Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J0XWF6

Protein Details
Accession A0A0J0XWF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-370RDKYDDDRRRDRSRSPSKRRVVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
356-368RRRDRSRSPSKRR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MAEMQRKLLEQMMGPEAMGFNPPSLDWWNEKVCRDYLFGTCLHDTFSNTKMDLGPCPKTHSDRILKQFQEAQKEPSPDPRIAAFRQEHENNIYQFVDECDRRIRASQRKLEKTPEENRKTVDLMKEIGEIELAIQGGTDEIEQLGAEGKVDESMEKLAAVDALKQLKNDKEKELQLLNENAGASGHQKLRVCEICGAMLSVLDSDKRLADHFGGKMHLGFHELRKLMDAWAEERMRGPPPPPLGVPPPSVAPSGPPPPGPGPGGSRPPVPPFPLSDEKREAGEIGEDGSDRSRSRDRHEERRGSGRYDDRDRYGGRDRYGDRERDRYGDGGRDRYGDRDRSRYEDRDRRDKYDDDRRRDRSRSPSKRRVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.17
4 0.16
5 0.16
6 0.12
7 0.09
8 0.1
9 0.1
10 0.12
11 0.15
12 0.19
13 0.2
14 0.25
15 0.33
16 0.37
17 0.4
18 0.4
19 0.4
20 0.39
21 0.37
22 0.35
23 0.3
24 0.28
25 0.27
26 0.27
27 0.27
28 0.24
29 0.24
30 0.22
31 0.22
32 0.23
33 0.25
34 0.23
35 0.22
36 0.24
37 0.24
38 0.25
39 0.29
40 0.32
41 0.35
42 0.33
43 0.39
44 0.42
45 0.44
46 0.47
47 0.5
48 0.53
49 0.56
50 0.62
51 0.65
52 0.61
53 0.59
54 0.62
55 0.56
56 0.56
57 0.5
58 0.48
59 0.45
60 0.48
61 0.46
62 0.49
63 0.49
64 0.4
65 0.4
66 0.37
67 0.36
68 0.34
69 0.41
70 0.33
71 0.32
72 0.4
73 0.39
74 0.38
75 0.37
76 0.41
77 0.34
78 0.34
79 0.3
80 0.22
81 0.21
82 0.2
83 0.22
84 0.17
85 0.18
86 0.2
87 0.21
88 0.22
89 0.27
90 0.34
91 0.38
92 0.48
93 0.54
94 0.6
95 0.67
96 0.7
97 0.72
98 0.7
99 0.69
100 0.69
101 0.71
102 0.66
103 0.6
104 0.59
105 0.53
106 0.48
107 0.44
108 0.37
109 0.28
110 0.24
111 0.23
112 0.22
113 0.2
114 0.17
115 0.13
116 0.1
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.09
149 0.13
150 0.13
151 0.14
152 0.17
153 0.2
154 0.26
155 0.28
156 0.29
157 0.3
158 0.32
159 0.35
160 0.34
161 0.3
162 0.27
163 0.26
164 0.22
165 0.18
166 0.16
167 0.12
168 0.1
169 0.09
170 0.07
171 0.1
172 0.1
173 0.12
174 0.14
175 0.14
176 0.2
177 0.21
178 0.22
179 0.2
180 0.2
181 0.17
182 0.16
183 0.16
184 0.1
185 0.08
186 0.06
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.09
197 0.12
198 0.13
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.12
207 0.12
208 0.17
209 0.17
210 0.17
211 0.18
212 0.18
213 0.15
214 0.16
215 0.15
216 0.11
217 0.17
218 0.18
219 0.16
220 0.17
221 0.18
222 0.18
223 0.18
224 0.18
225 0.17
226 0.2
227 0.22
228 0.22
229 0.23
230 0.26
231 0.28
232 0.29
233 0.24
234 0.23
235 0.22
236 0.22
237 0.18
238 0.16
239 0.18
240 0.2
241 0.2
242 0.19
243 0.21
244 0.22
245 0.24
246 0.23
247 0.21
248 0.22
249 0.25
250 0.3
251 0.29
252 0.3
253 0.3
254 0.34
255 0.35
256 0.33
257 0.3
258 0.27
259 0.33
260 0.4
261 0.4
262 0.41
263 0.43
264 0.41
265 0.4
266 0.38
267 0.3
268 0.21
269 0.2
270 0.14
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.12
277 0.11
278 0.16
279 0.22
280 0.24
281 0.31
282 0.42
283 0.48
284 0.56
285 0.67
286 0.71
287 0.69
288 0.76
289 0.72
290 0.65
291 0.65
292 0.61
293 0.59
294 0.58
295 0.58
296 0.52
297 0.54
298 0.51
299 0.5
300 0.52
301 0.5
302 0.44
303 0.48
304 0.46
305 0.49
306 0.56
307 0.58
308 0.54
309 0.56
310 0.56
311 0.52
312 0.52
313 0.47
314 0.43
315 0.43
316 0.43
317 0.4
318 0.39
319 0.38
320 0.37
321 0.4
322 0.44
323 0.44
324 0.45
325 0.48
326 0.51
327 0.55
328 0.61
329 0.63
330 0.66
331 0.67
332 0.7
333 0.72
334 0.74
335 0.73
336 0.72
337 0.7
338 0.68
339 0.7
340 0.72
341 0.7
342 0.75
343 0.77
344 0.8
345 0.79
346 0.78
347 0.78
348 0.8
349 0.81
350 0.82