Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J0XCN9

Protein Details
Accession A0A0J0XCN9    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-123GVGAGPSDKEKRRKRQAERAAAEKDBasic
155-174AAALKKKKRRLLDGLPHETFHydrophilic
221-240VKEARERRRKDMTRPPRGVRBasic
933-962RAEVLRLKKNQVRRQQRKKYQGKGELPEVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-116SDKEKRRKRQAE
159-164KKKKRR
228-229RR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
IPR041670  Znf-CCHC_6  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF12157  DUF3591  
PF15288  zf-CCHC_6  
Amino Acid Sequences MDVDEDDTLGSAFGLGSVLAEAGVDEAALNAFLERTEGKNSRALETAIQQGDEKYMDDVSDDELPDESAEDRAARAREQAAIRANEERWARRAAAELAGVGAGPSDKEKRRKRQAERAAAEKDVVRAVWPDFRQGTVLKMSEVFYETPAARGAMAAALKKKKRRLLDGLPHETFMVTVEPQKERPPTMSFLLPNLPPLPVHNPSEASYLTPVGQLFDQQWVKEARERRRKDMTRPPRGVRFDDNVEILEEKPLDLADWERDIVMCGLDLAMTAHDPLQLRNEHLEKSDWIADVIWDARRASPDLIDVHSDDEETVAIREKETPMTAAQSKLDPFNLSNDHLYEHNRASRFRIRQTFGAIEVFHSQPAKILQMPYYKTTLDKNEARMWHRTPLQFPTGVWNSFSKLKANHNTQRKSRLMADPSERFKTTKDLSLTEKGPFVLLEFSEEYPPIMSGYGMGTTIVNYYRKKDDKDDTVPKLDLGQPSILNVGDTEPFLLSYVDPGKVTQIIHNNLIRAPIWKHTHESTDFLVIRQTINNHTTYHIREIKDLFVVGQTVPHESEVPGPHARKNTNTAKLRLMIFAWILIKKNKEPQHQRVKLSRLQKYFPDQTELQMRQRLKIKGNEFLEYDKEAGFHSGFWKLNPNYDFPTERKEVEALVTPEMASLYEAMQVGAQHLRDAGYTKTAEGNADDEFGDGTEAGLDVEQRLAVWSTTLNYKKAEAQKAWLQVHGDGDPTGRGEGFSFLKTNMKNYFLRKGETEEGRRLEAEAKAGGGPVKISNAEQNRIYEEEKRKVWDLQWKALSNPVPPALDLDLTAETVEPNQAMGPRFPKAERAFSRSGSTFESPMDDPRSPSAFSFDGESQFTGNDRGAHKVLRIKRIVRGKQTVEIVRDQAVIQSYLRRVEERKLAQYTDELEHLAPTGNAEEDELKIQAIRAEVLRLKKNQVRRQQRKKYQGKGELPEVAEGEGKRRCGACGAYGHTKANRNCPKFNAKQADSSGTTPVAGPTPYGYGAQMDAYAPATPDAPSPAPMKIKLALGGPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.04
3 0.04
4 0.05
5 0.05
6 0.04
7 0.04
8 0.04
9 0.04
10 0.04
11 0.04
12 0.04
13 0.04
14 0.04
15 0.05
16 0.05
17 0.04
18 0.05
19 0.05
20 0.07
21 0.09
22 0.12
23 0.2
24 0.23
25 0.26
26 0.31
27 0.33
28 0.34
29 0.35
30 0.34
31 0.29
32 0.3
33 0.35
34 0.31
35 0.3
36 0.28
37 0.25
38 0.26
39 0.23
40 0.2
41 0.14
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.15
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.14
52 0.13
53 0.14
54 0.11
55 0.09
56 0.1
57 0.09
58 0.1
59 0.15
60 0.17
61 0.17
62 0.2
63 0.21
64 0.26
65 0.28
66 0.33
67 0.36
68 0.37
69 0.38
70 0.4
71 0.38
72 0.38
73 0.41
74 0.39
75 0.35
76 0.36
77 0.34
78 0.31
79 0.35
80 0.31
81 0.29
82 0.26
83 0.23
84 0.19
85 0.18
86 0.16
87 0.11
88 0.08
89 0.05
90 0.05
91 0.09
92 0.16
93 0.24
94 0.34
95 0.45
96 0.56
97 0.67
98 0.77
99 0.84
100 0.87
101 0.91
102 0.92
103 0.87
104 0.85
105 0.77
106 0.68
107 0.59
108 0.5
109 0.4
110 0.3
111 0.25
112 0.17
113 0.16
114 0.17
115 0.22
116 0.21
117 0.26
118 0.26
119 0.26
120 0.28
121 0.26
