FuNGI

A0A0J0XJC4

Protein Details

Accession

A0A0J0XJC4

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
471-494	AAPSFLLKKKTNRHSGPQRITTTD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
501-513	SIAKPGNRVPRRR

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010684 RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A
Gene Ontology	GO:0070449 C:elongin complex GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF06881 Elongin_A

Amino Acid Sequences

MPNPLEYDEESDTGDGLFGSDDEDNGCIDVDDILPDTRKPVAPLKSSTAASVSLTGASTSQLSTPSGRLNPDQRYEELTRQRSFLEPAPITGPPSFKAMIMRVILQNASRIDDIGGLTYKQMAIFIDQLPRTQLQEVEENCPHLYKDTDWLWEAFLIKEFPLFYTKCRDKGGEPRTSGWRRKFAEAYQEAEERKTKAAARISLKYAEAEKVRQDKKIRLIDDFVAPPKGRRGGHTLRNAKIGKQSLPTNYMAQKQVRGTSAISKARTDLQRTRVALTHASGKYVPPSSRPVAASSTSAYDNPYARSTMLHESNPKHPNYVAPELRVEGPRLPPPRVPKPSPTVAPDADPFPGSRRTDPAARASLPEHIKLTKPSQQERFRIDDYKMTKTAPMRDIRKPEVPNFNPDTVDKPKAKIDFFARPQMAKAKRPPPVDEEADNKRARKDTGEGTSTSPPASARPPPPHATPPAPGAAPSFLLKKKTNRHSGPQRITTTDVEAVKRSIAKPGNRVPRRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.09
3	0.07
4	0.06
5	0.05
6	0.07
7	0.07
8	0.08
9	0.08
10	0.09
11	0.09
12	0.09
13	0.09
14	0.07
15	0.07
16	0.08
17	0.07
18	0.08
19	0.09
20	0.11
21	0.12
22	0.12
23	0.14
24	0.17
25	0.19
26	0.22
27	0.28
28	0.34
29	0.39
30	0.44
31	0.48
32	0.5
33	0.49
34	0.46
35	0.39
36	0.32
37	0.27
38	0.24
39	0.18
40	0.13
41	0.13
42	0.12
43	0.11
44	0.1
45	0.1
46	0.09
47	0.09
48	0.1
49	0.12
50	0.13
51	0.15
52	0.2
53	0.22
54	0.25
55	0.3
56	0.36
57	0.41
58	0.46
59	0.47
60	0.43
61	0.47
62	0.49
63	0.52
64	0.54
65	0.54
66	0.49
67	0.47
68	0.47
69	0.42
70	0.41
71	0.37
72	0.37
73	0.3
74	0.31
75	0.32
76	0.31
77	0.32
78	0.3
79	0.27
80	0.18
81	0.21
82	0.2
83	0.18
84	0.21
85	0.2
86	0.22
87	0.22
88	0.24
89	0.22
90	0.23
91	0.23
92	0.2
93	0.22
94	0.18
95	0.19
96	0.16
97	0.15
98	0.14
99	0.15
100	0.14
101	0.12
102	0.13
103	0.1
104	0.1
105	0.11
106	0.1
107	0.09
108	0.09
109	0.07
110	0.08
111	0.11
112	0.13
113	0.18
114	0.18
115	0.19
116	0.21
117	0.22
118	0.21
119	0.2
120	0.2
121	0.16
122	0.23
123	0.24
124	0.28
125	0.28
126	0.29
127	0.27
128	0.26
129	0.24
130	0.18
131	0.18
132	0.13
133	0.18
134	0.18
135	0.2
136	0.21
137	0.21
138	0.2
139	0.2
140	0.2
141	0.14
142	0.13
143	0.11
144	0.1
145	0.11
146	0.1
147	0.1
148	0.14
149	0.14
150	0.14
151	0.24
152	0.27
153	0.3
154	0.33
155	0.34
156	0.33
157	0.43
158	0.5
159	0.48
160	0.46
161	0.46
162	0.54
163	0.59
164	0.62
165	0.58
166	0.59
167	0.54
168	0.56
169	0.56
170	0.49
171	0.51
172	0.46
173	0.44
174	0.38
175	0.39
176	0.34
177	0.33
178	0.33
179	0.24
180	0.22
181	0.21
182	0.2
183	0.22
184	0.26
185	0.31
186	0.33
187	0.35
188	0.37
189	0.36
190	0.34
191	0.3
192	0.26
193	0.23
194	0.2
195	0.18
196	0.21
197	0.28
198	0.3
