Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J0XCD0

Protein Details
Accession A0A0J0XCD0    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-37MGKQPFKQSKGKRSAPYAKSAKPQRPKGPSKPTVDVQHydrophilic
59-94APAVKTKTKAKAKAEPEKPKPKPKGKGKAKAPSPSPBasic
444-465EGGARRKSKKVVKTAKAEKSGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-30QSKGKRSAPYAKSAKPQRPKGPS
53-90KAKVVSAPAVKTKTKAKAKAEPEKPKPKPKGKGKAKAP
447-460ARRKSKKVVKTAKA
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 9.5, cyto_mito 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MGKQPFKQSKGKRSAPYAKSAKPQRPKGPSKPTVDVQYDGEVSAATKQVLEKKAKVVSAPAVKTKTKAKAKAEPEKPKPKPKGKGKAKAPSPSPSPTSEPDAPTFKIIAGTYEKLLYGLEGKYVDGAIALEPLFIFPAHLACVKAVAANQTGKWLATGSEDEFIKVWDLRRRKEVGSLSQHTGSITSLTFPSPSHLMATSADATISLFRTSDWAVLKTLKGHSGRVNHVDVHPTGKVALSVGKDNTLKMWDLMRGRGAASLALGSEAELVKFSPRGTHFAVLFPRKIEIYSLTLKKLATLESKVRFNHLLFTELPGQDAELLCVGTEKGVVEVYTVEMPDSDEMSEENEDEDEDEDEEKAEHGPKAEVDRIATLVGHTNRIKAVSALEFAAPSGPTVLITTASSDGFINVYDLGAIPTAESEEQKPVASYDTKGSRLTCVEIAEGGARRKSKKVVKTAKAEKSGARFDLEESEVSDEDDEDADMFEGASDEELEGVDVEFEDEEEEEEEEEEEEEEEEEEGEYED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.79
3 0.8
4 0.77
5 0.73
6 0.74
7 0.76
8 0.76
9 0.76
10 0.81
11 0.81
12 0.83
13 0.87
14 0.87
15 0.89
16 0.87
17 0.85
18 0.82
19 0.77
20 0.75
21 0.68
22 0.6
23 0.51
24 0.46
25 0.39
26 0.32
27 0.26
28 0.18
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.1
33 0.1
34 0.14
35 0.21
36 0.29
37 0.34
38 0.35
39 0.4
40 0.45
41 0.45
42 0.43
43 0.39
44 0.4
45 0.43
46 0.44
47 0.44
48 0.45
49 0.44
50 0.47
51 0.51
52 0.53
53 0.53
54 0.58
55 0.59
56 0.63
57 0.72
58 0.79
59 0.81
60 0.82
61 0.83
62 0.86
63 0.87
64 0.88
65 0.88
66 0.88
67 0.88
68 0.88
69 0.89
70 0.88
71 0.9
72 0.9
73 0.9
74 0.88
75 0.86
76 0.79
77 0.75
78 0.69
79 0.64
80 0.57
81 0.51
82 0.48
83 0.43
84 0.45
85 0.43
86 0.41
87 0.4
88 0.41
89 0.37
90 0.35
91 0.32
92 0.25
93 0.23
94 0.19
95 0.19
96 0.19
97 0.2
98 0.19
99 0.19
100 0.18
101 0.16
102 0.16
103 0.13
104 0.11
105 0.1
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.07
113 0.07
114 0.05
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.16
138 0.16
139 0.15
140 0.15
141 0.12
142 0.1
143 0.1
144 0.12
145 0.11
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.14
151 0.13
152 0.13
153 0.16
154 0.2
155 0.26
156 0.29
157 0.35
158 0.39
159 0.38
160 0.44
161 0.45
162 0.46
163 0.49
164 0.51
165 0.47
166 0.45
167 0.44
168 0.36
169 0.31
170 0.23
171 0.15
172 0.1
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.08
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.1
183 0.11
184 0.11
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.08
197 0.08
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.14
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.17
206 0.19
207 0.19
208 0.2
209 0.24
210 0.28
211 0.31
212 0.32
213 0.32
214 0.28
215 0.28
216 0.28
217 0.24
218 0.21
219 0.18
220 0.14
221 0.12
222 0.11
223 0.1
224 0.08
225 0.1
226 0.08
227 0.1
228 0.11
229 0.14
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.12
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.08
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.09
261 0.11
262 0.15
263 0.17
264 0.2
265 0.2
266 0.22
267 0.28
268 0.26
269 0.26
270 0.22
271 0.21
272 0.18
273 0.18
274 0.15
275 0.12
276 0.13
277 0.19
278 0.2
279 0.2
280 0.22
281 0.21
282 0.22
283 0.2
284 0.19
285 0.15
286 0.17
287 0.23
288 0.25
289 0.3
290 0.29
291 0.31
292 0.31
293 0.28
294 0.3
295 0.24
296 0.23
297 0.19
298 0.22
299 0.25
300 0.22
301 0.22
302 0.16
303 0.16
304 0.14
305 0.14
306 0.11
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.04
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.06
329 0.05
330 0.06
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.07
338 0.08
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.1
350 0.11
351 0.12
352 0.17
353 0.19
354 0.19
355 0.18
356 0.18
357 0.17
358 0.17
359 0.15
360 0.11
361 0.15
362 0.15
363 0.2
364 0.19
365 0.2
366 0.21
367 0.22
368 0.22
369 0.15
370 0.17
371 0.13
372 0.14
373 0.14
374 0.13
375 0.12
376 0.12
377 0.12
378 0.1
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.06
383 0.07
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.1
391 0.09
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.07
407 0.08
408 0.1
409 0.13
410 0.14
411 0.14
412 0.15
413 0.14
414 0.17
415 0.18
416 0.18
417 0.22
418 0.26
419 0.28
420 0.3
421 0.31
422 0.3
423 0.3
424 0.32
425 0.26
426 0.22
427 0.2
428 0.18
429 0.18
430 0.19
431 0.2
432 0.2
433 0.22
434 0.25
435 0.28
436 0.32
437 0.4
438 0.45
439 0.5
440 0.58
441 0.65
442 0.7
443 0.77
444 0.83
445 0.84
446 0.82
447 0.76
448 0.7
449 0.66
450 0.63
451 0.54
452 0.46
453 0.38
454 0.32
455 0.34
456 0.31
457 0.25
458 0.2
459 0.22
460 0.19
461 0.19
462 0.18
463 0.13
464 0.12
465 0.12
466 0.1
467 0.07
468 0.08
469 0.07
470 0.07
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.05
475 0.06
476 0.06
477 0.05
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.05
484 0.05
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.07
491 0.08
492 0.09
493 0.09
494 0.09
495 0.1
496 0.09
497 0.1
498 0.09
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.08