Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J0XF39

Protein Details
Accession A0A0J0XF39    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
263-284GPSKPRPPPSPRPKVNRTRAVTHydrophilic
435-458DPTLTESPRKRRKVPTPSPRMATRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
266-279KPRPPPSPRPKVNR
442-453PRKRRKVPTPSP
Subcellular Location(s) mito 9, cyto 8, nucl 5, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Amino Acid Sequences MPPSPGKIQPLPIKVLYTIDTSPQSYLTVLNDKQPVFVQQVGAELVGSVALKALAKGICYASPECVPNRKSLDYTVYNLDPSPRASGGRAFPSPSAPPPASVWTGRGFLSWALAEAGGGATLVRGRLAREYEFSNACFAEGGGLEGLMAAARSEDADGKGWGLEVTLTLRQLNPEGKAEFAGRREFETMLAGGKSSAANPLAVTSPGRDRGFVKPAPPQPKPPSPLRRPVPTAAAASSNGVSRNVSNAANAINAATATNATAGPSKPRPPPSPRPKVNRTRAVTPPPQPKHIPQTPPTPSPSRARILEVLKSEASMSPNMAKKLVGNPFLVKLLKTLPESDTTSSPGPGRWEKVTVPPAPHSDSFEGRCENCGTTQSDQWLKKKVKGNRDARVCQPCGQYYNQHRTLPVPNSTPGAASTPAPVRSSPRLNKTRADPTLTESPRKRRKVPTPSPRMATRASARKTGDIGTEEATTPTPGEAGSSLDFASHFPFADLNESTPAENEDLSTLFLQFQDEVPSAGMTLDSVFGTHDTNDILELLKSLEGDGGTGVSQSEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.34
4 0.29
5 0.26
6 0.25
7 0.26
8 0.25
9 0.25
10 0.23
11 0.22
12 0.18
13 0.19
14 0.19
15 0.24
16 0.24
17 0.29
18 0.34
19 0.33
20 0.34
21 0.34
22 0.33
23 0.29
24 0.3
25 0.26
26 0.2
27 0.22
28 0.21
29 0.2
30 0.16
31 0.11
32 0.09
33 0.08
34 0.07
35 0.05
36 0.04
37 0.05
38 0.06
39 0.06
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.13
44 0.15
45 0.15
46 0.19
47 0.2
48 0.19
49 0.22
50 0.25
51 0.28
52 0.35
53 0.35
54 0.38
55 0.43
56 0.43
57 0.41
58 0.42
59 0.45
60 0.41
61 0.42
62 0.41
63 0.36
64 0.34
65 0.32
66 0.31
67 0.25
68 0.23
69 0.23
70 0.19
71 0.19
72 0.2
73 0.25
74 0.27
75 0.31
76 0.31
77 0.3
78 0.29
79 0.32
80 0.33
81 0.31
82 0.33
83 0.27
84 0.27
85 0.27
86 0.31
87 0.3
88 0.28
89 0.27
90 0.23
91 0.24
92 0.22
93 0.2
94 0.17
95 0.14
96 0.15
97 0.13
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.08
103 0.07
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.03
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.11
114 0.15
115 0.16
116 0.18
117 0.21
118 0.24
119 0.25
120 0.25
121 0.23
122 0.2
123 0.18
124 0.16
125 0.13
126 0.1
127 0.08
128 0.08
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.03
135 0.03
136 0.02
137 0.02
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.06
142 0.07
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.07
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.14
159 0.16
160 0.16
161 0.18
162 0.18
163 0.18
164 0.19
165 0.2
166 0.19
167 0.2
168 0.22
169 0.19
170 0.2
171 0.22
172 0.21
173 0.19
174 0.18
175 0.15
176 0.13
177 0.12
178 0.1
179 0.08
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.12
193 0.18
194 0.18
195 0.18
196 0.2
197 0.25
198 0.3
199 0.3
200 0.3
201 0.32
202 0.39
203 0.46
204 0.46
205 0.49
206 0.5
207 0.56
208 0.57
209 0.59
210 0.62
211 0.6
212 0.68
213 0.64
214 0.63
215 0.6
216 0.58
217 0.52