199	0.34
200	0.37
201	0.39
202	0.46
203	0.51
204	0.47
205	0.4
206	0.41
207	0.37
208	0.37
209	0.33
210	0.26
211	0.22
212	0.21
213	0.19
214	0.2
215	0.23
216	0.2
217	0.21
218	0.28
219	0.32
220	0.4
221	0.49
222	0.52
223	0.49
224	0.56
225	0.54
226	0.47
227	0.46
228	0.4
229	0.33
230	0.3
231	0.31
232	0.26
233	0.29
234	0.29
235	0.26
236	0.26
237	0.27
238	0.27
239	0.25
240	0.26
241	0.23
242	0.24
243	0.22
244	0.21
245	0.18
246	0.2
247	0.25
248	0.26
249	0.26
250	0.24
251	0.24
252	0.28
253	0.3
254	0.31
255	0.3
256	0.31
257	0.37
258	0.37
259	0.38
260	0.34
261	0.33
262	0.29
263	0.24
264	0.27
265	0.21
266	0.21
267	0.2
268	0.18
269	0.19
270	0.22
271	0.21
272	0.15
273	0.2
274	0.21
275	0.24
276	0.24
277	0.23
278	0.22
279	0.23
280	0.21
281	0.17
282	0.17
283	0.15
284	0.14
285	0.13
286	0.13
287	0.13
288	0.14
289	0.14
290	0.13
291	0.12
292	0.13
293	0.15
294	0.18
295	0.2
296	0.21
297	0.25
298	0.28
299	0.36
300	0.41
301	0.38
302	0.34
303	0.31
304	0.33
305	0.34
306	0.4
307	0.33
308	0.29
309	0.3
310	0.3
311	0.32
312	0.29
313	0.24
314	0.18
315	0.2
316	0.25
317	0.27
318	0.29
319	0.3
320	0.36
321	0.45
322	0.5
323	0.51
324	0.5
325	0.53
326	0.56
327	0.55
328	0.51
329	0.46
330	0.39
331	0.38
332	0.33
333	0.28
334	0.23
335	0.2
336	0.17
337	0.15
338	0.21
339	0.21
340	0.21
341	0.24
342	0.27
343	0.31
344	0.33
345	0.36
346	0.34
347	0.32
348	0.33
349	0.3
350	0.34
351	0.31
352	0.3
353	0.26
354	0.23
355	0.25
356	0.27
357	0.31
358	0.31
359	0.35
360	0.41
361	0.49
362	0.55
363	0.6
364	0.61
365	0.62
366	0.59
367	0.56
368	0.5
369	0.48
370	0.44
371	0.44
372	0.4
373	0.34
374	0.34
375	0.35
376	0.4
377	0.4
378	0.44
379	0.44
380	0.49
381	0.56
382	0.58
383	0.62
384	0.59
385	0.59
386	0.61
387	0.58
388	0.59
389	0.57
390	0.53
391	0.47
392	0.43
393	0.43
394	0.38
395	0.43
396	0.36
397	0.34
398	0.38
399	0.41
400	0.41
401	0.4
402	0.4
403	0.43
404	0.45
405	0.52
406	0.49
407	0.45
408	0.47
409	0.5
410	0.5
411	0.48
412	0.53
413	0.52
414	0.57
415	0.6
416	0.62
417	0.59
418	0.6
419	0.57
420	0.52
421	0.5
422	0.5
423	0.54
424	0.53
425	0.49
426	0.46
427	0.45
428	0.43
429	0.4
430	0.39
431	0.39
432	0.43
433	0.45
434	0.42
435	0.42
436	0.45
437	0.41
438	0.36
439	0.28
440	0.21
441	0.21
442	0.24
443	0.28
444	0.32
445	0.39
446	0.46
447	0.5
448	0.55
449	0.59
450	0.6
451	0.57
452	0.52
453	0.48
454	0.45
455	0.4
456	0.35
457	0.31
458	0.26
459	0.23
460	0.21
461	0.24
462	0.24
463	0.3
464	0.35
465	0.42
466	0.51
467	0.59
468	0.68
469	0.69
470	0.76
471	0.81
472	0.86
473	0.87
474	0.85
475	0.8
476	0.73
477	0.7
478	0.62
479	0.55
480	0.5
481	0.45
482	0.38
483	0.36
484	0.33
485	0.32
486	0.34
487	0.3
488	0.33
489	0.37
490	0.41
491	0.48
492	0.56
493	0.64

A0A0J0XJC4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer