Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J1B258

Protein Details
Accession A0A0J1B258    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-40AAPAKTPTTKRTQKTRVRRKARRRDGADSEEEHydrophilic
133-159ETAAARREKLKAKRKAKKEAERASKSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-32KRTQKTRVRRKARRR
101-160ARRGIAVRGRGRGGKVAREPREMTEEQKKREEETAAARREKLKAKRKAKKEAERASKSAA
279-303RGGMRGMPRGGFRGVPPPRGRGRGR
400-415RGRGRGRGRGGFMRGG
Subcellular Location(s) mito 18, nucl 6.5, cyto_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MTNVTDPTAAPAKTPTTKRTQKTRVRRKARRRDGADSEEEGGSASDASDASDSKATPATAAKPKLTPLFPDENSTTPAAWADMTDKGEEITFDDFNRGDPARRGIAVRGRGRGGKVAREPREMTEEQKKREEETAAARREKLKAKRKAKKEAERASKSAAKADPGAATTAVPAAAPATVNAESSLAASTSALKLDDPPAESTAPAASAPSVSPADGTPRPGIPPRTNRNAYTQRVAEDPKFTPRVGNFWMHDQRHYEAGSVGEGSFAGLRGMSDFWRGRGGMRGMPRGGFRGVPPPRGRGRGRGFAFVPPVRQMSPAPSPSSASTSASGPGPAPYRGKAVPPATASSSGHRMAEMDKLEMELQNKARHNRAGANEGKWGHEGFEEIAAHEDPMRHNHMIRGRGRGRGRGGFMRGGPPLRPMPPGVAHLPTPEASPDRSASKTEPRTEAPTTTGPSSETLLEDSGAVTVKLPGGAKSVDVDRPPSQPTEAPEQPKSPFPPAFTPSNPSPVPYVASDSGSISSGYVPTGPMMPMHTGEYYNHAPPFRAPGPGFYPPYRPQSFTPEPHFVPGQQPRGSFSGPAPFYPGAPAHARPGSPLNPYQAPYGQAAYFVPARPTQKVSIRSPRGSTDEIKSPATEPEAVGTPEFVHAQPFYQQQGYNPYANGEVYYQGYWPGYEGGSEYGYAEQYHGHPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.42
3 0.46
4 0.56
5 0.63
6 0.71
7 0.75
8 0.78
9 0.84
10 0.89
11 0.9
12 0.92
13 0.94
14 0.95
15 0.96
16 0.96
17 0.96
18 0.92
19 0.9
20 0.88
21 0.85
22 0.8
23 0.71
24 0.63
25 0.52
26 0.44
27 0.35
28 0.25
29 0.18
30 0.12
31 0.08
32 0.06
33 0.06
34 0.07
35 0.08
36 0.08
37 0.1
38 0.13
39 0.13
40 0.14
41 0.17
42 0.16
43 0.16
44 0.19
45 0.25
46 0.31
47 0.35
48 0.36
49 0.35
50 0.4
51 0.45
52 0.43
53 0.4
54 0.38
55 0.43
56 0.41
57 0.45
58 0.43
59 0.39
60 0.4
61 0.37
62 0.3
63 0.22
64 0.21
65 0.16
66 0.13
67 0.12
68 0.11
69 0.14
70 0.15
71 0.15
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.13
78 0.12
79 0.12
80 0.15
81 0.15
82 0.16
83 0.2
84 0.2
85 0.19
86 0.22
87 0.26
88 0.26
89 0.28
90 0.29
91 0.3
92 0.36
93 0.42
94 0.44
95 0.43
96 0.43
97 0.45
98 0.45
99 0.46
100 0.42
101 0.41
102 0.45
103 0.51
104 0.53
105 0.56
106 0.57
107 0.52
108 0.56
109 0.49
110 0.46
111 0.47
112 0.5
113 0.48
114 0.54
115 0.52
116 0.47
117 0.5
118 0.46
119 0.39
120 0.43
121 0.47
122 0.46
123 0.47
124 0.47
125 0.45
126 0.49
127 0.54
128 0.54
129 0.55
130 0.6
131 0.68
132 0.75
133 0.81
134 0.87
135 0.88
136 0.89
137 0.89
138 0.89
139 0.89
140 0.86
141 0.79
142 0.74
143 0.69
144 0.59
145 0.54
146 0.45
147 0.36
148 0.31
149 0.31
150 0.25
151 0.21
152 0.21
153 0.15
154 0.14
155 0.12
156 0.1
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.09
181 0.12
182 0.14
183 0.14
184 0.16
185 0.17
186 0.17
187 0.17
188 0.16
189 0.13
190 0.12
191 0.09
192 0.08
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.08
197 0.09
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.14
202 0.15
203 0.18
204 0.17
205 0.17
206 0.2
207 0.24
208 0.3
209 0.32
210 0.41
211 0.45
212 0.53
213 0.56
214 0.55
215 0.6
216 0.63
217 0.58
218 0.54
219 0.49
220 0.41
221 0.4
222 0.41
223 0.34
224 0.29
225 0.27
226 0.28
227 0.29
228 0.28
229 0.28
230 0.26
231 0.29
232 0.27
233 0.31
234 0.25
235 0.31
236 0.39
237 0.36
238 0.38
239 0.36
240 0.34
241 0.32
242 0.31
243 0.23
244 0.16
245 0.15
246 0.14
247 0.11
248 0.1
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.06
260 0.11
261 0.11
262 0.12
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.19
267 0.2
268 0.19
269 0.23
270 0.26
271 0.24
272 0.25
273 0.25
274 0.22
275 0.21
276 0.18
277 0.15
278 0.21
279 0.23
280 0.29
281 0.3
282 0.34
283 0.37
284 0.43
285 0.44
286 0.43
287 0.46
288 0.48
289 0.48
290 0.46
291 0.43
292 0.38
293 0.42
294 0.34
295 0.3
296 0.22
297 0.22
298 0.19
299 0.19
300 0.17
301 0.16
302 0.2
303 0.21
304 0.21
305 0.2
306 0.21
307 0.21
308 0.24
309 0.2
310 0.16
311 0.15
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.12
316 0.09
317 0.1
318 0.11
319 0.12
320 0.13
321 0.12
322 0.15
323 0.16
324 0.16
325 0.2
326 0.2
327 0.21
328 0.21
329 0.21
330 0.2
331 0.21
332 0.21
333 0.17
334 0.19
335 0.17
336 0.15
337 0.14
338 0.13
339 0.12
340 0.15
341 0.14
342 0.11
343 0.1
344 0.11
345 0.11
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.14
350 0.19
351 0.22
352 0.24
353 0.27
354 0.27
355 0.28
356 0.3
357 0.29
358 0.31
359 0.31
360 0.3
361 0.32
362 0.31
363 0.3
364 0.25
365 0.23
366 0.16
367 0.13
368 0.12
369 0.08
370 0.1
371 0.09
372 0.08
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.1
378 0.08
379 0.11
380 0.16
381 0.15
382 0.15
383 0.2
384 0.24
385 0.3
386 0.32
387 0.38
388 0.36
389 0.42
390 0.44
391 0.45
392 0.45
393 0.41
394 0.42
395 0.37
396 0.37
397 0.32
398 0.31
399 0.29
400 0.26
401 0.24
402 0.21
403 0.2
404 0.2
405 0.19
406 0.2
407 0.17
408 0.18
409 0.19
410 0.21
411 0.2
412 0.19
413 0.18
414 0.17
415 0.18
416 0.15
417 0.14
418 0.12
419 0.12
420 0.11
421 0.13
422 0.14
423 0.15
424 0.16
425 0.18
426 0.2
427 0.28
428 0.33
429 0.35
430 0.37
431 0.37
432 0.41
433 0.41
434 0.39
435 0.33
436 0.3
437 0.28
438 0.26
439 0.23
440 0.19
441 0.18
442 0.18
443 0.14
444 0.12
445 0.1
446 0.1
447 0.1
448 0.09
449 0.08
450 0.07
451 0.07
452 0.06
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.08
458 0.08
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.11
463 0.13
464 0.15
465 0.15
466 0.2
467 0.2
468 0.22
469 0.24
470 0.24
471 0.23
472 0.22
473 0.25
474 0.29
475 0.32
476 0.35
477 0.36
478 0.38
479 0.37
480 0.4
481 0.41
482 0.39
483 0.35
484 0.33
485 0.37
486 0.37
487 0.41
488 0.37
489 0.39
490 0.35
491 0.39
492 0.36
493 0.31
494 0.29
495 0.25
496 0.25
497 0.2
498 0.23
499 0.18
500 0.19
501 0.18
502 0.17
503 0.17
504 0.15
505 0.14
506 0.1
507 0.09
508 0.08
509 0.08
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.09
517 0.11
518 0.11
519 0.13
520 0.14
521 0.13
522 0.14
523 0.19
524 0.2
525 0.22
526 0.24
527 0.23
528 0.22
529 0.22
530 0.3
531 0.25
532 0.29
533 0.26
534 0.28
535 0.33
536 0.39
537 0.43
538 0.37
539 0.42
540 0.41
541 0.49
542 0.47
543 0.45
544 0.41
545 0.46
546 0.52
547 0.51
548 0.53
549 0.51
550 0.49
551 0.49
552 0.48
553 0.39
554 0.41
555 0.42
556 0.43
557 0.4
558 0.39
559 0.39
560 0.42
561 0.41
562 0.34
563 0.28
564 0.3
565 0.27
566 0.27
567 0.29
568 0.25
569 0.25
570 0.27
571 0.25
572 0.2
573 0.22
574 0.23
575 0.24
576 0.26
577 0.26
578 0.25
579 0.31
580 0.3
581 0.32
582 0.34
583 0.33
584 0.34
585 0.36
586 0.37
587 0.33
588 0.32
589 0.29
590 0.28
591 0.23
592 0.2
593 0.19
594 0.19
595 0.19
596 0.18
597 0.19
598 0.21
599 0.25
600 0.27
601 0.31
602 0.34
603 0.4
604 0.46
605 0.52
606 0.58
607 0.63
608 0.64
609 0.63
610 0.62
611 0.6
612 0.57
613 0.53
614 0.47
615 0.47
616 0.46
617 0.44
618 0.4
619 0.35
620 0.34
621 0.33
622 0.29
623 0.2
624 0.2
625 0.22
626 0.21
627 0.2
628 0.18
629 0.15
630 0.16
631 0.17
632 0.14
633 0.14
634 0.14
635 0.15
636 0.19
637 0.22
638 0.24
639 0.26
640 0.27
641 0.27
642 0.35
643 0.38
644 0.36
645 0.33
646 0.3
647 0.28
648 0.27
649 0.25
650 0.18
651 0.16
652 0.16
653 0.16
654 0.15
655 0.15
656 0.16
657 0.14
658 0.14
659 0.14
660 0.12
661 0.11
662 0.12
663 0.13
664 0.13
665 0.13
666 0.13
667 0.12
668 0.13
669 0.13
670 0.12
671 0.13