122 0.28
123 0.26
124 0.26
125 0.21
126 0.21
127 0.21
128 0.2
129 0.22
130 0.19
131 0.15
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.17
136 0.15
137 0.13
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.12
142 0.14
143 0.2
144 0.29
145 0.35
146 0.43
147 0.51
148 0.55
149 0.61
150 0.67
151 0.69
152 0.72
153 0.76
154 0.79
155 0.8
156 0.74
157 0.66
158 0.58
159 0.48
160 0.36
161 0.27
162 0.18
163 0.1
164 0.13
165 0.17
166 0.2
167 0.22
168 0.28
169 0.3
170 0.3
171 0.34
172 0.33
173 0.33
174 0.34
175 0.38
176 0.33
177 0.32
178 0.34
179 0.3
180 0.29
181 0.26
182 0.23
183 0.18
184 0.2
185 0.24
186 0.24
187 0.26
188 0.26
189 0.27
190 0.28
191 0.31
192 0.28
193 0.23
194 0.2
195 0.18
196 0.16
197 0.16
198 0.14
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.11
203 0.18
204 0.19
205 0.17
206 0.21
207 0.23
208 0.25
209 0.29
210 0.37
211 0.4
212 0.49
213 0.54
214 0.58
215 0.66
216 0.7
217 0.74
218 0.78
219 0.78
220 0.78
221 0.81
222 0.8
223 0.78
224 0.77
225 0.72
226 0.66
227 0.61
228 0.54
229 0.49
230 0.43
231 0.35
232 0.31
233 0.27
234 0.21
235 0.18
236 0.13
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.11
250 0.09
251 0.07
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.14
265 0.15
266 0.17
267 0.22
268 0.24
269 0.22
270 0.23
271 0.25
272 0.2
273 0.23
274 0.24
275 0.19
276 0.17
277 0.16
278 0.15
279 0.14
280 0.15
281 0.13
282 0.11
283 0.12
284 0.12
285 0.14
286 0.16
287 0.15
288 0.14
289 0.16
290 0.16
291 0.17
292 0.17
293 0.16
294 0.16
295 0.15
296 0.14
297 0.11
298 0.09
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.11
306 0.12
307 0.14
308 0.14
309 0.15
310 0.12
311 0.17
312 0.18
313 0.18
314 0.17
315 0.18
316 0.19
317 0.19
318 0.19
319 0.16
320 0.15
321 0.18
322 0.2
323 0.19
324 0.19
325 0.18
326 0.18
327 0.18
328 0.21
329 0.2
330 0.2
331 0.23
332 0.24
333 0.25
334 0.3
335 0.37
336 0.39
337 0.43
338 0.48
339 0.47
340 0.47
341 0.51
342 0.46
343 0.39
344 0.36
345 0.28
346 0.22
347 0.22
348 0.2
349 0.16
350 0.15
351 0.13
352 0.12
353 0.13
354 0.13
355 0.12
356 0.13
357 0.16
358 0.21
359 0.24
360 0.24
361 0.25
362 0.23
363 0.23
364 0.26
365 0.26
366 0.28
367 0.29
368 0.31
369 0.35
370 0.39
371 0.4
372 0.42
373 0.4
374 0.39
375 0.41
376 0.39
377 0.37
378 0.36
379 0.36
380 0.31
381 0.29
382 0.31
383 0.29
384 0.27
385 0.25
386 0.22
387 0.21
388 0.24
389 0.25
390 0.21
391 0.21
392 0.28
393 0.35
394 0.43
395 0.48
396 0.54
397 0.6
398 0.61
399 0.67
400 0.6
401 0.56
402 0.52
403 0.51
404 0.45
405 0.44
406 0.46
407 0.43
408 0.46
409 0.46
410 0.41
411 0.35
412 0.32
413 0.34
414 0.29
415 0.29
416 0.27
417 0.26
418 0.3
419 0.34
420 0.34
421 0.29
422 0.28
423 0.22
424 0.2
425 0.17
426 0.13
427 0.09