218 0.44
219 0.4
220 0.31
221 0.27
222 0.21
223 0.17
224 0.16
225 0.13
226 0.11
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.1
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.07
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.07
249 0.07
250 0.11
251 0.14
252 0.19
253 0.24
254 0.3
255 0.35
256 0.42
257 0.53
258 0.59
259 0.67
260 0.7
261 0.73
262 0.77
263 0.81
264 0.82
265 0.8
266 0.73
267 0.68
268 0.66
269 0.65
270 0.62
271 0.59
272 0.6
273 0.53
274 0.54
275 0.51
276 0.48
277 0.5
278 0.5
279 0.48
280 0.41
281 0.48
282 0.48
283 0.49
284 0.49
285 0.44
286 0.41
287 0.4
288 0.41
289 0.35
290 0.32
291 0.31
292 0.32
293 0.31
294 0.32
295 0.29
296 0.27
297 0.23
298 0.22
299 0.2
300 0.16
301 0.15
302 0.11
303 0.11
304 0.13
305 0.17
306 0.17
307 0.17
308 0.15
309 0.15
310 0.22
311 0.26
312 0.24
313 0.22
314 0.23
315 0.23
316 0.26
317 0.25
318 0.18
319 0.15
320 0.14
321 0.16
322 0.16
323 0.17
324 0.15
325 0.18
326 0.2
327 0.21
328 0.2
329 0.2
330 0.19
331 0.19
332 0.18
333 0.16
334 0.18
335 0.19
336 0.21
337 0.2
338 0.22
339 0.22
340 0.29
341 0.34
342 0.32
343 0.32
344 0.32
345 0.34
346 0.35
347 0.35
348 0.31
349 0.28
350 0.29
351 0.28
352 0.28
353 0.28
354 0.24
355 0.25
356 0.23
357 0.21
358 0.18
359 0.19
360 0.2
361 0.19
362 0.21
363 0.24
364 0.3
365 0.33
366 0.36
367 0.42
368 0.41
369 0.46
370 0.53
371 0.55
372 0.58
373 0.64
374 0.69
375 0.69
376 0.75
377 0.72
378 0.72
379 0.74
380 0.66
381 0.61
382 0.55
383 0.49
384 0.43
385 0.42
386 0.42
387 0.43
388 0.49
389 0.5
390 0.48
391 0.46
392 0.46
393 0.51
394 0.47
395 0.43
396 0.37
397 0.32
398 0.33
399 0.33
400 0.29
401 0.23
402 0.2
403 0.16
404 0.13
405 0.16
406 0.17
407 0.19
408 0.2
409 0.2
410 0.23
411 0.28
412 0.37
413 0.41
414 0.47
415 0.53
416 0.55
417 0.59
418 0.61
419 0.65
420 0.59
421 0.58
422 0.49
423 0.47
424 0.54
425 0.52
426 0.54
427 0.5
428 0.57
429 0.61
430 0.67
431 0.69
432 0.68
433 0.76
434 0.79
435 0.83
436 0.84
437 0.84
438 0.84
439 0.82
440 0.76
441 0.69
442 0.6
443 0.56
444 0.53
445 0.52
446 0.49
447 0.5
448 0.48
449 0.47
450 0.46
451 0.41
452 0.37
453 0.3
454 0.28
455 0.23
456 0.23
457 0.21
458 0.2
459 0.18
460 0.15
461 0.13
462 0.11
463 0.09
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.1
468 0.1
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.11
473 0.11
474 0.13
475 0.11
476 0.1
477 0.1
478 0.11
479 0.11
480 0.16
481 0.16
482 0.15
483 0.18
484 0.19
485 0.18
486 0.18
487 0.2
488 0.16
489 0.15
490 0.14
491 0.12
492 0.11
493 0.13
494 0.13
495 0.11
496 0.11
497 0.11
498 0.12
499 0.11
500 0.12
501 0.15
502 0.15
503 0.15
504 0.15
505 0.15
506 0.13
507 0.13
508 0.11
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.08
516 0.1
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.1
521 0.11
522 0.1
523 0.11
524 0.09
525 0.09
526 0.1
527 0.1
528 0.1
529 0.09
530 0.11
531 0.09
532 0.1
533 0.09
534 0.09
535 0.08
536 0.08