243 0.3
244 0.25
245 0.26
246 0.23
247 0.23
248 0.22
249 0.23
250 0.2
251 0.18
252 0.16
253 0.15
254 0.14
255 0.09
256 0.1
257 0.09
258 0.1
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.08
265 0.07
266 0.08
267 0.13
268 0.14
269 0.15
270 0.18
271 0.19
272 0.19
273 0.28
274 0.31
275 0.32
276 0.38
277 0.39
278 0.41
279 0.46
280 0.43
281 0.35
282 0.33
283 0.31
284 0.29
285 0.33
286 0.36
287 0.39
288 0.4
289 0.4
290 0.41
291 0.41
292 0.41
293 0.37
294 0.34
295 0.29
296 0.35
297 0.42
298 0.46
299 0.46
300 0.49
301 0.54
302 0.57
303 0.59
304 0.62
305 0.62
306 0.58
307 0.62
308 0.64
309 0.64
310 0.61
311 0.63
312 0.56
313 0.52
314 0.52
315 0.44
316 0.37
317 0.32
318 0.26
319 0.23
320 0.23
321 0.23
322 0.22
323 0.29
324 0.31
325 0.32
326 0.38
327 0.44
328 0.47
329 0.54
330 0.61
331 0.61
332 0.64
333 0.63
334 0.61
335 0.59
336 0.53
337 0.46
338 0.43
339 0.41
340 0.34
341 0.35
342 0.31
343 0.24
344 0.23
345 0.22
346 0.17
347 0.13
348 0.12
349 0.11
350 0.1
351 0.12
352 0.12
353 0.11
354 0.11
355 0.13
356 0.13
357 0.13
358 0.18
359 0.21