Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J0XIC0

Protein Details
Accession A0A0J0XIC0    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-251FGGSKASKEKKERAPKKEKIRIEVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-38K
43-51AAQKGGRGA
77-134PPKKDHQGRDRHTKGPREDRSHTGPRSRAPGAAGARGPKGGNRGGRGGAAGAAGAEKK
232-294KASKEKKERAPKKEKIRIEVDGQFAQPARPPRGDRPERGAARGGRGGNRGRGAPRGGAARAPR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 13.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Amino Acid Sequences MSVVSKNPFELLDDGEDRAPSPAPKGAAKVAPTAKQPKVVPGAAQKGGRGARAPTAPRATYAAGGGDDGFEGERVAPPKKDHQGRDRHTKGPREDRSHTGPRSRAPGAAGARGPKGGNRGGRGGAAGAAGAEKKTGAAPAENWTNEEGKAELSAETQGEKDVAEEGAETPAPAQEEAQEEDNSKTLDQYLAERANAALGGQLAKKEARQVSDDVEGKQFEREELENFFGGSKASKEKKERAPKKEKIRIEVDGQFAQPARPPRGDRPERGAARGGRGGNRGRGAPRGGAARAPRQAPANVADESAFPALGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.23
4 0.2
5 0.2
6 0.19
7 0.14
8 0.16
9 0.18
10 0.2
11 0.22
12 0.25
13 0.29
14 0.31
15 0.32
16 0.37
17 0.38
18 0.39
19 0.44
20 0.49
21 0.46
22 0.48
23 0.47
24 0.47
25 0.48
26 0.45
27 0.42
28 0.42
29 0.47
30 0.45
31 0.45
32 0.38
33 0.38
34 0.38
35 0.35
36 0.29
37 0.24
38 0.25
39 0.3
40 0.32
41 0.33
42 0.37
43 0.36
44 0.35
45 0.37
46 0.32
47 0.27
48 0.25
49 0.19
50 0.13
51 0.13
52 0.12
53 0.09
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.08
61 0.11
62 0.14
63 0.16
64 0.19
65 0.28
66 0.37
67 0.44
68 0.48
69 0.55
70 0.63
71 0.67
72 0.75
73 0.72
74 0.7
75 0.7
76 0.71
77 0.7
78 0.7
79 0.72
80 0.69
81 0.68
82 0.66
83 0.67
84 0.68
85 0.63
86 0.59
87 0.54
88 0.49
89 0.5
90 0.46
91 0.39
92 0.31
93 0.33
94 0.28
95 0.29
96 0.27
97 0.23
98 0.23
99 0.22
100 0.21
101 0.16
102 0.18
103 0.19
104 0.21
105 0.21
106 0.23
107 0.22
108 0.22
109 0.21
110 0.17
111 0.13
112 0.1
113 0.07
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.07
126 0.11
127 0.15
128 0.14
129 0.15
130 0.15
131 0.16
132 0.15
133 0.14
134 0.11
135 0.07
136 0.08
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.06
162 0.08
163 0.1
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.14
168 0.15
169 0.14
170 0.11
171 0.1
172 0.08
173 0.09
174 0.08
175 0.09
176 0.13
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.13
181 0.13
182 0.12
183 0.1
184 0.05
185 0.04
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.14
193 0.16
194 0.17
195 0.19
196 0.21
197 0.22
198 0.29
199 0.3
200 0.26
201 0.26
202 0.24
203 0.22
204 0.23
205 0.2
206 0.14
207 0.15
208 0.15
209 0.14
210 0.17
211 0.18
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.13
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.17
220 0.22
221 0.29
222 0.35
223 0.44
224 0.54
225 0.65
226 0.72
227 0.74
228 0.8
229 0.83
230 0.87
231 0.88
232 0.83
233 0.79
234 0.75
235 0.68
236 0.64
237 0.6
238 0.53
239 0.46
240 0.4
241 0.35
242 0.3
243 0.26
244 0.24
245 0.26
246 0.26
247 0.3
248 0.35
249 0.42
250 0.53
251 0.6
252 0.61
253 0.62
254 0.67
255 0.64
256 0.62
257 0.6
258 0.51
259 0.49
260 0.5
261 0.45
262 0.39
263 0.43
264 0.44
265 0.43
266 0.43
267 0.41
268 0.38
269 0.4
270 0.39
271 0.35
272 0.34
273 0.33
274 0.31
275 0.33
276 0.35
277 0.38
278 0.41
279 0.4
280 0.39
281 0.39
282 0.39
283 0.37
284 0.35
285 0.32
286 0.27
287 0.26
288 0.24
289 0.2
290 0.22
291 0.19