428 0.07
429 0.09
430 0.1
431 0.1
432 0.11
433 0.11
434 0.1
435 0.09
436 0.09
437 0.07
438 0.05
439 0.05
440 0.04
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.07
449 0.11
450 0.11
451 0.14
452 0.21
453 0.24
454 0.27
455 0.32
456 0.35
457 0.39
458 0.48
459 0.53
460 0.5
461 0.5
462 0.47
463 0.41
464 0.38
465 0.33
466 0.25
467 0.18
468 0.16
469 0.13
470 0.13
471 0.14
472 0.12
473 0.08
474 0.08
475 0.07
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.05
481 0.06
482 0.06
483 0.05
484 0.06
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.09
490 0.1
491 0.11
492 0.12
493 0.17
494 0.18
495 0.22
496 0.23
497 0.22
498 0.21
499 0.22
500 0.18
501 0.15
502 0.14
503 0.17
504 0.19
505 0.2
506 0.23
507 0.23
508 0.27
509 0.25
510 0.27
511 0.21
512 0.23
513 0.22
514 0.19
515 0.19
516 0.16
517 0.15
518 0.14
519 0.14
520 0.12
521 0.13
522 0.15
523 0.14
524 0.15
525 0.18
526 0.19
527 0.24
528 0.26
529 0.25
530 0.26
531 0.27
532 0.26
533 0.24
534 0.22
535 0.15
536 0.1
537 0.1
538 0.07
539 0.08
540 0.07
541 0.08
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.12
547 0.12
548 0.15
549 0.18
550 0.19
551 0.22
552 0.26
553 0.27
554 0.25
555 0.31
556 0.35
557 0.4
558 0.44
559 0.44
560 0.42
561 0.44
562 0.42
563 0.36
564 0.28
565 0.2
566 0.15
567 0.14
568 0.13
569 0.11
570 0.12
571 0.14
572 0.16
573 0.16
574 0.25
575 0.3
576 0.38
577 0.45
578 0.53
579 0.62
580 0.67
581 0.71
582 0.69
583 0.68
584 0.65
585 0.65
586 0.62
587 0.54
588 0.5
589 0.48
590 0.49
591 0.49
592 0.44
593 0.41
594 0.34
595 0.33
596 0.39
597 0.38
598 0.34
599 0.34
600 0.33
601 0.32
602 0.38
603 0.4
604 0.37
605 0.42
606 0.41
607 0.43
608 0.45
609 0.43
610 0.37
611 0.34
612 0.31
613 0.25
614 0.23
615 0.15
616 0.13
617 0.11
618 0.12
619 0.1
620 0.09
621 0.09
622 0.14
623 0.14
624 0.14
625 0.22
626 0.21
627 0.27
628 0.27
629 0.28
630 0.26
631 0.29
632 0.32
633 0.25
634 0.31
635 0.27
636 0.26
637 0.25
638 0.22
639 0.19
640 0.18
641 0.21
642 0.17
643 0.15
644 0.15
645 0.13
646 0.13
647 0.13
648 0.11
649 0.06
650 0.05
651 0.05
652 0.06
653 0.07
654 0.07
655 0.07
656 0.07
657 0.08
658 0.1
659 0.09
660 0.07
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.1
665 0.09
666 0.11
667 0.11
668 0.12
669 0.13
670 0.14
671 0.14
672 0.13
673 0.13
674 0.1
675 0.11
676 0.1
677 0.08
678 0.08
679 0.07
680 0.07
681 0.05
682 0.05
683 0.04
684 0.04
685 0.03
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.05
696 0.06
697 0.07
698 0.14
699 0.17
700 0.18
701 0.19
702 0.2
703 0.27
704 0.34
705 0.39
706 0.33
707 0.36
708 0.39
709 0.47
710 0.46
711 0.41
712 0.35
713 0.29
714 0.31
715 0.26
716 0.21
717 0.13
718 0.12
719 0.11
720 0.11
721 0.1
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.1
