Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J1BE18

Protein Details
Accession A0A0J1BE18    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
522-548ESAEERKARKKATKAEKANRRAEKKAHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
271-278GKKRHGKR
518-549RPKGESAEERKARKKATKAEKANRRAEKKAHT
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPKSRFRQPGAQHFQLVHRSLRDPLINDPDASKHVFRPIERGNEKAALTLSDLEASVDKSAMRANEGEAATYGITYDDSAYDYMQHLRPVGLGGADSVLLEAPQKQQKNKGFRMPEEVMASKHEISVQDVYASQEALPRELQGLQPDMDPHLRQVLEALEDDAFVDEDGEEDVFGELLGSGQLEDGEEAEEFEFAEWGVNEDDDDARTENGEPREETWEDRFRAFKAAGGHHKPASNGGWDDADSAERSEMADTVGSLVSGMDDLMVRGGKKRHGKRGPSDASGMSMSSSNVYRNDNLRTLDDRFDAIERQYDMDDDEEWDEDEDDVSIAPSYMSSMSRVSFLRGDEPTGAGPAPEISRDDFDAIMDDFLDNYEVVGRRMRESLGGTALSGPEKLRVLRAALEDGVEGPTREENRRRILDIERRIETGEYRDIKETMDRREVEPEHKWDVETILSTYTNTENHPGMIRVRNSEQAKERALRRAEAAAAAEAARARDGEEEEDSGSETEREAKVTIARPKGESAEERKARKKATKAEKANRRAEKKAHTLTFKDERKRQLTAHQKAVGGGRAADKVVGSRGVVSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.62
3 0.6
4 0.54
5 0.47
6 0.41
7 0.39
8 0.39
9 0.43
10 0.41
11 0.35
12 0.39
13 0.43
14 0.41
15 0.39
16 0.38
17 0.35
18 0.33
19 0.36
20 0.31
21 0.25
22 0.31
23 0.35
24 0.34
25 0.4
26 0.44
27 0.51
28 0.51
29 0.51
30 0.48
31 0.48
32 0.47
33 0.41
34 0.34
35 0.24
36 0.24
37 0.23
38 0.18
39 0.14
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.11
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.12
49 0.12
50 0.14
51 0.13
52 0.14
53 0.21
54 0.21
55 0.21
56 0.18
57 0.18
58 0.16
59 0.15
60 0.13
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.1
70 0.11
71 0.16
72 0.17
73 0.18
74 0.17
75 0.17
76 0.17
77 0.17
78 0.16
79 0.11
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.07
90 0.13
91 0.2
92 0.25
93 0.29
94 0.39
95 0.47
96 0.57
97 0.62
98 0.65
99 0.65
100 0.63
101 0.68
102 0.62
103 0.57
104 0.52
105 0.46
106 0.38
107 0.34
108 0.34
109 0.25
110 0.23
111 0.21
112 0.16
113 0.18
114 0.2
115 0.17
116 0.15
117 0.15
118 0.17
119 0.15
120 0.15
121 0.11
122 0.12
123 0.12
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.13
128 0.14
129 0.15
130 0.14
131 0.16
132 0.15
133 0.16
134 0.16
135 0.17
136 0.19
137 0.18
138 0.16
139 0.19
140 0.18
141 0.17
142 0.17
143 0.16
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.09
151 0.07
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.05
184 0.04
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.13
198 0.15
199 0.16
200 0.16
201 0.17
202 0.22
203 0.22
204 0.23
205 0.24
206 0.29
207 0.29
208 0.3
209 0.29
210 0.25
211 0.28
212 0.26
213 0.23
214 0.21
215 0.25
216 0.32
217 0.36
218 0.38
219 0.36
220 0.37
221 0.34
222 0.33
223 0.28
224 0.22
225 0.18
226 0.16
227 0.14
228 0.13
229 0.14
230 0.11
231 0.1
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.08
257 0.1
258 0.16
259 0.25
260 0.31
261 0.41
262 0.49
263 0.56
264 0.59
265 0.68
266 0.66
267 0.59
268 0.55
269 0.45
270 0.38
271 0.32
272 0.25
273 0.15
274 0.11
275 0.09
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.11
281 0.12
282 0.14
283 0.17
284 0.18
285 0.19
286 0.2
287 0.21
288 0.22
289 0.22
290 0.2
291 0.18
292 0.16
293 0.15
294 0.14
295 0.12
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.04
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.1
327 0.11
328 0.12
329 0.13
330 0.13
331 0.16
332 0.15
333 0.16
334 0.15
335 0.15
336 0.14
337 0.13
338 0.12
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.07
345 0.08
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.09
353 0.08
354 0.07
355 0.06
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.04
360 0.04
361 0.07
362 0.08
363 0.09
364 0.12
365 0.13
366 0.14
367 0.15
368 0.15
369 0.15
370 0.16
371 0.17
372 0.16
373 0.15
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.12
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.12
384 0.13
385 0.14
386 0.16
387 0.17
388 0.17
389 0.16
390 0.16
391 0.14
392 0.13
393 0.13
394 0.1
395 0.09
396 0.08
397 0.11
398 0.14
399 0.19
400 0.25
401 0.29
402 0.37
403 0.4
404 0.41
405 0.41
406 0.47
407 0.51
408 0.54
409 0.54
410 0.48
411 0.46
412 0.45
413 0.42
414 0.35
415 0.29
416 0.28
417 0.25
418 0.26
419 0.27
420 0.26
421 0.26
422 0.32
423 0.33
424 0.3
425 0.35
426 0.35
427 0.34
428 0.42
429 0.43
430 0.42
431 0.43
432 0.43
433 0.4
434 0.39
435 0.38
436 0.3
437 0.29
438 0.25
439 0.2
440 0.15
441 0.13
442 0.12
443 0.12
444 0.13
445 0.14
446 0.14
447 0.14
448 0.17
449 0.15
450 0.16
451 0.18
452 0.18
453 0.21
454 0.27
455 0.28
456 0.29
457 0.31
458 0.38
459 0.39
460 0.44
461 0.46
462 0.44
463 0.47
464 0.49
465 0.5
466 0.5
467 0.5
468 0.46
469 0.41
470 0.39
471 0.34
472 0.3
473 0.27
474 0.19
475 0.17
476 0.15
477 0.14
478 0.11
479 0.11
480 0.09
481 0.08
482 0.08
483 0.1
484 0.12
485 0.13
486 0.15
487 0.15
488 0.16
489 0.16
490 0.16
491 0.14
492 0.13
493 0.1
494 0.09
495 0.13
496 0.13
497 0.15
498 0.14
499 0.16
500 0.21
501 0.28
502 0.35
503 0.37
504 0.39
505 0.39
506 0.41
507 0.43
508 0.42
509 0.42
510 0.42
511 0.46
512 0.51
513 0.57
514 0.62
515 0.65
516 0.68
517 0.69
518 0.71
519 0.71
520 0.74
521 0.78
522 0.81
523 0.85
524 0.88
525 0.89
526 0.9
527 0.89
528 0.85
529 0.82
530 0.79
531 0.77
532 0.77
533 0.77
534 0.75
535 0.71
536 0.68
537 0.69
538 0.71
539 0.7
540 0.7
541 0.67
542 0.69
543 0.68
544 0.7
545 0.64
546 0.64
547 0.67
548 0.66
549 0.68
550 0.63
551 0.59
552 0.57
553 0.57
554 0.51
555 0.41
556 0.35
557 0.29
558 0.25
559 0.25
560 0.22
561 0.19
562 0.17
563 0.18
564 0.18
565 0.15
566 0.15