726 0.11
727 0.12
728 0.12
729 0.13
730 0.19
731 0.19
732 0.23
733 0.23
734 0.26
735 0.29
736 0.32
737 0.4
738 0.37
739 0.39
740 0.36
741 0.39
742 0.41
743 0.44
744 0.45
745 0.42
746 0.42
747 0.41
748 0.39
749 0.35
750 0.31
751 0.25
752 0.22
753 0.16
754 0.14
755 0.13
756 0.14
757 0.13
758 0.1
759 0.1
760 0.08
761 0.1
762 0.1
763 0.1
764 0.17
765 0.2
766 0.23
767 0.24
768 0.25
769 0.26
770 0.28
771 0.3
772 0.31
773 0.35
774 0.38
775 0.39
776 0.41
777 0.41
778 0.41
779 0.44
780 0.45
781 0.43
782 0.44
783 0.49
784 0.47
785 0.45
786 0.48
787 0.45
788 0.37
789 0.35
790 0.3
791 0.23
792 0.22
793 0.24
794 0.19
795 0.17
796 0.16
797 0.14
798 0.12
799 0.11
800 0.11
801 0.09
802 0.07
803 0.08
804 0.08
805 0.06
806 0.06
807 0.07
808 0.1
809 0.11
810 0.15
811 0.17
812 0.19
813 0.22
814 0.22
815 0.3
816 0.31
817 0.4
818 0.42
819 0.46
820 0.47
821 0.47
822 0.52
823 0.44
824 0.42
825 0.37
826 0.34
827 0.27
828 0.24
829 0.26
830 0.21
831 0.25
832 0.29
833 0.24
834 0.24
835 0.28
836 0.3
837 0.27
838 0.26
839 0.26
840 0.21
841 0.21
842 0.24
843 0.21
844 0.21
845 0.21
846 0.21
847 0.17
848 0.16
849 0.17
850 0.14
851 0.13
852 0.16
853 0.16
854 0.2
855 0.22
856 0.23
857 0.26
858 0.32
859 0.38
860 0.42
861 0.48
862 0.46
863 0.52
864 0.62
865 0.66
866 0.66
867 0.68
868 0.63
869 0.63
870 0.67
871 0.64
872 0.57
873 0.52
874 0.45
875 0.38
876 0.35
877 0.29
878 0.24
879 0.21
880 0.18
881 0.16
882 0.19
883 0.2
884 0.23
885 0.24
886 0.25
887 0.26
888 0.31
889 0.4
890 0.41
891 0.46
892 0.46
893 0.46
894 0.43
895 0.44
896 0.42
897 0.34
898 0.29
899 0.23
900 0.19
901 0.18
902 0.17
903 0.15
904 0.11
905 0.09
906 0.09
907 0.09
908 0.09
909 0.1
910 0.1
911 0.11
912 0.13
913 0.12
914 0.11
915 0.11
916 0.11
917 0.12
918 0.11
919 0.12
920 0.11
921 0.17
922 0.21
923 0.28
924 0.34
925 0.36
926 0.43
927 0.48
928 0.57
929 0.61
930 0.67
931 0.72
932 0.77
933 0.84
934 0.88
935 0.92
936 0.93
937 0.94
938 0.93
939 0.92
940 0.92
941 0.89
942 0.85
943 0.8
944 0.75
945 0.66
946 0.58
947 0.47
948 0.38
949 0.32
950 0.26
951 0.26
952 0.23
953 0.23
954 0.25
955 0.25
956 0.25
957 0.25
958 0.28
959 0.27
960 0.31
961 0.36
962 0.41
963 0.44
964 0.48
965 0.49
966 0.55
967 0.53
968 0.58
969 0.62
970 0.6
971 0.62
972 0.65
973 0.7
974 0.69
975 0.75
976 0.75
977 0.67
978 0.68
979 0.67
980 0.66
981 0.59
982 0.53
983 0.46
984 0.36
985 0.33
986 0.26
987 0.23
988 0.19
989 0.15
990 0.14
991 0.13
992 0.15
993 0.16
994 0.16
995 0.15
996 0.14
997 0.14
998 0.14
999 0.13
1000 0.11
1001 0.11
1002 0.11
1003 0.11
1004 0.11
1005 0.1
1006 0.11
1007 0.1
1008 0.12
1009 0.16
1010 0.16
1011 0.19
1012 0.2
1013 0.25
1014 0.3
1015 0.31
1016 0.33
1017 0.31
1018 0.32
1019 0.31